More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33020 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 446 aa  872    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  48.41 
 
 		 442 aa  379  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  46.95 
 
 		 461 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  46.29 
 
 		 468 aa  353  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  44.88 
 
 		 450 aa  350  4e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.66 
 
 		 437 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  45.54 
 
 		 437 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  44.12 
 
 		 452 aa  340  4e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  45.41 
 
 		 439 aa  333  3e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  45.96 
 
 		 437 aa  332  6e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  46.32 
 
 		 433 aa  332  8e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  43.46 
 
 		 431 aa  330  3e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  44.78 
 
 		 430 aa  329  5.0000000000000004e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  47.63 
 
 		 441 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  45.81 
 
 		 447 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  45.2 
 
 		 439 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  39.78 
 
 		 450 aa  325  1e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  43.61 
 
 		 456 aa  324  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  41.59 
 
 		 461 aa  323  5e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  41.59 
 
 		 461 aa  323  5e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  41.59 
 
 		 461 aa  323  5e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  44.95 
 
 		 439 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  44.95 
 
 		 439 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1913  General substrate transporter  43.78 
 
 		 463 aa  322  7e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.168957  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  47.1 
 
 		 432 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  44.95 
 
 		 439 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  47.1 
 
 		 432 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  44.72 
 
 		 439 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  47.1 
 
 		 432 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  44.39 
 
 		 440 aa  321  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  44.14 
 
 		 439 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  43.44 
 
 		 442 aa  320  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  44.25 
 
 		 441 aa  317  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18260  arabinose efflux permease family protein  42.55 
 
 		 438 aa  317  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.897354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2302  General substrate transporter  42.82 
 
 		 444 aa  315  8e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000263865 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2568  general substrate transporter  40.24 
 
 		 444 aa  315  9e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  46.17 
 
 		 460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  42.57 
 
 		 439 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  40.42 
 
 		 484 aa  313  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  46.58 
 
 		 446 aa  313  4.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  44.08 
 
 		 461 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  37.72 
 
 		 458 aa  310  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  43.86 
 
 		 438 aa  310  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  43.15 
 
 		 445 aa  308  9e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  43.15 
 
 		 445 aa  308  9e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  41.26 
 
 		 456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170297  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  40.05 
 
 		 459 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  42.34 
 
 		 455 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  43.83 
 
 		 433 aa  307  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  46.12 
 
 		 445 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  44.82 
 
 		 439 aa  306  5.0000000000000004e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  40.56 
 
 		 463 aa  306  5.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  40.28 
 
 		 441 aa  306  6e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  43.73 
 
 		 436 aa  306  7e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  41.29 
 
 		 452 aa  305  7e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.35 
 
 		 438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  43.97 
 
 		 447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  41.75 
 
 		 436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  41.75 
 
 		 436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  46.82 
 
 		 445 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  45.86 
 
 		 445 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  43.14 
 
 		 443 aa  303  6.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  45.11 
 
 		 460 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  42.17 
 
 		 441 aa  302  7.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  45.11 
 
 		 460 aa  302  9e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  42.47 
 
 		 437 aa  302  9e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  39.49 
 
 		 439 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  41.31 
 
 		 452 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  39.72 
 
 		 439 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  43.72 
 
 		 427 aa  301  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0241  major facilitator family transporter  40.71 
 
 		 524 aa  301  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  40.59 
 
 		 459 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  40.59 
 
 		 459 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  43.39 
 
 		 439 aa  300  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 442 aa  300  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  38.88 
 
 		 439 aa  299  6e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  42.61 
 
 		 436 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  42.61 
 
 		 436 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  42.55 
 
 		 433 aa  299  8e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  42.29 
 
 		 436 aa  299  8e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 437 aa  299  9e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  39.71 
 
 		 435 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  41.46 
 
 		 435 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  39.71 
 
 		 435 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  41.46 
 
 		 435 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  39.71 
 
 		 435 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  40.66 
 
 		 430 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2147  major facilitator superfamily MFS_1  43.18 
 
 		 434 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426847  normal  0.887871 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  39.16 
 
 		 439 aa  298  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  44.11 
 
 		 436 aa  297  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  38.84 
 
 		 438 aa  297  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  43.68 
 
 		 432 aa  298  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  42.23 
 
 		 450 aa  297  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4745  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.58 
 
 		 440 aa  298  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  38.84 
 
 		 438 aa  297  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5966  major facilitator transporter  42.11 
 
 		 457 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  38.84 
 
 		 438 aa  296  4e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  43.47 
 
 		 457 aa  296  4e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  39.67 
 
 		 435 aa  296  4e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  43.47 
 
 		 457 aa  296  5e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>