More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3115 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3115  major facilitator transporter  100 
 
 		 462 aa  907    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0216  major facilitator superfamily MFS_1  50.22 
 
 		 449 aa  418  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2458  major facilitator transporter  48.99 
 
 		 449 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4783  major facilitator superfamily MFS_1  47.23 
 
 		 474 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0650  major facilitator superfamily MFS_1  45.35 
 
 		 466 aa  347  3e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0627  major facilitator transporter  44.59 
 
 		 478 aa  333  6e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4465  major facilitator transporter  44.12 
 
 		 460 aa  323  3e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1342  major facilitator superfamily transporter  39.57 
 
 		 450 aa  318  1e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0384  major facilitator family transporter  38.75 
 
 		 453 aa  311  1e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3726  major facilitator transporter  47.21 
 
 		 482 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787651  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  43 
 
 		 430 aa  306  6e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1002  major facilitator superfamily MFS_1  40.09 
 
 		 468 aa  303  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.101841 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  41.1 
 
 		 446 aa  301  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  42.66 
 
 		 461 aa  301  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1912  major facilitator superfamily MFS_1  45.03 
 
 		 475 aa  295  1e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.162096 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  39.87 
 
 		 447 aa  294  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  41.55 
 
 		 450 aa  293  3e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5058  major facilitator superfamily MFS_1  40.3 
 
 		 468 aa  294  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181226  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3276  major facilitator superfamily MFS_1  43.05 
 
 		 460 aa  293  6e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 450 aa  288  1e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1103  major facilitator family transporter  38.63 
 
 		 464 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.338347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46710  Major facilitator superfamily transporter  43.51 
 
 		 472 aa  285  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.689171  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02410  Major Facilitator Superfamily transporter  38.61 
 
 		 467 aa  280  3e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.277787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2130  major facilitator superfamily MFS_1  39.22 
 
 		 464 aa  270  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1621  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  38.13 
 
 		 455 aa  268  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00533306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  38.53 
 
 		 468 aa  266  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  37.73 
 
 		 442 aa  266  7e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  36.45 
 
 		 461 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  39.13 
 
 		 433 aa  264  3e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  39.45 
 
 		 440 aa  263  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1934  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.22 
 
 		 459 aa  262  8e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.307592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  39.21 
 
 		 465 aa  262  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  35.12 
 
 		 430 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  39.41 
 
 		 437 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  38.13 
 
 		 442 aa  259  6e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  39.13 
 
 		 452 aa  259  6e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  38.52 
 
 		 451 aa  259  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  40.4 
 
 		 441 aa  259  8e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  38.69 
 
 		 460 aa  259  9e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1038  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 		 457 aa  258  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  39.49 
 
 		 438 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  37.83 
 
 		 456 aa  258  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170297  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1831  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  38.67 
 
 		 446 aa  256  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1665  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  38.67 
 
 		 446 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1677  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  38.67 
 
 		 446 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.905645 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1618  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  38.67 
 
 		 446 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1609  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  38.67 
 
 		 446 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  38.58 
 
 		 435 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01502  predicted transporter  38.19 
 
 		 427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0297029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2102  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  38.19 
 
 		 427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410847  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1633  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  38.19 
 
 		 427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000157893  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2115  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.19 
 
 		 427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0135318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01513  hypothetical protein  38.19 
 
 		 427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0227529  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1752  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  38.19 
 
 		 427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000473238  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  37.12 
 
 		 456 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  35.38 
 
 		 445 aa  254  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1268  major facilitator superfamily MFS_1  37.2 
 
 		 473 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 442 aa  253  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  38.71 
 
 		 439 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  38.71 
 
 		 435 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.36 
 
 		 438 aa  252  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  38.71 
 
 		 435 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  38.71 
 
 		 435 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  36.23 
 
 		 437 aa  251  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2159  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  37.95 
 
 		 427 aa  251  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0943239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  36.38 
 
 		 461 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  36.38 
 
 		 461 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  36.38 
 
 		 461 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  38.71 
 
 		 439 aa  251  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  42.46 
 
 		 438 aa  250  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 444 aa  250  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  40.29 
 
 		 433 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  38.39 
 
 		 439 aa  249  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  36.32 
 
 		 450 aa  248  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  37.41 
 
 		 435 aa  248  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  38.86 
 
 		 439 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  36.24 
 
 		 438 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  34.6 
 
 		 465 aa  247  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4290  major facilitator superfamily MFS_1  37.98 
 
 		 468 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.720009 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  34.84 
 
 		 465 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  39.81 
 
 		 433 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  36.24 
 
 		 438 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  39.81 
 
 		 433 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  39.81 
 
 		 433 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  36.24 
 
 		 438 aa  246  8e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  36.24 
 
 		 438 aa  246  8e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  36.56 
 
 		 435 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  36 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  36 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  36 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  37.11 
 
 		 439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0176  major facilitator superfamily MFS_1  39.22 
 
 		 449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  36 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2637  major facilitator superfamily MFS_1  36.32 
 
 		 473 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  37.67 
 
 		 458 aa  243  5e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0236  shikimate transporter  39.57 
 
 		 433 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0804  major facilitator superfamily MFS_1  38.11 
 
 		 457 aa  243  7e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319544  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.7 
 
 		 437 aa  243  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4108  major facilitator family transporter  35.44 
 
 		 449 aa  241  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.073539  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  36.65 
 
 		 457 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>