More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0015 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 456 aa  897    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170297  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1913  General substrate transporter  70.62 
 
 		 463 aa  592  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.168957  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2302  General substrate transporter  63.57 
 
 		 444 aa  553  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000263865 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2568  general substrate transporter  61.54 
 
 		 444 aa  538  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  58.04 
 
 		 452 aa  494  9.999999999999999e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18260  arabinose efflux permease family protein  56.46 
 
 		 438 aa  473  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.897354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  45.48 
 
 		 430 aa  336  5.999999999999999e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  45.3 
 
 		 441 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  41.26 
 
 		 446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  41.8 
 
 		 440 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  41.57 
 
 		 431 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  41.69 
 
 		 437 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  39.77 
 
 		 461 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  42.69 
 
 		 439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  39.77 
 
 		 461 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  39.77 
 
 		 461 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  44.78 
 
 		 432 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  44.78 
 
 		 432 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  44.78 
 
 		 432 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  38.46 
 
 		 484 aa  296  6e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  39.69 
 
 		 454 aa  295  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  36.68 
 
 		 458 aa  293  6e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  37.47 
 
 		 459 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  37.19 
 
 		 456 aa  290  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  39.37 
 
 		 442 aa  290  5.0000000000000004e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.55 
 
 		 437 aa  289  8e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  40.89 
 
 		 433 aa  288  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  40.65 
 
 		 437 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  39.82 
 
 		 466 aa  285  9e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  40.53 
 
 		 460 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07050  arabinose efflux permease family protein  40.05 
 
 		 429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  38.23 
 
 		 447 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  40.94 
 
 		 450 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  36.52 
 
 		 459 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  36.89 
 
 		 436 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  40.62 
 
 		 439 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1269  general substrate transporter  37.71 
 
 		 470 aa  282  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 		 442 aa  282  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  37.94 
 
 		 450 aa  280  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  36.23 
 
 		 460 aa  280  4e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  36.18 
 
 		 459 aa  280  5e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  39.45 
 
 		 439 aa  279  6e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1848  major facilitator transporter  36.95 
 
 		 447 aa  280  6e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276958 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  36.36 
 
 		 463 aa  279  7e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  38.78 
 
 		 432 aa  279  7e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  37.76 
 
 		 443 aa  279  9e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  39.55 
 
 		 439 aa  278  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  38.39 
 
 		 439 aa  277  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  40.43 
 
 		 439 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 439 aa  276  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  36.88 
 
 		 459 aa  276  6e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  36.47 
 
 		 455 aa  276  6e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  38.69 
 
 		 439 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  38.03 
 
 		 437 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0117  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 		 444 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  37.36 
 
 		 463 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  37.36 
 
 		 463 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  37.36 
 
 		 463 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  38.69 
 
 		 439 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  36.45 
 
 		 441 aa  271  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  37.26 
 
 		 437 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1314  General substrate transporter  37.29 
 
 		 470 aa  271  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012233 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2295  major facilitator superfamily MFS_1  37.39 
 
 		 452 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  38.31 
 
 		 482 aa  270  4e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  35.52 
 
 		 456 aa  269  8e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  38.64 
 
 		 442 aa  269  8e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  38.85 
 
 		 430 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  41.06 
 
 		 438 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  38.39 
 
 		 441 aa  268  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 439 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4675  major facilitator transporter  39.55 
 
 		 628 aa  268  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85896  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  38.64 
 
 		 430 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0644  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  36.88 
 
 		 442 aa  266  5.999999999999999e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0860  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  36.79 
 
 		 441 aa  266  5.999999999999999e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3519  major facilitator superfamily MFS_1  36.62 
 
 		 444 aa  266  7e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  38.9 
 
 		 443 aa  266  8e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  35.99 
 
 		 445 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 439 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  35.7 
 
 		 438 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4745  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.3 
 
 		 440 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  38 
 
 		 445 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  35.91 
 
 		 460 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  36.62 
 
 		 455 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3744  General substrate transporter  38.33 
 
 		 465 aa  264  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3159  general substrate transporter  39.72 
 
 		 428 aa  264  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.761686  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  34.33 
 
 		 435 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 445 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  35.86 
 
 		 445 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  39.35 
 
 		 461 aa  264  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  34.33 
 
 		 435 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 445 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  34.33 
 
 		 435 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11224  integral membrane transport protein  36.98 
 
 		 425 aa  264  3e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000679327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  38.53 
 
 		 457 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  35.83 
 
 		 460 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  38.53 
 
 		 457 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  38.72 
 
 		 447 aa  264  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  38.53 
 
 		 457 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>