More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2823 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  98.63 
 
 		 438 aa  867    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  98.63 
 
 		 438 aa  867    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  73.81 
 
 		 465 aa  642    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  98.86 
 
 		 438 aa  868    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  98.63 
 
 		 438 aa  867    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  74.08 
 
 		 439 aa  657    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  71.59 
 
 		 465 aa  639    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  98.63 
 
 		 438 aa  867    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  99.09 
 
 		 438 aa  871    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  72.94 
 
 		 439 aa  655    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  90.6 
 
 		 437 aa  804    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  98.63 
 
 		 438 aa  865    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  100 
 
 		 438 aa  881    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  73.03 
 
 		 435 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  73.08 
 
 		 435 aa  625  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  73.27 
 
 		 435 aa  627  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  73.03 
 
 		 435 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  72.84 
 
 		 434 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  73.08 
 
 		 435 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  73.08 
 
 		 435 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0987  shikimate transporter  98.71 
 
 		 310 aa  617  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  70.33 
 
 		 435 aa  617  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  43.65 
 
 		 450 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  46.29 
 
 		 446 aa  343  2e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  45.93 
 
 		 447 aa  341  1e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  43.12 
 
 		 440 aa  330  4e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.07 
 
 		 437 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  41.55 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  41.19 
 
 		 439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  41.55 
 
 		 439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  41.55 
 
 		 439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  44.01 
 
 		 439 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  41.46 
 
 		 439 aa  327  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  43.87 
 
 		 451 aa  326  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 442 aa  323  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.72 
 
 		 437 aa  323  5e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  41 
 
 		 437 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  43.46 
 
 		 461 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  43.57 
 
 		 433 aa  318  9e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  39.66 
 
 		 468 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  42.33 
 
 		 439 aa  311  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  38.93 
 
 		 435 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  38.93 
 
 		 435 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  38.93 
 
 		 435 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  38.53 
 
 		 439 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  39.95 
 
 		 439 aa  306  5.0000000000000004e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  40.48 
 
 		 443 aa  306  7e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1438  major facilitator superfamily MFS_1  41.79 
 
 		 458 aa  306  7e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  39 
 
 		 430 aa  305  7e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 439 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  39.09 
 
 		 457 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  39.09 
 
 		 457 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  41.44 
 
 		 430 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  39.09 
 
 		 457 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  38.3 
 
 		 439 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  41.53 
 
 		 433 aa  302  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4108  major facilitator family transporter  41.53 
 
 		 449 aa  302  9e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.073539  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  41.77 
 
 		 433 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4135  general substrate transporter  41.53 
 
 		 449 aa  301  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  41.53 
 
 		 433 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  38.53 
 
 		 439 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  41.53 
 
 		 433 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  39.57 
 
 		 435 aa  298  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 441 aa  297  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6090  major facilitator transporter  43 
 
 		 450 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0236  shikimate transporter  41.29 
 
 		 433 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  38.84 
 
 		 446 aa  296  5e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  41.29 
 
 		 441 aa  295  9e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  41.49 
 
 		 442 aa  295  9e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  41.11 
 
 		 430 aa  293  4e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  38.52 
 
 		 461 aa  293  5e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  38.52 
 
 		 461 aa  293  5e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  38.52 
 
 		 461 aa  293  5e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  37.84 
 
 		 456 aa  291  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  38.97 
 
 		 455 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  36.36 
 
 		 484 aa  291  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  39.91 
 
 		 438 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  38.48 
 
 		 442 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.95 
 
 		 438 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  38.32 
 
 		 465 aa  288  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4378  major facilitator superfamily MFS_1  39.72 
 
 		 436 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.940021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  38.9 
 
 		 431 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0699  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  39.95 
 
 		 436 aa  286  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351028  hitchhiker  0.00674532 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1782  major facilitator superfamily MFS_1  37.93 
 
 		 457 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  38.7 
 
 		 436 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  40.87 
 
 		 452 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  39.72 
 
 		 436 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  39.48 
 
 		 436 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  39.9 
 
 		 433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  41.83 
 
 		 450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  38.19 
 
 		 454 aa  284  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  39.36 
 
 		 442 aa  284  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6220  major facilitator transporter  39.68 
 
 		 434 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1346  major facilitator superfamily MFS_1  39.73 
 
 		 472 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63119  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  38.25 
 
 		 443 aa  282  7.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  38.28 
 
 		 447 aa  282  7.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  41.15 
 
 		 439 aa  282  9e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  39.58 
 
 		 460 aa  281  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  41.37 
 
 		 452 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>