More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1913 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1913  General substrate transporter  100 
 
 		 463 aa  912    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.168957  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2302  General substrate transporter  71.4 
 
 		 444 aa  643    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000263865 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2568  general substrate transporter  70.72 
 
 		 444 aa  634  1e-180  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  70.62 
 
 		 456 aa  605  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170297  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18260  arabinose efflux permease family protein  59.45 
 
 		 438 aa  504  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.897354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  58.22 
 
 		 452 aa  488  1e-136  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  44.06 
 
 		 446 aa  332  7.000000000000001e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.95 
 
 		 437 aa  323  3e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  43.68 
 
 		 439 aa  320  3e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  44.06 
 
 		 441 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  43.41 
 
 		 440 aa  315  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  45.08 
 
 		 430 aa  314  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  40.55 
 
 		 432 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  43.98 
 
 		 454 aa  307  3e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  44.75 
 
 		 432 aa  306  6e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  44.75 
 
 		 432 aa  306  6e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  44.75 
 
 		 432 aa  306  6e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  39.78 
 
 		 461 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  39.78 
 
 		 461 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  39.78 
 
 		 461 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 439 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  37.5 
 
 		 459 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  41.89 
 
 		 439 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  41.89 
 
 		 439 aa  300  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  40.5 
 
 		 450 aa  299  5e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 439 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  42.6 
 
 		 461 aa  298  1e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 439 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  41.02 
 
 		 439 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  41.02 
 
 		 439 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  37.83 
 
 		 484 aa  293  5e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  38.9 
 
 		 433 aa  291  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  38.02 
 
 		 456 aa  290  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.82 
 
 		 437 aa  289  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  40.76 
 
 		 437 aa  289  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  37.27 
 
 		 436 aa  289  7e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  38.69 
 
 		 442 aa  289  8e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  41.36 
 
 		 460 aa  289  9e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  40.91 
 
 		 439 aa  288  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  40.44 
 
 		 431 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  38.8 
 
 		 442 aa  288  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  45.5 
 
 		 438 aa  287  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  39.01 
 
 		 450 aa  288  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 458 aa  288  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07050  arabinose efflux permease family protein  40.89 
 
 		 429 aa  287  2.9999999999999996e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267941 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  38.67 
 
 		 452 aa  285  9e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  37.39 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  37.39 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  37.39 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  41.65 
 
 		 430 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  39.38 
 
 		 441 aa  284  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 452 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  38.86 
 
 		 447 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  36.49 
 
 		 439 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  41.18 
 
 		 482 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  38.35 
 
 		 466 aa  282  9e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  36.49 
 
 		 439 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  36.49 
 
 		 439 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  37.94 
 
 		 456 aa  279  7e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1848  major facilitator transporter  37.73 
 
 		 447 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276958 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  38.97 
 
 		 439 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  40.71 
 
 		 468 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  39.1 
 
 		 441 aa  278  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 459 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  37.74 
 
 		 435 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  37.74 
 
 		 435 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  39.21 
 
 		 439 aa  276  4e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  37.87 
 
 		 439 aa  276  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  37.76 
 
 		 433 aa  276  5e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  38.74 
 
 		 439 aa  276  6e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  37.53 
 
 		 438 aa  275  9e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2238  major facilitator transporter  41.55 
 
 		 442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.451405  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3744  General substrate transporter  39.29 
 
 		 465 aa  275  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 459 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  37.53 
 
 		 438 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.53 
 
 		 438 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  36.89 
 
 		 465 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  37.53 
 
 		 438 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  37.53 
 
 		 438 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  37.53 
 
 		 438 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  37.53 
 
 		 438 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0117  major facilitator superfamily MFS_1  42.75 
 
 		 444 aa  274  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  42.33 
 
 		 452 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  37.67 
 
 		 441 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  37.16 
 
 		 460 aa  273  5.000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  37.56 
 
 		 437 aa  273  6e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  37.91 
 
 		 443 aa  273  6e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  37.74 
 
 		 435 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  37.74 
 
 		 435 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  37.74 
 
 		 434 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  38.14 
 
 		 445 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  38.37 
 
 		 445 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  38.14 
 
 		 445 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  37.29 
 
 		 438 aa  271  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  37.71 
 
 		 435 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0644  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  40.33 
 
 		 442 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  36.03 
 
 		 455 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  37.14 
 
 		 444 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  40.35 
 
 		 443 aa  271  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>