More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_46710 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_46710  Major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
472 aa  937    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.689171  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3726  major facilitator transporter  69.82 
 
 
482 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787651  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0627  major facilitator transporter  64.63 
 
 
478 aa  545  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475758  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0650  major facilitator superfamily MFS_1  60 
 
 
466 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1912  major facilitator superfamily MFS_1  60.51 
 
 
475 aa  478  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.162096 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4783  major facilitator superfamily MFS_1  50.44 
 
 
474 aa  422  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2458  major facilitator transporter  48.57 
 
 
449 aa  410  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0216  major facilitator superfamily MFS_1  48.79 
 
 
449 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4465  major facilitator transporter  40.34 
 
 
460 aa  342  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0384  major facilitator family transporter  39.7 
 
 
453 aa  330  3e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1342  major facilitator superfamily transporter  38.99 
 
 
450 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3115  major facilitator transporter  43.41 
 
 
462 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1103  major facilitator family transporter  37.68 
 
 
464 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.338347  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  39.42 
 
 
461 aa  303  5.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5058  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 
468 aa  295  9e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181226  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  36.06 
 
 
450 aa  292  8e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02410  Major Facilitator Superfamily transporter  38.11 
 
 
467 aa  286  8e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.277787  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  37.03 
 
 
442 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3276  major facilitator superfamily MFS_1  39 
 
 
460 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4290  major facilitator superfamily MFS_1  38.55 
 
 
468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.720009 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  38.63 
 
 
442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  36.51 
 
 
468 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1621  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  33.85 
 
 
455 aa  274  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00533306  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1002  major facilitator superfamily MFS_1  34.54 
 
 
468 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.101841 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1038  major facilitator superfamily MFS_1  36.06 
 
 
457 aa  268  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1609  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  35.75 
 
 
446 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1618  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  35.75 
 
 
446 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1677  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  35.75 
 
 
446 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.905645 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1665  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  35.75 
 
 
446 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1934  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.19 
 
 
459 aa  265  8.999999999999999e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.307592  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2130  major facilitator superfamily MFS_1  38.13 
 
 
464 aa  265  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1268  major facilitator superfamily MFS_1  35.45 
 
 
473 aa  265  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1831  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  35.52 
 
 
446 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  40.45 
 
 
438 aa  263  6e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.44 
 
 
438 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  37.39 
 
 
465 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  36.08 
 
 
446 aa  259  9e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  36.4 
 
 
450 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01502  predicted transporter  33.64 
 
 
427 aa  257  3e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0297029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2102  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  33.64 
 
 
427 aa  257  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410847  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2115  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.64 
 
 
427 aa  257  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0135318  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1633  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  33.64 
 
 
427 aa  257  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000157893  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01513  hypothetical protein  33.64 
 
 
427 aa  257  3e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0227529  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1752  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  33.64 
 
 
427 aa  257  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000473238  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  39.43 
 
 
430 aa  257  4e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  34.42 
 
 
430 aa  256  6e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2159  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  33.64 
 
 
427 aa  256  9e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0943239  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  35.15 
 
 
441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2637  major facilitator superfamily MFS_1  34.9 
 
 
473 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  36.7 
 
 
433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  36.81 
 
 
435 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  36.3 
 
 
447 aa  252  9.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36 
 
 
437 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0804  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 
457 aa  249  8e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319544  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  34.63 
 
 
445 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  35.41 
 
 
439 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  38.87 
 
 
431 aa  247  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  37.02 
 
 
434 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  35.16 
 
 
439 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  35.16 
 
 
439 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  36.76 
 
 
435 aa  246  8e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  37.33 
 
 
452 aa  246  9e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  36.7 
 
 
445 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  35.25 
 
 
439 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  36.81 
 
 
444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  35.16 
 
 
439 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  37.22 
 
 
452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  36.28 
 
 
435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  36.28 
 
 
435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  35.14 
 
 
439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  36.28 
 
 
435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  37.41 
 
 
435 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  37.41 
 
 
435 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  37.75 
 
 
433 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  37.3 
 
 
445 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  36.55 
 
 
445 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  37.3 
 
 
445 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  35.09 
 
 
461 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  35.09 
 
 
461 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  37.08 
 
 
445 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  35.09 
 
 
461 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 
461 aa  243  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  37 
 
 
460 aa  243  7e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  36.67 
 
 
452 aa  242  9e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  37.17 
 
 
435 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  36.69 
 
 
435 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  36.65 
 
 
443 aa  241  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  36.42 
 
 
460 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  33.7 
 
 
459 aa  242  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  37.17 
 
 
435 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  35.37 
 
 
437 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  35.66 
 
 
432 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  37.56 
 
 
435 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  33.33 
 
 
484 aa  241  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  34.88 
 
 
439 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  35.31 
 
 
453 aa  239  9e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  34.14 
 
 
450 aa  238  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  38.83 
 
 
439 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  39.36 
 
 
439 aa  237  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  38.42 
 
 
439 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>