More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0076 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  100 
 
 		 450 aa  874    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  47.8 
 
 		 450 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  48.83 
 
 		 461 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  43.71 
 
 		 430 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  44.26 
 
 		 442 aa  346  5e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  44.34 
 
 		 433 aa  344  2e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  41.99 
 
 		 468 aa  338  9e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.2 
 
 		 437 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  47.47 
 
 		 441 aa  335  1e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  42.44 
 
 		 451 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  39.81 
 
 		 437 aa  333  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  41.93 
 
 		 445 aa  332  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  41.33 
 
 		 439 aa  331  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  42.43 
 
 		 446 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  41.33 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  41.33 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  42.24 
 
 		 447 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 445 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  44.26 
 
 		 445 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 445 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  41.07 
 
 		 439 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  41.07 
 
 		 439 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  41.07 
 
 		 439 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 442 aa  325  7e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4135  general substrate transporter  42.69 
 
 		 449 aa  323  3e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  40.82 
 
 		 439 aa  323  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  46.4 
 
 		 452 aa  323  3e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4108  major facilitator family transporter  42.69 
 
 		 449 aa  323  4e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.073539  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3547  major facilitator transporter  44.74 
 
 		 440 aa  321  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189326  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  43.86 
 
 		 460 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  43.5 
 
 		 430 aa  320  3e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  43.56 
 
 		 460 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  43.56 
 
 		 445 aa  319  6e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  42.3 
 
 		 441 aa  317  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  46.19 
 
 		 432 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  46.19 
 
 		 432 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  46.19 
 
 		 432 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  42.23 
 
 		 442 aa  317  4e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  42.86 
 
 		 436 aa  316  6e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  44.16 
 
 		 461 aa  315  9e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  41.89 
 
 		 435 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4283  major facilitator transporter  41.83 
 
 		 460 aa  315  9.999999999999999e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.445263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  41.65 
 
 		 437 aa  315  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  40.85 
 
 		 446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4783  major facilitator superfamily MFS_1  39.72 
 
 		 474 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  41.53 
 
 		 439 aa  312  7.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  43 
 
 		 438 aa  310  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  44.89 
 
 		 434 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  43 
 
 		 437 aa  308  9e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1848  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 447 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276958 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.78 
 
 		 438 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0216  major facilitator superfamily MFS_1  42.07 
 
 		 449 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  41.94 
 
 		 440 aa  306  7e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  41.67 
 
 		 430 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  41.11 
 
 		 435 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  42 
 
 		 465 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  41.23 
 
 		 452 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  42.18 
 
 		 452 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  42.57 
 
 		 438 aa  302  7.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  41.05 
 
 		 435 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  41.05 
 
 		 435 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  41.05 
 
 		 434 aa  302  9e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  44.6 
 
 		 465 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  40.95 
 
 		 439 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  41.05 
 
 		 435 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  41.05 
 
 		 435 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  41.46 
 
 		 435 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  42.07 
 
 		 439 aa  300  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6220  major facilitator transporter  38.11 
 
 		 434 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  41.77 
 
 		 439 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  40 
 
 		 457 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  40 
 
 		 457 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  40 
 
 		 457 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  39.64 
 
 		 442 aa  300  5e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  44.59 
 
 		 427 aa  300  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  41.88 
 
 		 460 aa  299  5e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 458 aa  299  7e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  41.83 
 
 		 438 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  41.83 
 
 		 438 aa  298  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  41.83 
 
 		 438 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  41.83 
 
 		 438 aa  298  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  41.83 
 
 		 438 aa  298  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  41.83 
 
 		 438 aa  298  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2458  major facilitator transporter  40.09 
 
 		 449 aa  298  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  42 
 
 		 433 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  40.48 
 
 		 444 aa  298  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.77 
 
 		 437 aa  298  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  41.83 
 
 		 438 aa  297  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  41.4 
 
 		 465 aa  297  3e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0699  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  37.83 
 
 		 436 aa  297  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351028  hitchhiker  0.00674532 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0650  major facilitator superfamily MFS_1  39.68 
 
 		 466 aa  297  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  41.77 
 
 		 433 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3499  major facilitator transporter  41.62 
 
 		 442 aa  297  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  41.83 
 
 		 438 aa  296  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  41.36 
 
 		 433 aa  296  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3204  general substrate transporter  46.55 
 
 		 429 aa  296  4e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3115  major facilitator transporter  41.55 
 
 		 462 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  41.77 
 
 		 433 aa  296  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4378  major facilitator superfamily MFS_1  38.31 
 
 		 436 aa  296  7e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.940021  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>