More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3917 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  92.39 
 
 
447 aa  796    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
446 aa  899    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  68.01 
 
 
433 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  68.01 
 
 
433 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  67.77 
 
 
433 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  67.77 
 
 
433 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0236  shikimate transporter  67.77 
 
 
433 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  50.46 
 
 
450 aa  442  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  49.54 
 
 
461 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  46.65 
 
 
437 aa  363  4e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  48.6 
 
 
440 aa  362  7.0000000000000005e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  45.05 
 
 
438 aa  362  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  45.05 
 
 
438 aa  361  2e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  45.05 
 
 
438 aa  360  2e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  45.05 
 
 
438 aa  360  3e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  44.81 
 
 
438 aa  359  4e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  44.72 
 
 
468 aa  359  4e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  44.81 
 
 
438 aa  359  5e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  44.81 
 
 
438 aa  359  5e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  44.81 
 
 
438 aa  359  5e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  44.93 
 
 
433 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  46 
 
 
435 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  46.38 
 
 
435 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  46.25 
 
 
435 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  46.25 
 
 
435 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  46.25 
 
 
434 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  47.53 
 
 
439 aa  351  1e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  45.6 
 
 
461 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  43.39 
 
 
430 aa  350  3e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  44.71 
 
 
437 aa  349  7e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  43.95 
 
 
465 aa  348  8e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  45.04 
 
 
435 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  45.04 
 
 
435 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  45.93 
 
 
430 aa  347  3e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  45.58 
 
 
435 aa  346  6e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  44.8 
 
 
441 aa  345  1e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  42.36 
 
 
465 aa  344  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  44.63 
 
 
439 aa  342  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  44.76 
 
 
439 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  44.6 
 
 
442 aa  335  9e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.62 
 
 
437 aa  333  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  45.82 
 
 
460 aa  332  6e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  42.63 
 
 
442 aa  332  8e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  44.24 
 
 
447 aa  332  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  43.72 
 
 
456 aa  331  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  44.08 
 
 
461 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  42.66 
 
 
452 aa  331  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  44.08 
 
 
461 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  43.16 
 
 
439 aa  330  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  44.08 
 
 
461 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  43.91 
 
 
451 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  39.86 
 
 
453 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  44.53 
 
 
439 aa  327  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  42.56 
 
 
457 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  42.56 
 
 
457 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  43.29 
 
 
450 aa  327  3e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  42.56 
 
 
457 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  43.13 
 
 
439 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  45.71 
 
 
439 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  43.13 
 
 
439 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  45.71 
 
 
439 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  45.71 
 
 
439 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  39.78 
 
 
459 aa  323  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  41.69 
 
 
437 aa  323  5e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  42.06 
 
 
452 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  45.37 
 
 
446 aa  320  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  47.66 
 
 
438 aa  321  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  43.71 
 
 
443 aa  321  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  39.37 
 
 
444 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  45.34 
 
 
432 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  45.34 
 
 
432 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5092  major facilitator superfamily MFS_1  40.95 
 
 
493 aa  320  3.9999999999999996e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  45.34 
 
 
432 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  44.5 
 
 
442 aa  319  5e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  45.19 
 
 
439 aa  319  6e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0117  major facilitator superfamily MFS_1  42.04 
 
 
444 aa  319  6e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  40.36 
 
 
458 aa  319  7e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  45.91 
 
 
445 aa  318  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  41.04 
 
 
459 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  41.78 
 
 
454 aa  316  5e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  40.87 
 
 
430 aa  316  5e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  42.72 
 
 
450 aa  316  6e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  44.58 
 
 
438 aa  315  8e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  39.95 
 
 
441 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5790  major facilitator superfamily MFS_1  40.85 
 
 
477 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.339463  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  40.56 
 
 
458 aa  313  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  40.36 
 
 
459 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.42 
 
 
438 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  42.76 
 
 
443 aa  311  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  43.81 
 
 
445 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  43.81 
 
 
445 aa  310  5e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  43.81 
 
 
445 aa  310  5e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  44.47 
 
 
438 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6090  major facilitator transporter  44.39 
 
 
450 aa  309  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  42.39 
 
 
482 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  41.46 
 
 
439 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  40.88 
 
 
436 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  42.08 
 
 
445 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  42.75 
 
 
460 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1103  major facilitator family transporter  39.73 
 
 
464 aa  306  3e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.338347  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>