More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4830 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  100 
 
 		 442 aa  853    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  84.16 
 
 		 442 aa  704    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  56.21 
 
 		 468 aa  477  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  52.15 
 
 		 461 aa  388  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  47.94 
 
 		 433 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  46.57 
 
 		 450 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  48.39 
 
 		 461 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.05 
 
 		 437 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  43.75 
 
 		 437 aa  358  7e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  45.37 
 
 		 439 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  44.9 
 
 		 439 aa  354  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  45.12 
 
 		 439 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  45.92 
 
 		 439 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  45.92 
 
 		 439 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  45.66 
 
 		 439 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  45.41 
 
 		 439 aa  351  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  44.29 
 
 		 439 aa  348  8e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  44.29 
 
 		 439 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  46.84 
 
 		 440 aa  347  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  43.84 
 
 		 439 aa  347  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  43.62 
 
 		 435 aa  345  8e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  43.62 
 
 		 435 aa  345  8e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  43.62 
 
 		 435 aa  345  8e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  42.7 
 
 		 438 aa  343  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  44.42 
 
 		 437 aa  343  4e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  45.16 
 
 		 451 aa  342  8e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  48.74 
 
 		 437 aa  341  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  44 
 
 		 445 aa  341  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  44.96 
 
 		 446 aa  342  1e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  48.49 
 
 		 437 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  43.78 
 
 		 442 aa  341  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.5 
 
 		 438 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  45.07 
 
 		 465 aa  339  7e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  44.04 
 
 		 447 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  43.17 
 
 		 441 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  47.43 
 
 		 445 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  44.65 
 
 		 436 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  44.06 
 
 		 439 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  47.2 
 
 		 445 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  46.98 
 
 		 460 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  47.2 
 
 		 445 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  43.48 
 
 		 435 aa  335  7e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  47.45 
 
 		 437 aa  335  9e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  43.06 
 
 		 435 aa  335  9e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  43.06 
 
 		 435 aa  335  9e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  43.3 
 
 		 434 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 441 aa  335  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  44.02 
 
 		 439 aa  334  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  44.71 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  46.74 
 
 		 445 aa  333  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  43.06 
 
 		 435 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  43.23 
 
 		 439 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  43.06 
 
 		 435 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 450 aa  333  3e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  40.94 
 
 		 438 aa  333  4e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  43.06 
 
 		 435 aa  333  4e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  44.79 
 
 		 436 aa  333  5e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  44.79 
 
 		 436 aa  333  5e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  40.94 
 
 		 438 aa  332  6e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  46.28 
 
 		 460 aa  332  6e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  40.94 
 
 		 438 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  41.49 
 
 		 438 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  40.94 
 
 		 438 aa  332  8e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  40.94 
 
 		 438 aa  332  8e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  40.94 
 
 		 438 aa  332  8e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4390  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 436 aa  331  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  42.35 
 
 		 435 aa  331  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 436 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 436 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1753  major facilitator family transporter  47.62 
 
 		 443 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2779  major facilitator family transporter  47.62 
 
 		 443 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3057  major facilitator family transporter  47.62 
 
 		 443 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.758675  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  40.94 
 
 		 438 aa  331  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1534  major facilitator family transporter  47.62 
 
 		 443 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.348841  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2262  major facilitator family transporter  47.62 
 
 		 443 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445444  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  46.95 
 
 		 445 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  43.99 
 
 		 430 aa  330  3e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2701  major facilitator family transporter  47.62 
 
 		 443 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  42.79 
 
 		 439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  44.23 
 
 		 430 aa  328  2.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  44.39 
 
 		 482 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  43.7 
 
 		 442 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4283  major facilitator transporter  44.73 
 
 		 460 aa  327  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.445263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2645  major facilitator superfamily permease  47.37 
 
 		 443 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142533  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  44.21 
 
 		 431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  42.65 
 
 		 430 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  44.05 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  43.4 
 
 		 446 aa  324  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  45 
 
 		 436 aa  323  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  43.72 
 
 		 435 aa  323  5e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 439 aa  322  8e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  44.7 
 
 		 433 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  41.88 
 
 		 452 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  43.23 
 
 		 437 aa  320  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  43.2 
 
 		 442 aa  320  3e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  43.43 
 
 		 441 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  45.54 
 
 		 434 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1307  major facilitator family transporter  46.32 
 
 		 437 aa  319  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.702643  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1154  major facilitator transporter  46.32 
 
 		 437 aa  319  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215313  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  40 
 
 		 465 aa  319  7e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>