More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2302 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2302  General substrate transporter  100 
 
 		 444 aa  878    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000263865 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2568  general substrate transporter  88.74 
 
 		 444 aa  790    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1913  General substrate transporter  71.4 
 
 		 463 aa  631  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.168957  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  63.57 
 
 		 456 aa  553  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170297  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  59.62 
 
 		 452 aa  500  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18260  arabinose efflux permease family protein  55.48 
 
 		 438 aa  484  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.897354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  44.44 
 
 		 430 aa  318  1e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  42.49 
 
 		 440 aa  317  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  42.82 
 
 		 446 aa  315  8e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  42.16 
 
 		 441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  44.42 
 
 		 454 aa  306  5.0000000000000004e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  40.52 
 
 		 437 aa  300  3e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  39.5 
 
 		 442 aa  300  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  41.31 
 
 		 431 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  42.5 
 
 		 432 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  42.5 
 
 		 432 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  42.5 
 
 		 432 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 441 aa  295  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  37.11 
 
 		 484 aa  295  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  36.84 
 
 		 459 aa  295  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.74 
 
 		 437 aa  293  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  38.26 
 
 		 461 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  38.26 
 
 		 461 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  38.26 
 
 		 461 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  40.51 
 
 		 439 aa  291  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  38.89 
 
 		 436 aa  289  8e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  40.62 
 
 		 450 aa  288  1e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  39.28 
 
 		 439 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  38.55 
 
 		 439 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 439 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  35.52 
 
 		 439 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  38.31 
 
 		 439 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  38.31 
 
 		 439 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  38.31 
 
 		 439 aa  285  9e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 439 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  40 
 
 		 437 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 439 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  39.37 
 
 		 468 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 439 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  35.78 
 
 		 458 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  35.99 
 
 		 459 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  35.99 
 
 		 459 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  37.5 
 
 		 450 aa  282  7.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  37.86 
 
 		 443 aa  282  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  36.68 
 
 		 466 aa  281  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  37.59 
 
 		 455 aa  280  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 435 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 435 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 435 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  37.61 
 
 		 441 aa  279  8e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  41.53 
 
 		 439 aa  278  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  35.93 
 
 		 435 aa  277  3e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1269  general substrate transporter  36.15 
 
 		 470 aa  276  4e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  38.32 
 
 		 432 aa  276  7e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1314  General substrate transporter  35.67 
 
 		 470 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  36.83 
 
 		 456 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  39.95 
 
 		 430 aa  274  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  36.47 
 
 		 438 aa  273  6e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  36.24 
 
 		 438 aa  272  7e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  36.87 
 
 		 442 aa  272  7e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  36.24 
 
 		 438 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  36.24 
 
 		 438 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  36.24 
 
 		 438 aa  271  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  36.24 
 
 		 438 aa  271  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  38.15 
 
 		 459 aa  271  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  36.24 
 
 		 438 aa  271  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  36.24 
 
 		 438 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  41.49 
 
 		 438 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  37.15 
 
 		 439 aa  271  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  38.34 
 
 		 437 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  37.44 
 
 		 460 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 461 aa  270  4e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1848  major facilitator transporter  35.78 
 
 		 447 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276958 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1113  major facilitator transporter  40.51 
 
 		 468 aa  269  7e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  34.85 
 
 		 439 aa  269  7e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3269  major facilitator superfamily MFS_1  40.45 
 
 		 436 aa  269  8.999999999999999e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  37.83 
 
 		 433 aa  269  8.999999999999999e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  35.28 
 
 		 435 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2238  major facilitator transporter  38.9 
 
 		 442 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.451405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  35.28 
 
 		 435 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  35.07 
 
 		 445 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  34.84 
 
 		 435 aa  268  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  35.07 
 
 		 460 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  35.83 
 
 		 435 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0991  general substrate transporter  38.27 
 
 		 436 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0201608  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  35.07 
 
 		 460 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  39.95 
 
 		 433 aa  266  4e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  38.55 
 
 		 435 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  37.56 
 
 		 439 aa  266  4e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0512  general substrate transporter  39.31 
 
 		 483 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.509539  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  35.36 
 
 		 439 aa  266  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4036  major facilitator superfamily MFS_1  38.94 
 
 		 437 aa  266  5e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.16141  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4675  major facilitator transporter  36.1 
 
 		 628 aa  266  5e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85896  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  38.16 
 
 		 437 aa  266  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07050  arabinose efflux permease family protein  39.02 
 
 		 429 aa  266  8e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267941 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  35.36 
 
 		 435 aa  266  8e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  35.36 
 
 		 435 aa  266  8e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0863  general substrate transporter  38 
 
 		 437 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4094  major facilitator transporter  38.27 
 
 		 436 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0951  general substrate transporter  38.27 
 
 		 436 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>