More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0363 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0384  major facilitator family transporter  100 
 
 
453 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0363  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  100 
 
 
302 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1342  major facilitator superfamily transporter  88.08 
 
 
450 aa  550  1e-156  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1103  major facilitator family transporter  72.88 
 
 
464 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.338347  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4465  major facilitator transporter  69.87 
 
 
460 aa  440  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1002  major facilitator superfamily MFS_1  38.44 
 
 
468 aa  253  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.101841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5058  major facilitator superfamily MFS_1  38.66 
 
 
468 aa  240  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181226  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3276  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 
460 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02410  Major Facilitator Superfamily transporter  38.29 
 
 
467 aa  229  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.277787  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1934  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.5 
 
 
459 aa  229  5e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.307592  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1268  major facilitator superfamily MFS_1  37.05 
 
 
473 aa  224  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2130  major facilitator superfamily MFS_1  39.55 
 
 
464 aa  223  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01502  predicted transporter  36.51 
 
 
427 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0297029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2102  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  36.51 
 
 
427 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410847  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1633  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  36.51 
 
 
427 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000157893  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2115  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.51 
 
 
427 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0135318  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01513  hypothetical protein  36.51 
 
 
427 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0227529  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1621  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  36.51 
 
 
455 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00533306  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1752  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  36.51 
 
 
427 aa  222  7e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000473238  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1038  major facilitator superfamily MFS_1  36.57 
 
 
457 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2159  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  36.51 
 
 
427 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0943239  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2637  major facilitator superfamily MFS_1  36.81 
 
 
473 aa  215  9e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1609  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  36.79 
 
 
446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1618  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  36.79 
 
 
446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1677  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  36.79 
 
 
446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.905645 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1665  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  36.79 
 
 
446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1831  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  36.45 
 
 
446 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0804  major facilitator superfamily MFS_1  36.79 
 
 
457 aa  206  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319544  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0627  major facilitator transporter  35.44 
 
 
478 aa  194  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475758  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0650  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 
466 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4783  major facilitator superfamily MFS_1  37.17 
 
 
474 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0216  major facilitator superfamily MFS_1  36.89 
 
 
449 aa  188  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  35.17 
 
 
468 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46710  Major facilitator superfamily transporter  35.46 
 
 
472 aa  182  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.689171  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  32.66 
 
 
442 aa  179  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3115  major facilitator transporter  33.33 
 
 
462 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  33.33 
 
 
442 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  34.33 
 
 
430 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2458  major facilitator transporter  35.06 
 
 
449 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3726  major facilitator transporter  33.66 
 
 
482 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787651  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  35.93 
 
 
435 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  36.51 
 
 
439 aa  168  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1912  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 
475 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.162096 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  32.77 
 
 
461 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  32.12 
 
 
461 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  32.12 
 
 
461 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  32.12 
 
 
461 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  34.63 
 
 
438 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.56 
 
 
438 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  35.31 
 
 
438 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  36.03 
 
 
438 aa  152  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  34.56 
 
 
431 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 
461 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  31.23 
 
 
450 aa  149  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  32.42 
 
 
441 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  32.01 
 
 
444 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  33.56 
 
 
447 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  30.46 
 
 
484 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4290  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 
468 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.720009 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  34.33 
 
 
446 aa  147  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  31.96 
 
 
445 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  33.89 
 
 
440 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  29.57 
 
 
450 aa  145  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  31.51 
 
 
460 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  31.51 
 
 
460 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  29.69 
 
 
455 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  29.21 
 
 
430 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  31.62 
 
 
445 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  30.79 
 
 
456 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  31.27 
 
 
445 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  31.27 
 
 
445 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  32.74 
 
 
445 aa  142  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  32.3 
 
 
433 aa  142  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  32.44 
 
 
437 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  31.13 
 
 
447 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6236  major facilitator transporter  30.38 
 
 
454 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7098  major facilitator transporter  30.03 
 
 
456 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  32 
 
 
460 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  28.67 
 
 
459 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  32.2 
 
 
435 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  30.13 
 
 
460 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  32.2 
 
 
435 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  32.2 
 
 
435 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  27.91 
 
 
451 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  32.32 
 
 
452 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  32.42 
 
 
439 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4108  major facilitator family transporter  32.08 
 
 
449 aa  136  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.073539  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4135  general substrate transporter  32.08 
 
 
449 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  28.66 
 
 
436 aa  135  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  28.81 
 
 
458 aa  135  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  31.35 
 
 
459 aa  135  9e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  31.4 
 
 
433 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  31.4 
 
 
433 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  31.4 
 
 
433 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  31.4 
 
 
433 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  30.93 
 
 
445 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 
452 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  31.06 
 
 
439 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  31.06 
 
 
439 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0236  shikimate transporter  31.06 
 
 
433 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>