More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4783 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4783  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 474 aa  932    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2458  major facilitator transporter  52.55 
 
 		 449 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0216  major facilitator superfamily MFS_1  51.9 
 
 		 449 aa  437  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0650  major facilitator superfamily MFS_1  53.58 
 
 		 466 aa  431  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0627  major facilitator transporter  49.13 
 
 		 478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3726  major facilitator transporter  51.82 
 
 		 482 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787651  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3115  major facilitator transporter  47.23 
 
 		 462 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1912  major facilitator superfamily MFS_1  48.19 
 
 		 475 aa  378  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.162096 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46710  Major facilitator superfamily transporter  50.44 
 
 		 472 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.689171  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1342  major facilitator superfamily transporter  41.33 
 
 		 450 aa  338  1.9999999999999998e-91  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0384  major facilitator family transporter  42.6 
 
 		 453 aa  335  1e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4465  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 460 aa  333  5e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1103  major facilitator family transporter  42.32 
 
 		 464 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.338347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4290  major facilitator superfamily MFS_1  43.06 
 
 		 468 aa  315  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.720009 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1002  major facilitator superfamily MFS_1  40.58 
 
 		 468 aa  309  5.9999999999999995e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.101841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5058  major facilitator superfamily MFS_1  40.99 
 
 		 468 aa  305  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181226  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  40.43 
 
 		 450 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  39.13 
 
 		 484 aa  301  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 442 aa  300  4e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  40.42 
 
 		 465 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3276  major facilitator superfamily MFS_1  40.04 
 
 		 460 aa  297  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  37.85 
 
 		 468 aa  297  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 461 aa  296  4e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  37.61 
 
 		 450 aa  294  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  38.38 
 
 		 456 aa  290  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  41.63 
 
 		 438 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  37.93 
 
 		 461 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.06 
 
 		 438 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02410  Major Facilitator Superfamily transporter  37.9 
 
 		 467 aa  288  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.277787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  37.53 
 
 		 461 aa  286  8e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  37.53 
 
 		 461 aa  286  8e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  37.53 
 
 		 461 aa  286  8e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  38.17 
 
 		 446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  38.41 
 
 		 447 aa  283  6.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  37.45 
 
 		 460 aa  282  8.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  38.78 
 
 		 459 aa  281  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  40.92 
 
 		 443 aa  281  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2130  major facilitator superfamily MFS_1  39.7 
 
 		 464 aa  281  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  38.32 
 
 		 447 aa  281  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  40.59 
 
 		 439 aa  280  4e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1831  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  37.91 
 
 		 446 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3547  major facilitator transporter  38.89 
 
 		 440 aa  278  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189326  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1665  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  37.91 
 
 		 446 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1618  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  37.91 
 
 		 446 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1609  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  37.91 
 
 		 446 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1677  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  37.91 
 
 		 446 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.905645 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1621  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  37.64 
 
 		 455 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00533306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  38.99 
 
 		 435 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  40.31 
 
 		 460 aa  273  5.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  38.9 
 
 		 433 aa  271  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1268  major facilitator superfamily MFS_1  36.46 
 
 		 473 aa  270  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  37.99 
 
 		 439 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  36.81 
 
 		 444 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  36.66 
 
 		 452 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  37.91 
 
 		 450 aa  268  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  38.8 
 
 		 445 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  38.8 
 
 		 445 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  38.28 
 
 		 445 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  38.28 
 
 		 445 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  37.83 
 
 		 433 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1934  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.95 
 
 		 459 aa  266  5e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.307592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  38.6 
 
 		 452 aa  266  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  37.96 
 
 		 460 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  37.96 
 
 		 460 aa  266  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 458 aa  266  7e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  37.59 
 
 		 433 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  37.59 
 
 		 433 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  37.59 
 
 		 433 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  38.52 
 
 		 439 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  41.08 
 
 		 440 aa  264  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  38.52 
 
 		 439 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  38.52 
 
 		 439 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  38.52 
 
 		 439 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01502  predicted transporter  37.82 
 
 		 427 aa  263  6e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0297029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2102  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.82 
 
 		 427 aa  263  6e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410847  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1633  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  37.82 
 
 		 427 aa  263  6e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000157893  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01513  hypothetical protein  37.82 
 
 		 427 aa  263  6e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0227529  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  38.52 
 
 		 439 aa  263  6e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2115  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.82 
 
 		 427 aa  263  6e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0135318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  38.26 
 
 		 439 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1752  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  37.7 
 
 		 427 aa  261  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000473238  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  38.97 
 
 		 427 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  38.17 
 
 		 482 aa  261  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1038  major facilitator superfamily MFS_1  38.12 
 
 		 457 aa  261  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2159  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  37.59 
 
 		 427 aa  260  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0943239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  37.12 
 
 		 445 aa  261  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  35.62 
 
 		 459 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 458 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 445 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0236  shikimate transporter  36.88 
 
 		 433 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  34.77 
 
 		 430 aa  259  7e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  40.28 
 
 		 437 aa  259  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 442 aa  259  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.88 
 
 		 437 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  34.19 
 
 		 437 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  39.8 
 
 		 438 aa  257  4e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  38.14 
 
 		 441 aa  256  6e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3351  major facilitator superfamily MFS_1  36.55 
 
 		 444 aa  256  9e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0813627  normal  0.0585989 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  35.83 
 
 		 437 aa  255  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  40.98 
 
 		 438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>