More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2487 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  100 
 
 
445 aa  879    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  96.18 
 
 
445 aa  815    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  94.13 
 
 
460 aa  814    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  94.13 
 
 
460 aa  815    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  96.4 
 
 
445 aa  817    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  96.18 
 
 
445 aa  815    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  94.38 
 
 
445 aa  796    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  76.4 
 
 
433 aa  626  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  64.39 
 
 
438 aa  552  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  63.78 
 
 
438 aa  549  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  47.55 
 
 
452 aa  421  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  48.93 
 
 
452 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  48.74 
 
 
444 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  50.57 
 
 
461 aa  396  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  51.8 
 
 
437 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  48.31 
 
 
433 aa  365  1e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  48.08 
 
 
440 aa  362  9e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  46.41 
 
 
468 aa  359  5e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  46.02 
 
 
450 aa  350  3e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  45.74 
 
 
437 aa  346  5e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  45.16 
 
 
461 aa  345  6e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  44.84 
 
 
443 aa  345  7e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  43.12 
 
 
461 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  43.12 
 
 
461 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  43.12 
 
 
461 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  45.52 
 
 
442 aa  342  8e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  42.07 
 
 
484 aa  340  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  47.31 
 
 
439 aa  338  9.999999999999999e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  44.44 
 
 
431 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  44.84 
 
 
460 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.55 
 
 
437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  48.35 
 
 
438 aa  336  5e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  42.2 
 
 
439 aa  335  7e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  43.02 
 
 
439 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  44.76 
 
 
450 aa  335  9e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  43.02 
 
 
439 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  42.11 
 
 
439 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  42.11 
 
 
439 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  42.11 
 
 
439 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  45.86 
 
 
446 aa  330  4e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  41.65 
 
 
439 aa  329  6e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  42.92 
 
 
456 aa  329  6e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  41.88 
 
 
439 aa  328  9e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  43.54 
 
 
447 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  41.99 
 
 
460 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  46.74 
 
 
442 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  41.16 
 
 
459 aa  326  5e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  43.56 
 
 
450 aa  325  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  40.36 
 
 
458 aa  323  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  42.48 
 
 
447 aa  322  9.999999999999999e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  43 
 
 
446 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  42.69 
 
 
455 aa  321  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  40.43 
 
 
430 aa  319  6e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7098  major facilitator transporter  44.15 
 
 
456 aa  319  6e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  44.74 
 
 
441 aa  319  6e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  42.56 
 
 
459 aa  319  6e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  43.02 
 
 
455 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  42.89 
 
 
439 aa  317  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  39.91 
 
 
459 aa  316  6e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  41.45 
 
 
432 aa  316  6e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  39.91 
 
 
459 aa  316  7e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  42.01 
 
 
435 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  43.29 
 
 
465 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  42.3 
 
 
435 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  42.65 
 
 
439 aa  312  9e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  41.88 
 
 
433 aa  311  1e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  42.93 
 
 
435 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  41.19 
 
 
435 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  41.32 
 
 
435 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  41.19 
 
 
435 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  41.32 
 
 
435 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  41.19 
 
 
435 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  41.23 
 
 
435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  41.14 
 
 
463 aa  309  5e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  41.24 
 
 
434 aa  310  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  41.23 
 
 
435 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  41.23 
 
 
435 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  43.24 
 
 
441 aa  308  9e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  42.41 
 
 
445 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6236  major facilitator transporter  42.72 
 
 
454 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  41.42 
 
 
439 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  42.34 
 
 
451 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  40.73 
 
 
439 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4135  general substrate transporter  41.42 
 
 
449 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  43.88 
 
 
439 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4108  major facilitator family transporter  41.42 
 
 
449 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.073539  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  40.42 
 
 
442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  40.96 
 
 
430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  41.67 
 
 
442 aa  303  4.0000000000000003e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  40.24 
 
 
457 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  46.78 
 
 
452 aa  303  5.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  40.5 
 
 
439 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  40.24 
 
 
457 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  40.24 
 
 
457 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  41.25 
 
 
439 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1848  major facilitator transporter  39.16 
 
 
447 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0276958 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5966  major facilitator transporter  44.15 
 
 
457 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  42.27 
 
 
430 aa  301  1e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0236  shikimate transporter  42.11 
 
 
433 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  40.87 
 
 
441 aa  300  5e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>