More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8515 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  100 
 
 
438 aa  857    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  77.54 
 
 
440 aa  625  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  71.79 
 
 
437 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  68.04 
 
 
439 aa  564  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  64.35 
 
 
460 aa  512  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  53.32 
 
 
455 aa  454  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  53.12 
 
 
461 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  53.12 
 
 
461 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  53.12 
 
 
461 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  48.63 
 
 
458 aa  431  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  50 
 
 
459 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  51.5 
 
 
456 aa  430  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  49.54 
 
 
459 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  50.35 
 
 
484 aa  426  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  51.51 
 
 
450 aa  424  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  51.14 
 
 
447 aa  421  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  47.92 
 
 
459 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  48.93 
 
 
435 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  48.93 
 
 
435 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  48.93 
 
 
435 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  48.82 
 
 
439 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  49.29 
 
 
439 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  53.55 
 
 
461 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  48.82 
 
 
439 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  49.09 
 
 
460 aa  402  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  51.64 
 
 
443 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  50 
 
 
459 aa  396  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3969  major facilitator transporter  50.36 
 
 
457 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502064  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7098  major facilitator transporter  50.23 
 
 
456 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  48.58 
 
 
461 aa  388  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  49.05 
 
 
439 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  48.2 
 
 
441 aa  385  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4210  major facilitator superfamily MFS_1  51.95 
 
 
448 aa  380  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.199459  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  48.65 
 
 
455 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  46.42 
 
 
450 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6236  major facilitator transporter  49.54 
 
 
454 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4803  major facilitator superfamily MFS_1  51.43 
 
 
444 aa  372  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.543727 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  47.14 
 
 
442 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  47.71 
 
 
435 aa  371  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  44.63 
 
 
439 aa  366  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  48.43 
 
 
468 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  46.81 
 
 
431 aa  362  9e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  45.39 
 
 
443 aa  361  1e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  44.37 
 
 
457 aa  359  4e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  44.37 
 
 
457 aa  360  4e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  44.37 
 
 
457 aa  359  4e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  47.66 
 
 
446 aa  354  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  44.68 
 
 
430 aa  352  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3519  major facilitator superfamily MFS_1  47.25 
 
 
444 aa  352  7e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  44.11 
 
 
482 aa  351  1e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3240  major facilitator superfamily MFS_1  48.94 
 
 
466 aa  351  1e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  46.08 
 
 
447 aa  351  1e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5966  major facilitator transporter  47.22 
 
 
457 aa  350  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  48.42 
 
 
430 aa  350  3e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0176  major facilitator superfamily MFS_1  46.9 
 
 
449 aa  348  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3577  major facilitator transporter  47.48 
 
 
453 aa  348  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07050  arabinose efflux permease family protein  45.2 
 
 
429 aa  347  3e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.267941 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  47.04 
 
 
438 aa  346  5e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  44.44 
 
 
430 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  46.4 
 
 
441 aa  344  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0094  major facilitator transporter  50.13 
 
 
443 aa  343  4e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  48.05 
 
 
452 aa  342  8e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  48.25 
 
 
445 aa  341  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  47.58 
 
 
438 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  48.67 
 
 
460 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  48.87 
 
 
432 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  48.87 
 
 
432 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  45.02 
 
 
433 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  48.67 
 
 
460 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  48.87 
 
 
432 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1110  major facilitator superfamily protein  45.08 
 
 
449 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  48.93 
 
 
433 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  45.43 
 
 
442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  48.55 
 
 
445 aa  335  7e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  48.31 
 
 
445 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  48.31 
 
 
445 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  46.3 
 
 
442 aa  335  1e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  45.32 
 
 
433 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  48.31 
 
 
445 aa  332  6e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  45.32 
 
 
433 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  45.32 
 
 
433 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.79 
 
 
437 aa  332  8e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  45.32 
 
 
433 aa  332  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  42.65 
 
 
437 aa  332  9e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  43.9 
 
 
439 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  45.52 
 
 
442 aa  329  6e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0236  shikimate transporter  44.84 
 
 
433 aa  328  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  43.9 
 
 
439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  43.9 
 
 
439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  44.15 
 
 
439 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  43.9 
 
 
439 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  44.15 
 
 
439 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  43.9 
 
 
439 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3540  major facilitator transporter  48.84 
 
 
463 aa  326  5e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  41.55 
 
 
463 aa  325  1e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  42.45 
 
 
456 aa  322  7e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  44.55 
 
 
442 aa  322  8e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  43.75 
 
 
465 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  41.55 
 
 
452 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  44.39 
 
 
427 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>