More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3897 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  89.4 
 
 
434 aa  744    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  100 
 
 
436 aa  872    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  71.7 
 
 
436 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  71.7 
 
 
436 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  71.46 
 
 
436 aa  598  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  72.29 
 
 
436 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  72.29 
 
 
436 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  72.29 
 
 
436 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4390  major facilitator transporter  70.84 
 
 
436 aa  588  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1307  major facilitator family transporter  71.46 
 
 
437 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.702643  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1154  major facilitator transporter  71.46 
 
 
437 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215313  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2216  major facilitator family transporter  71.71 
 
 
437 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0701  major facilitator family transporter  71.71 
 
 
437 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1146  major facilitator transporter  71.71 
 
 
437 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2079  major facilitator family transporter  71.71 
 
 
437 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.068435  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2535  major facilitator family transporter  71.71 
 
 
437 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.805911  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  66.27 
 
 
437 aa  568  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  66.51 
 
 
437 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0098  major facilitator family transporter  66.9 
 
 
457 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.381076  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0253  major facilitator family transporter  67.13 
 
 
444 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1681  major facilitator transporter  67.21 
 
 
439 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0114815  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1162  major facilitator family transporter  66.44 
 
 
439 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12498  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1770  major facilitator family transporter  67.13 
 
 
457 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0326  major facilitator family transporter  66.9 
 
 
457 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544768  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1100  major facilitator family transporter  66.9 
 
 
444 aa  554  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341901  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1267  major facilitator family transporter  66.9 
 
 
439 aa  554  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1753  major facilitator family transporter  64.03 
 
 
443 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2779  major facilitator family transporter  64.51 
 
 
443 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3057  major facilitator family transporter  64.03 
 
 
443 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.758675  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1534  major facilitator family transporter  64.03 
 
 
443 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.348841  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2262  major facilitator family transporter  64.03 
 
 
443 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445444  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2645  major facilitator superfamily permease  63.79 
 
 
443 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142533  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2701  major facilitator family transporter  63.79 
 
 
443 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1835  major facilitator family transporter  63.01 
 
 
443 aa  526  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  60.38 
 
 
444 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  60.38 
 
 
444 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  60.33 
 
 
444 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2985  major facilitator family transporter  60.38 
 
 
444 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.464085  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  60.38 
 
 
444 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  60.38 
 
 
444 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  60.38 
 
 
444 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  60.09 
 
 
433 aa  502  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0241  major facilitator family transporter  60.58 
 
 
524 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2147  major facilitator superfamily MFS_1  59.22 
 
 
434 aa  501  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426847  normal  0.887871 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  60.05 
 
 
439 aa  500  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3082  major facilitator transporter  57.89 
 
 
441 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4645  major facilitator transporter  58.37 
 
 
441 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372459  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3435  major facilitator transporter  58.37 
 
 
446 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0701144  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5285  major facilitator transporter  57.89 
 
 
441 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389123  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0365  major facilitator transporter  57.66 
 
 
441 aa  491  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449418  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5174  major facilitator transporter  57.66 
 
 
441 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4983  major facilitator transporter  57.42 
 
 
441 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  50.94 
 
 
427 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  50.11 
 
 
439 aa  397  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  48.71 
 
 
432 aa  386  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  46.67 
 
 
433 aa  383  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1540  major facilitator superfamily MFS_1  46.1 
 
 
468 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0867894 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17780  major facilitator transporter  46.1 
 
 
469 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1545  MFS family transporter  46.06 
 
 
470 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1113  major facilitator transporter  44.57 
 
 
468 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182405  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5467  major facilitator transporter  44.6 
 
 
471 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491841  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2068  major facilitator transporter  44.21 
 
 
474 aa  339  7e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.680279  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.99 
 
 
437 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  45.1 
 
 
441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2195  major facilitator transporter  44.73 
 
 
481 aa  336  5e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2176  major facilitator transporter  44.44 
 
 
470 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5919  major facilitator transporter  44.44 
 
 
470 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2158  major facilitator transporter  44.44 
 
 
470 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  47.04 
 
 
439 aa  329  7e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  43.83 
 
 
468 aa  323  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  41.87 
 
 
437 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  46.15 
 
 
439 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  46.15 
 
 
439 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  43.06 
 
 
450 aa  321  9.999999999999999e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  46.15 
 
 
439 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  46.15 
 
 
439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  44.07 
 
 
437 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  47.04 
 
 
439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  41.95 
 
 
440 aa  319  5e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  45.91 
 
 
439 aa  319  6e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  44.5 
 
 
442 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  40.79 
 
 
439 aa  311  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  40.57 
 
 
430 aa  310  4e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4036  major facilitator superfamily MFS_1  42.03 
 
 
437 aa  309  5.9999999999999995e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.16141  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  40.56 
 
 
438 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  43.73 
 
 
446 aa  306  7e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41 
 
 
438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  43.07 
 
 
442 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  42.12 
 
 
441 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  42.86 
 
 
450 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  38.5 
 
 
465 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  41.5 
 
 
446 aa  303  5.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  40.53 
 
 
430 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  40.47 
 
 
457 aa  302  7.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  40.47 
 
 
457 aa  302  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  40.47 
 
 
457 aa  302  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  43.91 
 
 
461 aa  300  3e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  40.56 
 
 
439 aa  300  4e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  42.39 
 
 
442 aa  299  6e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  44.65 
 
 
442 aa  299  7e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>