More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5928 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  100 
 
 		 442 aa  862    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  84.16 
 
 		 442 aa  689    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  57.99 
 
 		 468 aa  499  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  48.43 
 
 		 433 aa  395  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  52.39 
 
 		 461 aa  394  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  47.75 
 
 		 450 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  48.74 
 
 		 461 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  47.27 
 
 		 437 aa  378  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  47.06 
 
 		 437 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  44.68 
 
 		 439 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  45 
 
 		 439 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  45 
 
 		 439 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  44.76 
 
 		 439 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  44.52 
 
 		 439 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  48.48 
 
 		 440 aa  366  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  44.76 
 
 		 439 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  47.03 
 
 		 465 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  44.76 
 
 		 439 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  44.83 
 
 		 437 aa  366  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  43.99 
 
 		 438 aa  364  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  44.24 
 
 		 435 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  45.02 
 
 		 439 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  45.02 
 
 		 439 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  44.24 
 
 		 435 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  44.24 
 
 		 435 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  44.8 
 
 		 439 aa  358  9e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  42.79 
 
 		 435 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.87 
 
 		 438 aa  356  5e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  42.62 
 
 		 438 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  42.62 
 
 		 438 aa  352  5e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  42.62 
 
 		 438 aa  352  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  42.62 
 
 		 438 aa  352  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  42.62 
 
 		 438 aa  352  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  42.62 
 
 		 438 aa  352  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  46.21 
 
 		 451 aa  352  7e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  45.41 
 
 		 430 aa  352  8.999999999999999e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  42.62 
 
 		 438 aa  352  1e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  48.13 
 
 		 437 aa  351  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  47.88 
 
 		 437 aa  351  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  43.03 
 
 		 438 aa  351  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  44.14 
 
 		 442 aa  350  3e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  44.76 
 
 		 435 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  44.82 
 
 		 435 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  44.07 
 
 		 434 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  44.31 
 
 		 435 aa  346  5e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  44.31 
 
 		 435 aa  346  5e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  43.85 
 
 		 446 aa  345  7e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  46.24 
 
 		 445 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  43.83 
 
 		 435 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  43.83 
 
 		 435 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  43.98 
 
 		 435 aa  345  8e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  44.57 
 
 		 439 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  46.98 
 
 		 437 aa  344  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  46.01 
 
 		 445 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  45.05 
 
 		 461 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  44.26 
 
 		 450 aa  344  2e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  45.05 
 
 		 461 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  46.01 
 
 		 445 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  45.05 
 
 		 461 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  45.75 
 
 		 460 aa  343  5e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  44.5 
 
 		 436 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  44.79 
 
 		 441 aa  342  7e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  45.52 
 
 		 445 aa  342  9e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  41.04 
 
 		 465 aa  342  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4108  major facilitator family transporter  44.7 
 
 		 449 aa  341  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.073539  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1753  major facilitator family transporter  45.88 
 
 		 443 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4135  general substrate transporter  44.7 
 
 		 449 aa  341  2e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  42.31 
 
 		 482 aa  340  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2262  major facilitator family transporter  45.88 
 
 		 443 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445444  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1534  major facilitator family transporter  45.88 
 
 		 443 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.348841  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3057  major facilitator family transporter  45.88 
 
 		 443 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.758675  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2779  major facilitator family transporter  45.65 
 
 		 443 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  43.24 
 
 		 439 aa  340  4e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2701  major facilitator family transporter  45.88 
 
 		 443 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  45.05 
 
 		 460 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  43.56 
 
 		 447 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  45.2 
 
 		 441 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  46.6 
 
 		 434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2645  major facilitator superfamily permease  45.65 
 
 		 443 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142533  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  46.12 
 
 		 442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  39.95 
 
 		 465 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  43.17 
 
 		 445 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  44.29 
 
 		 431 aa  336  5e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  44.82 
 
 		 435 aa  335  7.999999999999999e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  44.5 
 
 		 443 aa  335  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  43.06 
 
 		 430 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  42.48 
 
 		 457 aa  334  1e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  42.48 
 
 		 457 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  45.5 
 
 		 445 aa  334  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  42.48 
 
 		 457 aa  334  1e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  40.85 
 
 		 484 aa  334  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4283  major facilitator transporter  46.48 
 
 		 460 aa  333  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.445263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 436 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 436 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  45.61 
 
 		 437 aa  333  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 436 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  43.87 
 
 		 452 aa  333  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  44.69 
 
 		 439 aa  333  4e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  44.29 
 
 		 433 aa  333  5e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  43.07 
 
 		 439 aa  332  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>