More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2103 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  95.89 
 
 		 438 aa  835    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  100 
 
 		 438 aa  860    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  63.27 
 
 		 460 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  63.7 
 
 		 445 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  63.33 
 
 		 460 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  62.81 
 
 		 445 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  62.81 
 
 		 445 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  63.53 
 
 		 445 aa  527  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  62.81 
 
 		 445 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  64.49 
 
 		 433 aa  510  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  50.84 
 
 		 452 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  51.08 
 
 		 452 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  49.3 
 
 		 444 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  45.89 
 
 		 468 aa  358  8e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  50.82 
 
 		 461 aa  352  7e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  48.61 
 
 		 437 aa  347  3e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  47.06 
 
 		 440 aa  347  3e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  44.1 
 
 		 433 aa  339  5e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  44.22 
 
 		 442 aa  338  9e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  45.29 
 
 		 450 aa  335  7e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  41.63 
 
 		 484 aa  332  9e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  45.43 
 
 		 439 aa  331  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  43.61 
 
 		 460 aa  330  4e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  44.98 
 
 		 461 aa  329  8e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  44.71 
 
 		 443 aa  328  8e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  42.09 
 
 		 432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  44.39 
 
 		 450 aa  326  4.0000000000000003e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  45.03 
 
 		 439 aa  325  8.000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  44.19 
 
 		 439 aa  323  3e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  44.47 
 
 		 459 aa  323  3e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  45.43 
 
 		 433 aa  322  6e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  44.71 
 
 		 437 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  44.53 
 
 		 439 aa  319  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.46 
 
 		 437 aa  319  6e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  41.92 
 
 		 461 aa  318  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  41.92 
 
 		 461 aa  318  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  41.92 
 
 		 461 aa  318  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  44.53 
 
 		 439 aa  318  9e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  47.58 
 
 		 438 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  44.53 
 
 		 439 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  44.27 
 
 		 439 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  44.27 
 
 		 439 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  44.27 
 
 		 439 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  41.23 
 
 		 458 aa  317  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  42.03 
 
 		 459 aa  317  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 459 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  43.14 
 
 		 447 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  41.2 
 
 		 459 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  43.9 
 
 		 431 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  43.81 
 
 		 465 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  43.27 
 
 		 441 aa  312  9e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  43.88 
 
 		 460 aa  311  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  43.41 
 
 		 442 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  43.83 
 
 		 446 aa  311  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  42.17 
 
 		 447 aa  310  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  41.29 
 
 		 430 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  43.1 
 
 		 446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  41.03 
 
 		 436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  43.53 
 
 		 455 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  42.73 
 
 		 482 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  43.69 
 
 		 455 aa  307  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  40.92 
 
 		 456 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  39.13 
 
 		 439 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 442 aa  303  4.0000000000000003e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  42.65 
 
 		 439 aa  301  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  41.41 
 
 		 441 aa  301  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  41.65 
 
 		 430 aa  299  6e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7098  major facilitator transporter  41.91 
 
 		 456 aa  299  8e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  42.18 
 
 		 445 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  38.69 
 
 		 430 aa  298  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  42.27 
 
 		 439 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 435 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 435 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 435 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  40.86 
 
 		 437 aa  297  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  43.78 
 
 		 450 aa  296  6e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  40.79 
 
 		 437 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6090  major facilitator transporter  42.35 
 
 		 450 aa  294  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  41.34 
 
 		 439 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0216  major facilitator superfamily MFS_1  41.03 
 
 		 449 aa  291  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  41.53 
 
 		 439 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3057  major facilitator family transporter  40.05 
 
 		 443 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.758675  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1753  major facilitator family transporter  40.05 
 
 		 443 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2779  major facilitator family transporter  40.05 
 
 		 443 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2262  major facilitator family transporter  40.05 
 
 		 443 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445444  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1534  major facilitator family transporter  40.05 
 
 		 443 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.348841  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  41.11 
 
 		 439 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  40.61 
 
 		 437 aa  290  5.0000000000000004e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3969  major facilitator transporter  40.91 
 
 		 457 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  40.09 
 
 		 438 aa  289  6e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  40.5 
 
 		 433 aa  289  6e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  40.09 
 
 		 438 aa  289  7e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  40.7 
 
 		 439 aa  289  8e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2458  major facilitator transporter  41.06 
 
 		 449 aa  288  9e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4783  major facilitator superfamily MFS_1  40.76 
 
 		 474 aa  289  9e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6236  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 454 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  40.53 
 
 		 436 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4283  major facilitator transporter  41.08 
 
 		 460 aa  288  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.445263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2701  major facilitator family transporter  39.81 
 
 		 443 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2645  major facilitator superfamily permease  39.81 
 
 		 443 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>