More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3906 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  79.04 
 
 		 441 aa  636    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  100 
 
 		 432 aa  831    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  100 
 
 		 432 aa  831    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 432 aa  831    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  48.77 
 
 		 440 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  47.96 
 
 		 450 aa  363  3e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  48.62 
 
 		 437 aa  354  2e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  44.55 
 
 		 437 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  46.67 
 
 		 430 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.38 
 
 		 437 aa  343  5e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 439 aa  341  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  48.45 
 
 		 461 aa  341  2e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  43.91 
 
 		 468 aa  335  7e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  45.71 
 
 		 445 aa  334  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  45.1 
 
 		 442 aa  334  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  45.43 
 
 		 446 aa  332  9e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  45.09 
 
 		 446 aa  330  4e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 439 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  45.36 
 
 		 447 aa  329  7e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  42.04 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  42.59 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  42.04 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  42.04 
 
 		 439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  46.1 
 
 		 430 aa  328  2.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  44.15 
 
 		 456 aa  327  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170297  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  44.92 
 
 		 433 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  47.63 
 
 		 427 aa  326  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  43.24 
 
 		 439 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  43.1 
 
 		 439 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  42.66 
 
 		 430 aa  324  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  45.39 
 
 		 450 aa  324  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  45.08 
 
 		 442 aa  322  7e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  46.38 
 
 		 439 aa  322  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  47.01 
 
 		 437 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  41.59 
 
 		 439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  46.75 
 
 		 437 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  43.32 
 
 		 439 aa  320  3e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  44.34 
 
 		 433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  47.62 
 
 		 452 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  41.87 
 
 		 435 aa  319  7e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  41.87 
 
 		 435 aa  319  7e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  41.87 
 
 		 435 aa  319  7e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2302  General substrate transporter  43.31 
 
 		 444 aa  318  1e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000263865 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5092  major facilitator superfamily MFS_1  46.6 
 
 		 493 aa  317  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  44.96 
 
 		 438 aa  316  4e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  41.9 
 
 		 438 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  47.42 
 
 		 438 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  44.06 
 
 		 441 aa  313  3.9999999999999997e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  42.22 
 
 		 452 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  46.17 
 
 		 437 aa  312  5.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  43.04 
 
 		 439 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1346  major facilitator superfamily MFS_1  42.42 
 
 		 472 aa  312  9e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63119  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  43.37 
 
 		 442 aa  312  9e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4283  major facilitator transporter  45.58 
 
 		 460 aa  311  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.445263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  44.58 
 
 		 441 aa  311  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  44.68 
 
 		 451 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1913  General substrate transporter  44.73 
 
 		 463 aa  311  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.168957  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  46.43 
 
 		 442 aa  311  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2262  major facilitator family transporter  43.1 
 
 		 443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445444  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1753  major facilitator family transporter  43.1 
 
 		 443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1534  major facilitator family transporter  43.1 
 
 		 443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.348841  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3057  major facilitator family transporter  43.1 
 
 		 443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.758675  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2779  major facilitator family transporter  42.86 
 
 		 443 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  42.35 
 
 		 457 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  42.35 
 
 		 457 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  42.35 
 
 		 457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.81 
 
 		 438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  41.93 
 
 		 455 aa  307  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2645  major facilitator superfamily permease  42.86 
 
 		 443 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142533  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2568  general substrate transporter  42.34 
 
 		 444 aa  307  3e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  43.16 
 
 		 432 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  41.81 
 
 		 452 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  42.38 
 
 		 466 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2701  major facilitator family transporter  42.86 
 
 		 443 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  43.56 
 
 		 436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  41.77 
 
 		 435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  41.13 
 
 		 452 aa  305  1.0000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18260  arabinose efflux permease family protein  42.86 
 
 		 438 aa  303  3.0000000000000004e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.897354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3351  major facilitator superfamily MFS_1  44.3 
 
 		 444 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0813627  normal  0.0585989 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0117  major facilitator superfamily MFS_1  42.09 
 
 		 444 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02317  transporter transmembrane protein  43.03 
 
 		 409 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.14358 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6220  major facilitator transporter  45.1 
 
 		 434 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  42.13 
 
 		 461 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4279  major facilitator transporter  45.37 
 
 		 435 aa  301  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0810486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  42.37 
 
 		 454 aa  301  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  44.36 
 
 		 445 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  40.63 
 
 		 459 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1438  major facilitator superfamily MFS_1  42.59 
 
 		 458 aa  300  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4964  major facilitator superfamily transporter  44.39 
 
 		 439 aa  299  6e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  42.76 
 
 		 482 aa  299  6e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4875  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 439 aa  299  6e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5243  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 439 aa  298  9e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  43.63 
 
 		 445 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  40.15 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  43.63 
 
 		 445 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  43.77 
 
 		 434 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  42.41 
 
 		 436 aa  298  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  43.63 
 
 		 460 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  43.63 
 
 		 445 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>