More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0699 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0699  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  100 
 
 		 436 aa  860    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351028  hitchhiker  0.00674532 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4378  major facilitator superfamily MFS_1  97.02 
 
 		 436 aa  819    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.940021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6220  major facilitator transporter  85.52 
 
 		 434 aa  728    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2004  major facilitator transporter  74.25 
 
 		 434 aa  617  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.752518 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4527  major facilitator transporter  74.7 
 
 		 434 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  69.48 
 
 		 442 aa  565  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4283  major facilitator transporter  70.99 
 
 		 460 aa  560  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.445263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  68.59 
 
 		 437 aa  555  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4212  major facilitator superfamily MFS_1  66.28 
 
 		 458 aa  520  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  63.42 
 
 		 445 aa  511  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6090  major facilitator transporter  60.76 
 
 		 450 aa  490  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4279  major facilitator transporter  61.58 
 
 		 435 aa  469  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0810486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1782  major facilitator superfamily MFS_1  56.06 
 
 		 457 aa  462  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1438  major facilitator superfamily MFS_1  54.76 
 
 		 458 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 452 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  44.56 
 
 		 439 aa  353  4e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  44.05 
 
 		 439 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  44.05 
 
 		 439 aa  349  5e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  44.05 
 
 		 439 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  44.05 
 
 		 439 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  44.05 
 
 		 439 aa  348  8e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  43.8 
 
 		 439 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  44.57 
 
 		 442 aa  347  3e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  43.71 
 
 		 430 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4875  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 439 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  43.58 
 
 		 450 aa  340  4e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4964  major facilitator superfamily transporter  44.47 
 
 		 439 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5243  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 439 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  42.44 
 
 		 437 aa  338  8e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.16 
 
 		 437 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  43.91 
 
 		 455 aa  335  7.999999999999999e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  43.66 
 
 		 451 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  46 
 
 		 461 aa  329  6e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4108  major facilitator family transporter  43.54 
 
 		 449 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.073539  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  42.86 
 
 		 468 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4135  general substrate transporter  43.3 
 
 		 449 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0140  major facilitator transporter  45.24 
 
 		 439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  44.94 
 
 		 433 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  43.02 
 
 		 440 aa  319  6e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  43.75 
 
 		 435 aa  319  7e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  41.35 
 
 		 465 aa  318  9e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  42.01 
 
 		 435 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  40.19 
 
 		 439 aa  318  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  42.01 
 
 		 435 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  41.19 
 
 		 435 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  41.19 
 
 		 435 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  41.77 
 
 		 435 aa  317  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  41.19 
 
 		 435 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  41.77 
 
 		 435 aa  315  7e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  41.81 
 
 		 435 aa  315  7e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  41.77 
 
 		 434 aa  315  8e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  45.5 
 
 		 437 aa  315  9e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1456  major facilitator superfamily MFS_1  45.48 
 
 		 453 aa  315  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  42.53 
 
 		 439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  39.95 
 
 		 439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  41.52 
 
 		 435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  41.52 
 
 		 435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  43.8 
 
 		 461 aa  312  9e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  43.95 
 
 		 442 aa  311  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 439 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  41.86 
 
 		 441 aa  311  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 439 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 441 aa  308  9e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  40.33 
 
 		 437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  39.95 
 
 		 438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  46.59 
 
 		 455 aa  306  6e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  41.77 
 
 		 461 aa  306  6e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  41.77 
 
 		 461 aa  306  6e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  41.77 
 
 		 461 aa  306  6e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  40.98 
 
 		 438 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  40.98 
 
 		 438 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  40.19 
 
 		 438 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  40.19 
 
 		 438 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  40.98 
 
 		 438 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  40.98 
 
 		 438 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  41.51 
 
 		 431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  40.19 
 
 		 438 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  37.41 
 
 		 450 aa  302  6.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7098  major facilitator transporter  45.87 
 
 		 456 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  41.26 
 
 		 436 aa  302  9e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 441 aa  301  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  42.01 
 
 		 439 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5966  major facilitator transporter  45.14 
 
 		 457 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  40.8 
 
 		 442 aa  300  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  41.13 
 
 		 447 aa  300  5e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  39.71 
 
 		 430 aa  299  7e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.71 
 
 		 438 aa  298  9e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  40.43 
 
 		 439 aa  298  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  39.34 
 
 		 450 aa  297  3e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 436 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 436 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  38.92 
 
 		 465 aa  296  3e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 436 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  39.76 
 
 		 438 aa  296  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  38.86 
 
 		 465 aa  296  6e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  43.34 
 
 		 438 aa  296  7e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  40.93 
 
 		 439 aa  295  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  38.26 
 
 		 484 aa  295  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  42.18 
 
 		 442 aa  294  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  41.92 
 
 		 446 aa  294  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>