More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_11030 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_11030  Sugar (and other) transporter  100 
 
 		 472 aa  919    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.267916  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2295  major facilitator superfamily MFS_1  65.86 
 
 		 452 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1269  general substrate transporter  64.05 
 
 		 470 aa  565  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1314  General substrate transporter  61.75 
 
 		 470 aa  562  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012233 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4675  major facilitator transporter  58.35 
 
 		 628 aa  504  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85896  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  57.23 
 
 		 466 aa  494  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3159  general substrate transporter  57.53 
 
 		 428 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.761686  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  58.33 
 
 		 447 aa  442  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3923  major facilitator superfamily MFS_1  52.35 
 
 		 452 aa  420  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  51.33 
 
 		 463 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  51.33 
 
 		 463 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  51.33 
 
 		 463 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4745  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  52.29 
 
 		 440 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0860  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  51.1 
 
 		 441 aa  401  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0644  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  51.1 
 
 		 442 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  48.88 
 
 		 436 aa  395  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05660  metabolite-proton symporter  49.38 
 
 		 482 aa  392  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3920  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  50.87 
 
 		 440 aa  390  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.210524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2079  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  51.58 
 
 		 436 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  hitchhiker  0.0017507 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3427  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  51.45 
 
 		 441 aa  386  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3302  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  51.22 
 
 		 444 aa  387  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3269  major facilitator superfamily MFS_1  51.96 
 
 		 436 aa  382  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0817814 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03371  predicted transporter  51.68 
 
 		 440 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0190  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  51.9 
 
 		 440 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0194  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  51.9 
 
 		 440 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3928  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  51.68 
 
 		 440 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3827  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  51.68 
 
 		 440 aa  366  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151355 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03324  hypothetical protein  51.68 
 
 		 440 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2850  General substrate transporter  48.66 
 
 		 437 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.290987  hitchhiker  0.00573587 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4011  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  51.9 
 
 		 440 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4886  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  51.9 
 
 		 440 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3726  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  51.9 
 
 		 440 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0706  major facilitator family transporter  51.03 
 
 		 426 aa  364  2e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1015  general substrate transporter  48.02 
 
 		 438 aa  363  4e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2036  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  51.65 
 
 		 433 aa  363  5.0000000000000005e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70971  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2736  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  48.45 
 
 		 438 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3830  major facilitator transporter  49.89 
 
 		 463 aa  361  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1063  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  49.02 
 
 		 432 aa  359  6e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0951  general substrate transporter  46.68 
 
 		 436 aa  359  6e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3984  MFS transporter metabolite:H+ symporter family protein  51.23 
 
 		 440 aa  359  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.139706 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3925  MFS transporter/metabolite:H+ symporter family protein  51.23 
 
 		 440 aa  359  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3803  MFS transporter metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  51.23 
 
 		 440 aa  359  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3816  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  51.23 
 
 		 440 aa  359  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0991  general substrate transporter  46.68 
 
 		 436 aa  359  7e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0201608  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3881  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  51.23 
 
 		 440 aa  359  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.148005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1278  citrate-proton symport  46.87 
 
 		 456 aa  359  8e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0851  general substrate transporter  46.9 
 
 		 437 aa  359  8e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.80283  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0863  general substrate transporter  46.68 
 
 		 437 aa  358  9e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139167  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1458  metabolite-proton symporter  49.23 
 
 		 432 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.202966  normal  0.170493 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3101  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  46.79 
 
 		 438 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1063  major facilitator superfamily MFS_1  47.82 
 
 		 435 aa  356  5e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0512  general substrate transporter  46.67 
 
 		 483 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.509539  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3419  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  48.24 
 
 		 435 aa  355  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4094  major facilitator transporter  46.04 
 
 		 436 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2691  general substrate transporter  46.71 
 
 		 445 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1332  major facilitator superfamily MFS_1  48.75 
 
 		 433 aa  353  2.9999999999999997e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423362 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2238  major facilitator transporter  49.35 
 
 		 442 aa  353  5e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.451405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4263  general substrate transporter  48.8 
 
 		 433 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4161  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  49.24 
 
 		 433 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2408  general substrate transporter  45.82 
 
 		 436 aa  351  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2710  major facilitator superfamily MFS_1  48.86 
 
 		 420 aa  350  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15920  major facilitator transporter  49.63 
 
 		 437 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.246808 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2487  major facilitator transporter  48.86 
 
 		 420 aa  348  9e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2741  general substrate transporter  47.03 
 
 		 431 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1469  major facilitator family transporter  46.24 
 
 		 438 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0457955  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0806  metabolite:proton symporter family protein  47.09 
 
 		 523 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.413485  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2106  metabolite:proton symporter family protein  47.09 
 
 		 437 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.22377  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2888  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  47.32 
 
 		 434 aa  344  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1974  metabolite:proton symporter family protein  47.09 
 
 		 437 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2638  metabolite:proton symporter family protein  47.09 
 
 		 437 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3059  metabolite:proton symporter family protein  46.86 
 
 		 489 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3026  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  46.86 
 
 		 437 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1576  metabolite:proton symporter family protein  46.41 
 
 		 506 aa  343  4e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342246  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2961  major facilitator superfamily permease  46.86 
 
 		 437 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0663  general substrate transporter  46.65 
 
 		 435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0269429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2415  major facilitator superfamily MFS_1  49.17 
 
 		 420 aa  339  8e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00467  metabolite transport protein  47.84 
 
 		 412 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1369  MFS family transporter  49.51 
 
 		 437 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4973  major facilitator transporter  44.14 
 
 		 425 aa  335  7.999999999999999e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2856  metabolite transport protein  48.42 
 
 		 439 aa  335  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4279  major facilitator transporter  47.6 
 
 		 426 aa  332  8e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.646646 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0161  major facilitator transporter  44.16 
 
 		 440 aa  329  6e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.93 
 
 		 839 aa  329  6e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.834147 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1510  major facilitator transporter  45.71 
 
 		 425 aa  316  5e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0662  major facilitator family transporter  47.13 
 
 		 393 aa  313  5.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1295  general substrate transporter  46.47 
 
 		 423 aa  307  3e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659237  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  41.56 
 
 		 440 aa  295  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  41.38 
 
 		 456 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  42.03 
 
 		 437 aa  286  4e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  37.36 
 
 		 463 aa  286  5.999999999999999e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  43.17 
 
 		 432 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3744  General substrate transporter  38.77 
 
 		 465 aa  283  3.0000000000000004e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  43.17 
 
 		 432 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  43.17 
 
 		 432 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  37.61 
 
 		 455 aa  280  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11224  integral membrane transport protein  40.64 
 
 		 425 aa  273  3e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000679327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  41.85 
 
 		 441 aa  274  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  39.27 
 
 		 433 aa  273  6e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  39.96 
 
 		 438 aa  272  7e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  39.28 
 
 		 446 aa  271  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>