More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2033 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  89.4 
 
 		 436 aa  785    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  100 
 
 		 434 aa  861    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  71.98 
 
 		 436 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  71.98 
 
 		 436 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  71.01 
 
 		 436 aa  593  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  70.39 
 
 		 436 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  70.39 
 
 		 436 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  70.39 
 
 		 436 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4390  major facilitator transporter  69.66 
 
 		 436 aa  580  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1307  major facilitator family transporter  71.84 
 
 		 437 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.702643  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1154  major facilitator transporter  71.84 
 
 		 437 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215313  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1146  major facilitator transporter  71.71 
 
 		 437 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2216  major facilitator family transporter  71.71 
 
 		 437 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2535  major facilitator family transporter  71.71 
 
 		 437 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.805911  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2079  major facilitator family transporter  71.71 
 
 		 437 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.068435  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0701  major facilitator family transporter  71.71 
 
 		 437 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  67.14 
 
 		 437 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  66.9 
 
 		 437 aa  560  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1770  major facilitator family transporter  68.09 
 
 		 457 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1162  major facilitator family transporter  68.09 
 
 		 439 aa  555  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12498  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1100  major facilitator family transporter  67.85 
 
 		 444 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341901  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0253  major facilitator family transporter  68.09 
 
 		 444 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0098  major facilitator family transporter  67.85 
 
 		 457 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.381076  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1267  major facilitator family transporter  67.85 
 
 		 439 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0326  major facilitator family transporter  67.85 
 
 		 457 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544768  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1681  major facilitator transporter  68.09 
 
 		 439 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0114815  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2645  major facilitator superfamily permease  64.9 
 
 		 443 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142533  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2262  major facilitator family transporter  64.9 
 
 		 443 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445444  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2701  major facilitator family transporter  64.9 
 
 		 443 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1753  major facilitator family transporter  64.9 
 
 		 443 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2779  major facilitator family transporter  64.9 
 
 		 443 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1534  major facilitator family transporter  64.9 
 
 		 443 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.348841  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3057  major facilitator family transporter  64.9 
 
 		 443 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.758675  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1835  major facilitator family transporter  64.03 
 
 		 443 aa  523  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4983  major facilitator transporter  58.19 
 
 		 441 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0241  major facilitator family transporter  60.58 
 
 		 524 aa  499  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3082  major facilitator transporter  58.43 
 
 		 441 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5285  major facilitator transporter  58.43 
 
 		 441 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0365  major facilitator transporter  58.19 
 
 		 441 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5174  major facilitator transporter  58.43 
 
 		 441 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2147  major facilitator superfamily MFS_1  59.29 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426847  normal  0.887871 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4645  major facilitator transporter  58.43 
 
 		 441 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2985  major facilitator family transporter  60.77 
 
 		 444 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.464085  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  60.77 
 
 		 444 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  60.77 
 
 		 444 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  60.77 
 
 		 444 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  60.77 
 
 		 444 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  60.77 
 
 		 444 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  60.77 
 
 		 444 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3435  major facilitator transporter  58.19 
 
 		 446 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0701144  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  60.52 
 
 		 439 aa  488  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  58.55 
 
 		 433 aa  484  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  51.4 
 
 		 427 aa  403  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 432 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  50.58 
 
 		 439 aa  388  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  47.7 
 
 		 433 aa  379  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17780  major facilitator transporter  48.09 
 
 		 469 aa  346  5e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1540  major facilitator superfamily MFS_1  45.96 
 
 		 468 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0867894 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1545  MFS family transporter  47.85 
 
 		 470 aa  342  7e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  45.59 
 
 		 441 aa  338  9e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1113  major facilitator transporter  45.97 
 
 		 468 aa  338  9e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5467  major facilitator transporter  45.43 
 
 		 471 aa  334  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2068  major facilitator transporter  44.14 
 
 		 474 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.680279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2195  major facilitator transporter  44.65 
 
 		 481 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  46.19 
 
 		 439 aa  327  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2176  major facilitator transporter  44.37 
 
 		 470 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.96 
 
 		 437 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5919  major facilitator transporter  44.37 
 
 		 470 aa  325  9e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2158  major facilitator transporter  44.37 
 
 		 470 aa  325  9e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  44.13 
 
 		 450 aa  321  9.999999999999999e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  43.44 
 
 		 468 aa  320  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  42.79 
 
 		 437 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  45.67 
 
 		 442 aa  318  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  44.81 
 
 		 439 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  44.81 
 
 		 439 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  44.81 
 
 		 439 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  42.08 
 
 		 440 aa  317  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  46.06 
 
 		 439 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  47.04 
 
 		 439 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  45.36 
 
 		 437 aa  316  6e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  44.81 
 
 		 439 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  44.01 
 
 		 438 aa  311  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 441 aa  308  9e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4036  major facilitator superfamily MFS_1  41.82 
 
 		 437 aa  307  2.0000000000000002e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.16141  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  43.11 
 
 		 457 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  43.91 
 
 		 445 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  43.11 
 
 		 457 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  43.11 
 
 		 457 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  45.29 
 
 		 461 aa  305  9.000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  44.74 
 
 		 450 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  42.52 
 
 		 446 aa  302  6.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  45.79 
 
 		 461 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  39.86 
 
 		 430 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  42.32 
 
 		 442 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  42.82 
 
 		 430 aa  300  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 		 446 aa  300  4e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  42.79 
 
 		 442 aa  299  6e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  44.25 
 
 		 432 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  40.09 
 
 		 438 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  44.25 
 
 		 432 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>