More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1131 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  93.81 
 
 		 436 aa  786    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2216  major facilitator family transporter  82.01 
 
 		 437 aa  655    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1307  major facilitator family transporter  81.8 
 
 		 437 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.702643  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0253  major facilitator family transporter  75.93 
 
 		 444 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1146  major facilitator transporter  82.01 
 
 		 437 aa  654    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1770  major facilitator family transporter  75 
 
 		 457 aa  636    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4390  major facilitator transporter  95.87 
 
 		 436 aa  788    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  99.77 
 
 		 436 aa  862    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2079  major facilitator family transporter  82.01 
 
 		 437 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.068435  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  95.18 
 
 		 436 aa  781    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0701  major facilitator family transporter  82.01 
 
 		 437 aa  655    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  95.41 
 
 		 436 aa  782    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  100 
 
 		 436 aa  862    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2535  major facilitator family transporter  82.01 
 
 		 437 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.805911  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1154  major facilitator transporter  81.8 
 
 		 437 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215313  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1681  major facilitator transporter  75.93 
 
 		 439 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0114815  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  95.41 
 
 		 436 aa  782    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1100  major facilitator family transporter  75.7 
 
 		 444 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341901  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0098  major facilitator family transporter  75.7 
 
 		 457 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.381076  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1162  major facilitator family transporter  75.47 
 
 		 439 aa  633  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12498  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0326  major facilitator family transporter  75.7 
 
 		 457 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544768  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1267  major facilitator family transporter  75.7 
 
 		 439 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  71.16 
 
 		 436 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  70.74 
 
 		 434 aa  584  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  69.69 
 
 		 437 aa  585  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  69.45 
 
 		 437 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1753  major facilitator family transporter  65.73 
 
 		 443 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2779  major facilitator family transporter  65.49 
 
 		 443 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1534  major facilitator family transporter  65.73 
 
 		 443 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.348841  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2262  major facilitator family transporter  65.73 
 
 		 443 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445444  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2701  major facilitator family transporter  65.49 
 
 		 443 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3057  major facilitator family transporter  65.73 
 
 		 443 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.758675  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2645  major facilitator superfamily permease  65.73 
 
 		 443 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142533  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1835  major facilitator family transporter  65.49 
 
 		 443 aa  536  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0241  major facilitator family transporter  61.92 
 
 		 524 aa  532  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  62.68 
 
 		 444 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  62.68 
 
 		 444 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  62.92 
 
 		 444 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  62.68 
 
 		 444 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  62.68 
 
 		 444 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  62.68 
 
 		 444 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2985  major facilitator family transporter  62.68 
 
 		 444 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.464085  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  61.06 
 
 		 433 aa  509  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  60.95 
 
 		 439 aa  508  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0365  major facilitator transporter  58.41 
 
 		 441 aa  501  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3082  major facilitator transporter  57.58 
 
 		 441 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5174  major facilitator transporter  59.13 
 
 		 441 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4645  major facilitator transporter  59.38 
 
 		 441 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5285  major facilitator transporter  57.58 
 
 		 441 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3435  major facilitator transporter  59.38 
 
 		 446 aa  500  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0701144  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4983  major facilitator transporter  58.41 
 
 		 441 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2147  major facilitator superfamily MFS_1  57.71 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426847  normal  0.887871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  51.55 
 
 		 427 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  49.77 
 
 		 439 aa  381  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  47.91 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  47.92 
 
 		 433 aa  378  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17780  major facilitator transporter  45.62 
 
 		 469 aa  363  4e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1545  MFS family transporter  47.06 
 
 		 470 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1113  major facilitator transporter  46.84 
 
 		 468 aa  349  6e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1540  major facilitator superfamily MFS_1  44.96 
 
 		 468 aa  349  6e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0867894 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5467  major facilitator transporter  45.75 
 
 		 471 aa  342  8e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2176  major facilitator transporter  45.16 
 
 		 470 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2068  major facilitator transporter  45.03 
 
 		 474 aa  338  8e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.680279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5919  major facilitator transporter  45.16 
 
 		 470 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2195  major facilitator transporter  45.37 
 
 		 481 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2158  major facilitator transporter  45.16 
 
 		 470 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.72 
 
 		 437 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  43.92 
 
 		 441 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  41.2 
 
 		 437 aa  319  7e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  42.51 
 
 		 468 aa  316  5e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  43.92 
 
 		 439 aa  316  6e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  41.13 
 
 		 450 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  45.18 
 
 		 439 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  44.9 
 
 		 439 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  42.76 
 
 		 439 aa  309  8e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  42.48 
 
 		 439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  42.48 
 
 		 439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  42.48 
 
 		 439 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  40.63 
 
 		 446 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  43.75 
 
 		 442 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  42.16 
 
 		 442 aa  301  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  44.33 
 
 		 461 aa  297  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  39.95 
 
 		 430 aa  297  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  42.65 
 
 		 442 aa  296  5e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  42.59 
 
 		 445 aa  296  5e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  42.35 
 
 		 439 aa  293  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2663  major facilitator superfamily MFS_1  40.86 
 
 		 446 aa  293  5e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.11892 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  39.57 
 
 		 452 aa  293  6e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  42.28 
 
 		 437 aa  292  7e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  44.79 
 
 		 442 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  40.88 
 
 		 438 aa  291  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 		 440 aa  291  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  41.11 
 
 		 431 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  40.38 
 
 		 452 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  41.32 
 
 		 433 aa  290  3e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  40.37 
 
 		 439 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  41.39 
 
 		 438 aa  289  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4036  major facilitator superfamily MFS_1  40.98 
 
 		 437 aa  289  7e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.16141  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  41.62 
 
 		 465 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  39.68 
 
 		 438 aa  288  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>