More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4866 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  100 
 
 		 445 aa  881    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4279  major facilitator transporter  68.62 
 
 		 435 aa  557  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0810486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  64.24 
 
 		 442 aa  527  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  66.11 
 
 		 437 aa  525  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4283  major facilitator transporter  65.57 
 
 		 460 aa  523  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.445263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6220  major facilitator transporter  64.37 
 
 		 434 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4378  major facilitator superfamily MFS_1  64.13 
 
 		 436 aa  512  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.940021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4212  major facilitator superfamily MFS_1  63.82 
 
 		 458 aa  510  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0699  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  63.42 
 
 		 436 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351028  hitchhiker  0.00674532 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4527  major facilitator transporter  63.29 
 
 		 434 aa  475  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2004  major facilitator transporter  63.04 
 
 		 434 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.752518 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1782  major facilitator superfamily MFS_1  58.19 
 
 		 457 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6090  major facilitator transporter  55.28 
 
 		 450 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1438  major facilitator superfamily MFS_1  55.64 
 
 		 458 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  54.03 
 
 		 452 aa  425  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4875  major facilitator transporter  47.86 
 
 		 439 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4964  major facilitator superfamily transporter  47.86 
 
 		 439 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5243  major facilitator transporter  47.86 
 
 		 439 aa  382  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  42.68 
 
 		 439 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  44.01 
 
 		 450 aa  363  4e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0140  major facilitator transporter  48.23 
 
 		 439 aa  362  6e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 439 aa  362  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 439 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 439 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 439 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  49.41 
 
 		 461 aa  360  3e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  42.51 
 
 		 439 aa  360  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  44.06 
 
 		 440 aa  359  6e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  42.26 
 
 		 439 aa  358  8e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.29 
 
 		 437 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  40.15 
 
 		 437 aa  356  5e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  44.95 
 
 		 430 aa  356  5e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  43.5 
 
 		 451 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  43.13 
 
 		 468 aa  348  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  46.08 
 
 		 441 aa  348  1e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  46.93 
 
 		 438 aa  346  4e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1456  major facilitator superfamily MFS_1  48.76 
 
 		 453 aa  345  7e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  44.79 
 
 		 442 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  43.46 
 
 		 447 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  46 
 
 		 437 aa  339  5.9999999999999996e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  42.69 
 
 		 461 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  45.65 
 
 		 461 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  42.69 
 
 		 461 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  42.69 
 
 		 461 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  42.86 
 
 		 456 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 		 465 aa  333  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  43.17 
 
 		 442 aa  332  6e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  41.87 
 
 		 450 aa  332  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4108  major facilitator family transporter  43.71 
 
 		 449 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.073539  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  42.59 
 
 		 482 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4135  general substrate transporter  43.71 
 
 		 449 aa  329  6e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  46.48 
 
 		 432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  44 
 
 		 442 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  46.48 
 
 		 432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  46.48 
 
 		 432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  46.06 
 
 		 446 aa  327  3e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  47.04 
 
 		 446 aa  325  1e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  40.33 
 
 		 434 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  44.47 
 
 		 460 aa  323  3e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  40.38 
 
 		 454 aa  323  3e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  42.69 
 
 		 436 aa  323  4e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  40.38 
 
 		 435 aa  323  5e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  40.38 
 
 		 435 aa  323  5e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  42.68 
 
 		 438 aa  322  6e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  40.24 
 
 		 435 aa  323  6e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  40.38 
 
 		 435 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  40.38 
 
 		 435 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  44.37 
 
 		 439 aa  322  9.000000000000001e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  45.07 
 
 		 447 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  41.84 
 
 		 431 aa  320  3e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 436 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  40.14 
 
 		 435 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 436 aa  319  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  41.98 
 
 		 455 aa  319  6e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.34 
 
 		 438 aa  319  7e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 434 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  39.43 
 
 		 430 aa  318  1e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  38.76 
 
 		 441 aa  318  1e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  42.14 
 
 		 441 aa  318  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  39.57 
 
 		 435 aa  317  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  41.43 
 
 		 484 aa  317  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  45.01 
 
 		 439 aa  317  4e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  40.24 
 
 		 452 aa  316  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  39.24 
 
 		 452 aa  316  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  40.38 
 
 		 450 aa  314  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  43.87 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  43.13 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  43.13 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  41.39 
 
 		 457 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  41.39 
 
 		 457 aa  313  5.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  41.39 
 
 		 457 aa  313  5.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  39.57 
 
 		 439 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  41.35 
 
 		 443 aa  311  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  40.24 
 
 		 441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  37.7 
 
 		 439 aa  310  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  41.91 
 
 		 443 aa  310  4e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  37.1 
 
 		 439 aa  309  8e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  37.65 
 
 		 465 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  38.92 
 
 		 439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>