More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0644 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03371  predicted transporter  82.58 
 
 		 440 aa  649    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0190  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  82.58 
 
 		 440 aa  649    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3920  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  82.81 
 
 		 440 aa  679    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.210524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03324  hypothetical protein  82.58 
 
 		 440 aa  649    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3928  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  82.81 
 
 		 440 aa  650    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0194  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  82.58 
 
 		 440 aa  649    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4011  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  82.81 
 
 		 440 aa  650    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3427  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  86.17 
 
 		 441 aa  724    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4745  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  85.71 
 
 		 440 aa  723    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3925  MFS transporter/metabolite:H+ symporter family protein  82.58 
 
 		 440 aa  641    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3726  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  82.58 
 
 		 440 aa  649    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4886  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  82.58 
 
 		 440 aa  650    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3881  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  82.13 
 
 		 440 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.148005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0860  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  95.7 
 
 		 441 aa  813    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3816  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  82.58 
 
 		 440 aa  641    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3827  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  82.81 
 
 		 440 aa  650    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151355 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3803  MFS transporter metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  82.58 
 
 		 440 aa  641    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3984  MFS transporter metabolite:H+ symporter family protein  82.58 
 
 		 440 aa  641    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.139706 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0644  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  100 
 
 		 442 aa  873    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3302  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  84.58 
 
 		 444 aa  712    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  61.64 
 
 		 447 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1269  general substrate transporter  55.46 
 
 		 470 aa  476  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2295  major facilitator superfamily MFS_1  57.37 
 
 		 452 aa  476  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1314  General substrate transporter  55.43 
 
 		 470 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012233 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  55.89 
 
 		 463 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  55.89 
 
 		 463 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  54.36 
 
 		 466 aa  463  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4675  major facilitator transporter  54.53 
 
 		 628 aa  461  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85896  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  55.89 
 
 		 463 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3923  major facilitator superfamily MFS_1  56.78 
 
 		 452 aa  460  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2079  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  56.75 
 
 		 436 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  hitchhiker  0.0017507 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3269  major facilitator superfamily MFS_1  60.33 
 
 		 436 aa  451  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1332  major facilitator superfamily MFS_1  58.77 
 
 		 433 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423362 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2036  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  60.37 
 
 		 433 aa  451  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70971  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05660  metabolite-proton symporter  53.78 
 
 		 482 aa  446  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2850  General substrate transporter  55.58 
 
 		 437 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.290987  hitchhiker  0.00573587 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  50.7 
 
 		 436 aa  440  9.999999999999999e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3830  major facilitator transporter  59.47 
 
 		 463 aa  440  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3159  general substrate transporter  53.74 
 
 		 428 aa  438  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.761686  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0663  general substrate transporter  55.61 
 
 		 435 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0269429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3101  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  55.94 
 
 		 438 aa  438  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2710  major facilitator superfamily MFS_1  56.43 
 
 		 420 aa  431  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2415  major facilitator superfamily MFS_1  57.65 
 
 		 420 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2487  major facilitator transporter  56.43 
 
 		 420 aa  430  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2736  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  56.4 
 
 		 438 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0706  major facilitator family transporter  57.31 
 
 		 426 aa  427  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00467  metabolite transport protein  57.73 
 
 		 412 aa  425  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1063  major facilitator superfamily MFS_1  54.23 
 
 		 435 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3419  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  53.78 
 
 		 435 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0863  general substrate transporter  54.5 
 
 		 437 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4973  major facilitator transporter  52.93 
 
 		 425 aa  425  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1458  metabolite-proton symporter  55.96 
 
 		 432 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.202966  normal  0.170493 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0512  general substrate transporter  54.85 
 
 		 483 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.509539  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0851  general substrate transporter  54.27 
 
 		 437 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.80283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0991  general substrate transporter  54.85 
 
 		 436 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0201608  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4263  general substrate transporter  56.51 
 
 		 433 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4094  major facilitator transporter  53.21 
 
 		 436 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0951  general substrate transporter  53.68 
 
 		 436 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2408  general substrate transporter  54.85 
 
 		 436 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2238  major facilitator transporter  55.28 
 
 		 442 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.451405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2888  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  52.31 
 
 		 434 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1063  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  55.5 
 
 		 432 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2856  metabolite transport protein  55.21 
 
 		 439 aa  409  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1278  citrate-proton symport  55.45 
 
 		 456 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3026  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  55.42 
 
 		 437 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3059  metabolite:proton symporter family protein  55.42 
 
 		 489 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2961  major facilitator superfamily permease  55.42 
 
 		 437 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1015  general substrate transporter  55.84 
 
 		 438 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1576  metabolite:proton symporter family protein  55.66 
 
 		 506 aa  411  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342246  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4161  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  56.09 
 
 		 433 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15920  major facilitator transporter  56.71 
 
 		 437 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.246808 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2106  metabolite:proton symporter family protein  54.95 
 
 		 437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.22377  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1974  metabolite:proton symporter family protein  54.95 
 
 		 437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2691  general substrate transporter  51.03 
 
 		 445 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11030  Sugar (and other) transporter  51.58 
 
 		 472 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.267916  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0806  metabolite:proton symporter family protein  54.95 
 
 		 523 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.413485  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2638  metabolite:proton symporter family protein  54.95 
 
 		 437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2741  general substrate transporter  51.03 
 
 		 431 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1469  major facilitator family transporter  54.97 
 
 		 438 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0457955  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0161  major facilitator transporter  50.23 
 
 		 440 aa  397  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1369  MFS family transporter  56.74 
 
 		 437 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.19 
 
 		 839 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.834147 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0662  major facilitator family transporter  52.52 
 
 		 393 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4279  major facilitator transporter  50.95 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.646646 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1295  general substrate transporter  50.49 
 
 		 423 aa  346  6e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659237  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1510  major facilitator transporter  46.85 
 
 		 425 aa  336  5e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  41.99 
 
 		 442 aa  331  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  42.86 
 
 		 441 aa  318  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  41.67 
 
 		 446 aa  315  9.999999999999999e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  41.15 
 
 		 456 aa  312  7.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3744  General substrate transporter  43.12 
 
 		 465 aa  310  2.9999999999999997e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  40.86 
 
 		 447 aa  301  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  41.16 
 
 		 456 aa  300  3e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  40.6 
 
 		 468 aa  300  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  39.31 
 
 		 435 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  42.38 
 
 		 482 aa  300  4e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  39.31 
 
 		 435 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  39.31 
 
 		 435 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11224  integral membrane transport protein  39.2 
 
 		 425 aa  299  6e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000679327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 439 aa  299  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>