More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2130 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2130  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 464 aa  898    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1002  major facilitator superfamily MFS_1  69.85 
 
 		 468 aa  656    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.101841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5058  major facilitator superfamily MFS_1  76.02 
 
 		 468 aa  684    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181226  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02410  Major Facilitator Superfamily transporter  72.69 
 
 		 467 aa  634  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.277787  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3276  major facilitator superfamily MFS_1  68.79 
 
 		 460 aa  607  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1038  major facilitator superfamily MFS_1  55.13 
 
 		 457 aa  496  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1934  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  53.1 
 
 		 459 aa  492  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.307592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1621  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  53.22 
 
 		 455 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00533306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1268  major facilitator superfamily MFS_1  53.78 
 
 		 473 aa  486  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0804  major facilitator superfamily MFS_1  55.38 
 
 		 457 aa  483  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319544  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1609  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  54.84 
 
 		 446 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1677  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  54.84 
 
 		 446 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.905645 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1618  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  54.84 
 
 		 446 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1665  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  54.84 
 
 		 446 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1831  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  54.84 
 
 		 446 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2637  major facilitator superfamily MFS_1  52.97 
 
 		 473 aa  465  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01502  predicted transporter  51.99 
 
 		 427 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0297029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2102  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  51.99 
 
 		 427 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410847  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01513  hypothetical protein  51.99 
 
 		 427 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0227529  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2159  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  51.99 
 
 		 427 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0943239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1633  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  51.99 
 
 		 427 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000157893  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2115  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  51.99 
 
 		 427 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0135318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1752  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  51.99 
 
 		 427 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000473238  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0384  major facilitator family transporter  45.43 
 
 		 453 aa  414  1e-114  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1342  major facilitator superfamily transporter  45.31 
 
 		 450 aa  414  1e-114  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1103  major facilitator family transporter  45.76 
 
 		 464 aa  403  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.338347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4465  major facilitator transporter  45.34 
 
 		 460 aa  401  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0650  major facilitator superfamily MFS_1  40.93 
 
 		 466 aa  318  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4783  major facilitator superfamily MFS_1  39.7 
 
 		 474 aa  301  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  38.12 
 
 		 447 aa  293  4e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 		 435 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  37.7 
 
 		 446 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0216  major facilitator superfamily MFS_1  37.99 
 
 		 449 aa  282  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3115  major facilitator transporter  39.22 
 
 		 462 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  38.21 
 
 		 442 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  37.96 
 
 		 468 aa  273  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1912  major facilitator superfamily MFS_1  39.87 
 
 		 475 aa  271  1e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.162096 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2458  major facilitator transporter  37.07 
 
 		 449 aa  268  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  36.6 
 
 		 456 aa  263  6e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4108  major facilitator family transporter  37.53 
 
 		 449 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.073539  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4135  general substrate transporter  37.53 
 
 		 449 aa  262  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  36.63 
 
 		 461 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  36.63 
 
 		 461 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 450 aa  260  3e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  36.63 
 
 		 461 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0627  major facilitator transporter  36.98 
 
 		 478 aa  260  4e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  35.59 
 
 		 439 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  35.46 
 
 		 439 aa  259  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  36.44 
 
 		 439 aa  259  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  36.67 
 
 		 435 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  36.67 
 
 		 435 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  36.67 
 
 		 435 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  35.37 
 
 		 439 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  37.31 
 
 		 447 aa  257  4e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  33.86 
 
 		 437 aa  256  5e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  34.17 
 
 		 438 aa  256  8e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  34.17 
 
 		 438 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  34.17 
 
 		 438 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  34.17 
 
 		 438 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3726  major facilitator transporter  36.67 
 
 		 482 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787651  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  35.67 
 
 		 451 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  35.35 
 
 		 439 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  33.94 
 
 		 438 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  33.94 
 
 		 438 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 		 461 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1848  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 447 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276958 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  35.23 
 
 		 441 aa  253  6e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  33.94 
 
 		 438 aa  252  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  33.94 
 
 		 438 aa  252  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  36.53 
 
 		 433 aa  252  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  36.79 
 
 		 435 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  35.93 
 
 		 430 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  35.13 
 
 		 434 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 457 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  36.77 
 
 		 437 aa  249  7e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  34.72 
 
 		 435 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 457 aa  249  8e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  36.68 
 
 		 439 aa  249  8e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  34.72 
 
 		 435 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 457 aa  249  8e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  36.7 
 
 		 460 aa  249  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  34.68 
 
 		 440 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  34.95 
 
 		 435 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  34.95 
 
 		 435 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 461 aa  248  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  35.63 
 
 		 439 aa  247  3e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  34.49 
 
 		 435 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  34.72 
 
 		 435 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  35.12 
 
 		 433 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  35.12 
 
 		 450 aa  246  6e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  36.41 
 
 		 441 aa  245  9e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  35.12 
 
 		 433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  35.12 
 
 		 433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  34.47 
 
 		 439 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  34.59 
 
 		 435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  34.02 
 
 		 430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  34.56 
 
 		 442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0363  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  39.55 
 
 		 302 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46710  Major facilitator superfamily transporter  38.13 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.689171  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  34.88 
 
 		 433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>