More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2263 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  99.09 
 
 
438 aa  873    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  99.09 
 
 
438 aa  873    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  72.71 
 
 
439 aa  652    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  74.05 
 
 
465 aa  640    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  90.6 
 
 
437 aa  800    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  99.09 
 
 
438 aa  871    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  98.63 
 
 
438 aa  867    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  73.85 
 
 
439 aa  654    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  71.85 
 
 
465 aa  639    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  99.09 
 
 
438 aa  873    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  100 
 
 
438 aa  880    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  99.32 
 
 
438 aa  874    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  99.54 
 
 
438 aa  877    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  71.17 
 
 
435 aa  628  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  71.17 
 
 
435 aa  628  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  73.57 
 
 
435 aa  625  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  71.2 
 
 
435 aa  625  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  71.2 
 
 
435 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  71.73 
 
 
434 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  71.2 
 
 
435 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0987  shikimate transporter  98.71 
 
 
310 aa  620  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  71.46 
 
 
435 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  43.65 
 
 
450 aa  355  5.999999999999999e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  46.04 
 
 
446 aa  343  4e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  45.43 
 
 
447 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.25 
 
 
437 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  43.12 
 
 
440 aa  325  7e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  43.77 
 
 
439 aa  325  7e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  41.23 
 
 
439 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  40.73 
 
 
439 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  43.77 
 
 
439 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  40.91 
 
 
439 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  44.08 
 
 
451 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  42.62 
 
 
442 aa  324  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  40.91 
 
 
439 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  40.91 
 
 
439 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.72 
 
 
437 aa  322  6e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  40.76 
 
 
437 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  43.81 
 
 
433 aa  320  3e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  43.36 
 
 
461 aa  316  6e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  39.11 
 
 
468 aa  315  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  41.01 
 
 
439 aa  311  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  40.48 
 
 
443 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  39.11 
 
 
435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  39.62 
 
 
439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1438  major facilitator superfamily MFS_1  41.79 
 
 
458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  39.11 
 
 
435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  39.95 
 
 
439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  39.11 
 
 
435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  39 
 
 
430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  38.67 
 
 
457 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  38.67 
 
 
457 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  38.67 
 
 
457 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4108  major facilitator family transporter  42.26 
 
 
449 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.073539  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4135  general substrate transporter  42.26 
 
 
449 aa  302  8.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  41.5 
 
 
439 aa  302  9e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  41.44 
 
 
430 aa  301  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  39.57 
 
 
439 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  39.81 
 
 
439 aa  299  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  39.81 
 
 
435 aa  298  9e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  42.08 
 
 
433 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  41.84 
 
 
433 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  38.46 
 
 
441 aa  296  4e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6090  major facilitator transporter  43.24 
 
 
450 aa  296  7e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  41.84 
 
 
433 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  39.76 
 
 
446 aa  295  8e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  41.84 
 
 
433 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  40.94 
 
 
442 aa  294  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  41.29 
 
 
441 aa  294  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0236  shikimate transporter  41.61 
 
 
433 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  38.52 
 
 
461 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  38.52 
 
 
461 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  38.52 
 
 
461 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  40.87 
 
 
430 aa  291  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  37.61 
 
 
456 aa  291  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  38.97 
 
 
455 aa  289  9e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  39.68 
 
 
438 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  38.48 
 
 
442 aa  288  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  36.13 
 
 
484 aa  288  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.71 
 
 
438 aa  286  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  38.55 
 
 
465 aa  286  5e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  38.9 
 
 
431 aa  285  9e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  39.72 
 
 
436 aa  285  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  39.48 
 
 
436 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4378  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 
436 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.940021  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1346  major facilitator superfamily MFS_1  39.77 
 
 
472 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63119  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  40.68 
 
 
452 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  41.83 
 
 
450 aa  283  5.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1782  major facilitator superfamily MFS_1  37.7 
 
 
457 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  38.7 
 
 
436 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  38.04 
 
 
447 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  36.72 
 
 
458 aa  283  6.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0699  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  40.19 
 
 
436 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351028  hitchhiker  0.00674532 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  42.16 
 
 
439 aa  281  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  39.65 
 
 
433 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  40.05 
 
 
442 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  38.19 
 
 
454 aa  281  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  39.12 
 
 
460 aa  280  3e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  39.71 
 
 
436 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  39.71 
 
 
436 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>