More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2741 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2691  general substrate transporter  91.4 
 
 		 445 aa  769    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2741  general substrate transporter  100 
 
 		 431 aa  849    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2888  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  73.54 
 
 		 434 aa  581  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2079  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  65.34 
 
 		 436 aa  528  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  hitchhiker  0.0017507 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2850  General substrate transporter  61.06 
 
 		 437 aa  484  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.290987  hitchhiker  0.00573587 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0706  major facilitator family transporter  62.87 
 
 		 426 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3830  major facilitator transporter  62.38 
 
 		 463 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2036  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  59.95 
 
 		 433 aa  441  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70971  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  55.4 
 
 		 447 aa  423  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1332  major facilitator superfamily MFS_1  54.5 
 
 		 433 aa  420  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423362 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4973  major facilitator transporter  54.7 
 
 		 425 aa  421  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0662  major facilitator family transporter  57.43 
 
 		 393 aa  412  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00467  metabolite transport protein  55.88 
 
 		 412 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0644  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  51.03 
 
 		 442 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  49.44 
 
 		 466 aa  400  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0860  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  50.8 
 
 		 441 aa  395  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3920  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  54.07 
 
 		 440 aa  392  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.210524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2295  major facilitator superfamily MFS_1  49.65 
 
 		 452 aa  390  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4675  major facilitator transporter  48.05 
 
 		 628 aa  386  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85896  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  48.1 
 
 		 463 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  48.1 
 
 		 463 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  48.1 
 
 		 463 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05660  metabolite-proton symporter  47.91 
 
 		 482 aa  381  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4886  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  53.1 
 
 		 440 aa  378  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4745  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  49.08 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03371  predicted transporter  52.86 
 
 		 440 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0190  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  52.86 
 
 		 440 aa  376  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0194  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  52.86 
 
 		 440 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3928  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  52.62 
 
 		 440 aa  375  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3827  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  52.62 
 
 		 440 aa  375  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151355 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3159  general substrate transporter  48.1 
 
 		 428 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.761686  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3923  major facilitator superfamily MFS_1  49.07 
 
 		 452 aa  377  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03324  hypothetical protein  52.86 
 
 		 440 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3726  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  52.86 
 
 		 440 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1314  General substrate transporter  45.69 
 
 		 470 aa  377  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012233 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4011  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  53.1 
 
 		 440 aa  378  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3984  MFS transporter metabolite:H+ symporter family protein  53.73 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.139706 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3816  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  53.73 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3302  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  51.44 
 
 		 444 aa  372  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3803  MFS transporter metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  53.73 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1269  general substrate transporter  45.21 
 
 		 470 aa  372  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3427  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  51.91 
 
 		 441 aa  371  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3925  MFS transporter/metabolite:H+ symporter family protein  53.73 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2736  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  50.73 
 
 		 438 aa  368  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3881  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  53.73 
 
 		 440 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.148005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3101  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  50.49 
 
 		 438 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3269  major facilitator superfamily MFS_1  51.97 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0663  general substrate transporter  48.6 
 
 		 435 aa  365  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0269429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0863  general substrate transporter  48.81 
 
 		 437 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0512  general substrate transporter  49.64 
 
 		 483 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.509539  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0991  general substrate transporter  49.64 
 
 		 436 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0201608  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4094  major facilitator transporter  49.39 
 
 		 436 aa  363  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0851  general substrate transporter  48.81 
 
 		 437 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.80283  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2408  general substrate transporter  49.39 
 
 		 436 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0951  general substrate transporter  49.15 
 
 		 436 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3059  metabolite:proton symporter family protein  49.51 
 
 		 489 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3026  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  49.51 
 
 		 437 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2961  major facilitator superfamily permease  49.26 
 
 		 437 aa  356  5e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3419  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  48.06 
 
 		 435 aa  354  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1063  major facilitator superfamily MFS_1  47.57 
 
 		 435 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0806  metabolite:proton symporter family protein  48.77 
 
 		 523 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.413485  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1974  metabolite:proton symporter family protein  48.77 
 
 		 437 aa  352  7e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2106  metabolite:proton symporter family protein  48.77 
 
 		 437 aa  352  7e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.22377  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2638  metabolite:proton symporter family protein  48.77 
 
 		 437 aa  352  7e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1576  metabolite:proton symporter family protein  48.3 
 
 		 506 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342246  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  44.71 
 
 		 436 aa  352  1e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2238  major facilitator transporter  48.81 
 
 		 442 aa  349  6e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.451405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1278  citrate-proton symport  47.96 
 
 		 456 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11030  Sugar (and other) transporter  46.79 
 
 		 472 aa  347  2e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.267916  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1015  general substrate transporter  47.47 
 
 		 438 aa  342  5e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2856  metabolite transport protein  49.27 
 
 		 439 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1458  metabolite-proton symporter  47.62 
 
 		 432 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.202966  normal  0.170493 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2487  major facilitator transporter  47.3 
 
 		 420 aa  341  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2710  major facilitator superfamily MFS_1  47.3 
 
 		 420 aa  341  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4263  general substrate transporter  47.62 
 
 		 433 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1063  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  47.38 
 
 		 432 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.55 
 
 		 839 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.834147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15920  major facilitator transporter  49.48 
 
 		 437 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.246808 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4161  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  47.38 
 
 		 433 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1469  major facilitator family transporter  46.52 
 
 		 438 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0457955  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2415  major facilitator superfamily MFS_1  46.45 
 
 		 420 aa  327  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4279  major facilitator transporter  51.46 
 
 		 426 aa  324  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.646646 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0161  major facilitator transporter  43.75 
 
 		 440 aa  322  6e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1369  MFS family transporter  49.61 
 
 		 437 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  44.98 
 
 		 440 aa  319  6e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1510  major facilitator transporter  47.99 
 
 		 425 aa  318  1e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  44.75 
 
 		 441 aa  317  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  44.87 
 
 		 437 aa  309  6.999999999999999e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1295  general substrate transporter  46.44 
 
 		 423 aa  308  9e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659237  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  41.84 
 
 		 456 aa  308  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  44.33 
 
 		 432 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  44.33 
 
 		 432 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  44.33 
 
 		 432 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  42.79 
 
 		 433 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  44.02 
 
 		 432 aa  300  3e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  43.47 
 
 		 431 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11224  integral membrane transport protein  41.91 
 
 		 425 aa  297  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000679327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  39.81 
 
 		 446 aa  296  6e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  41.65 
 
 		 442 aa  295  8e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  42.23 
 
 		 439 aa  293  5e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>