More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4290 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4290  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 468 aa  929    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.720009 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4783  major facilitator superfamily MFS_1  43.06 
 
 		 474 aa  334  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0216  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 		 449 aa  313  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2458  major facilitator transporter  42.53 
 
 		 449 aa  309  8e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0650  major facilitator superfamily MFS_1  40.31 
 
 		 466 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  40.68 
 
 		 450 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1342  major facilitator superfamily transporter  37.64 
 
 		 450 aa  300  4e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  39.16 
 
 		 446 aa  293  6e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  38.41 
 
 		 447 aa  288  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  37.53 
 
 		 468 aa  286  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0384  major facilitator family transporter  36.47 
 
 		 453 aa  280  3e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4465  major facilitator transporter  38.08 
 
 		 460 aa  278  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3726  major facilitator transporter  40.85 
 
 		 482 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787651  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5058  major facilitator superfamily MFS_1  37.77 
 
 		 468 aa  274  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181226  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  38.6 
 
 		 452 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1103  major facilitator family transporter  36.99 
 
 		 464 aa  273  7e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.338347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1002  major facilitator superfamily MFS_1  36.94 
 
 		 468 aa  272  8.000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.101841 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  39.18 
 
 		 461 aa  272  9e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  38.8 
 
 		 452 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  39.24 
 
 		 435 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02410  Major Facilitator Superfamily transporter  37.61 
 
 		 467 aa  268  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.277787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  35.29 
 
 		 433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  38.81 
 
 		 444 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0236  shikimate transporter  35.53 
 
 		 433 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  35.29 
 
 		 433 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  35.29 
 
 		 433 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  35.29 
 
 		 433 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  40.33 
 
 		 450 aa  264  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  37.98 
 
 		 458 aa  265  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  38.07 
 
 		 461 aa  262  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  38.07 
 
 		 461 aa  262  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  38.07 
 
 		 461 aa  262  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3276  major facilitator superfamily MFS_1  36.58 
 
 		 460 aa  262  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  38.81 
 
 		 461 aa  259  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  37.71 
 
 		 437 aa  258  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  36.72 
 
 		 442 aa  259  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  38.15 
 
 		 456 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0627  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 478 aa  256  4e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  36.99 
 
 		 433 aa  256  5e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  36.99 
 
 		 438 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  38.71 
 
 		 447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  38.53 
 
 		 438 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  36.6 
 
 		 438 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  36.99 
 
 		 438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  37.26 
 
 		 438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  36.99 
 
 		 438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.05 
 
 		 438 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3115  major facilitator transporter  37.98 
 
 		 462 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  36.75 
 
 		 438 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  36.75 
 
 		 438 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  36.75 
 
 		 438 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  38.34 
 
 		 453 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 457 aa  253  7e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.19 
 
 		 437 aa  253  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  37.14 
 
 		 430 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 457 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 457 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  38.64 
 
 		 441 aa  251  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  39.22 
 
 		 435 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  37.83 
 
 		 439 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  39.09 
 
 		 438 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  39.22 
 
 		 435 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  39.22 
 
 		 435 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  37.29 
 
 		 435 aa  250  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1621  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  34.95 
 
 		 455 aa  250  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00533306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  38.98 
 
 		 427 aa  249  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  39.71 
 
 		 430 aa  249  9e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  36.6 
 
 		 432 aa  249  9e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  36.36 
 
 		 463 aa  248  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  39.77 
 
 		 439 aa  249  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  37.05 
 
 		 435 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  37.05 
 
 		 434 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  37.05 
 
 		 435 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  35.01 
 
 		 437 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2147  major facilitator superfamily MFS_1  37.77 
 
 		 434 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426847  normal  0.887871 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2130  major facilitator superfamily MFS_1  34.73 
 
 		 464 aa  247  4e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  37.98 
 
 		 442 aa  247  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  37.29 
 
 		 435 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  37.29 
 
 		 435 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  37.28 
 
 		 441 aa  246  6e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  36.5 
 
 		 439 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  37.14 
 
 		 435 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  36.5 
 
 		 439 aa  246  9e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  36.08 
 
 		 465 aa  246  9e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5092  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 		 493 aa  245  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  36 
 
 		 441 aa  245  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  35.94 
 
 		 440 aa  245  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  36.5 
 
 		 439 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  35.01 
 
 		 439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  39.68 
 
 		 439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  36.98 
 
 		 439 aa  244  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  36.5 
 
 		 439 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  33.48 
 
 		 465 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  36.5 
 
 		 439 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  36.5 
 
 		 439 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  36.36 
 
 		 435 aa  243  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0117  major facilitator superfamily MFS_1  37.14 
 
 		 444 aa  243  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3435  major facilitator transporter  36.67 
 
 		 446 aa  243  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0701144  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  38.61 
 
 		 446 aa  243  7e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3484  major facilitator transporter  37.72 
 
 		 468 aa  243  7.999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>