More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0804 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01502  predicted transporter  81.52 
 
 		 427 aa  698    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0297029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2102  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  81.52 
 
 		 427 aa  698    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410847  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1633  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  81.52 
 
 		 427 aa  698    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000157893  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1677  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  83.06 
 
 		 446 aa  725    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.905645 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1665  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  83.06 
 
 		 446 aa  725    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1268  major facilitator superfamily MFS_1  81.58 
 
 		 473 aa  736    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1618  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  83.06 
 
 		 446 aa  725    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0804  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 457 aa  917    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319544  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1934  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  85.27 
 
 		 459 aa  773    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.307592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1609  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  83.06 
 
 		 446 aa  725    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2637  major facilitator superfamily MFS_1  82.2 
 
 		 473 aa  710    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2159  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  81.28 
 
 		 427 aa  695    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0943239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1621  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  81.66 
 
 		 455 aa  740    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00533306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2115  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  81.52 
 
 		 427 aa  698    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0135318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01513  hypothetical protein  81.52 
 
 		 427 aa  698    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0227529  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1038  major facilitator superfamily MFS_1  96.28 
 
 		 457 aa  860    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1831  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  82.83 
 
 		 446 aa  722    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1752  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  81.52 
 
 		 427 aa  698    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000473238  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02410  Major Facilitator Superfamily transporter  60.34 
 
 		 467 aa  550  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.277787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5058  major facilitator superfamily MFS_1  56.76 
 
 		 468 aa  514  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181226  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1002  major facilitator superfamily MFS_1  55.22 
 
 		 468 aa  514  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.101841 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3276  major facilitator superfamily MFS_1  54.88 
 
 		 460 aa  496  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2130  major facilitator superfamily MFS_1  56.03 
 
 		 464 aa  475  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1342  major facilitator superfamily transporter  42.54 
 
 		 450 aa  385  1e-106  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0384  major facilitator family transporter  43.81 
 
 		 453 aa  380  1e-104  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4465  major facilitator transporter  41.88 
 
 		 460 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1103  major facilitator family transporter  40.48 
 
 		 464 aa  361  2e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.338347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0650  major facilitator superfamily MFS_1  35.39 
 
 		 466 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4783  major facilitator superfamily MFS_1  36.92 
 
 		 474 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3115  major facilitator transporter  37.11 
 
 		 462 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  35.55 
 
 		 468 aa  249  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3726  major facilitator transporter  36.48 
 
 		 482 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787651  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  34.76 
 
 		 446 aa  246  6e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0627  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 478 aa  245  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  34.44 
 
 		 447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 457 aa  243  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 457 aa  242  9e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 457 aa  242  9e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  33.18 
 
 		 436 aa  240  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 442 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 435 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 435 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 435 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 439 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 439 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  33.48 
 
 		 440 aa  237  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  33.48 
 
 		 439 aa  235  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  33.64 
 
 		 430 aa  236  9e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  32.88 
 
 		 437 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3162  major facilitator transporter  34 
 
 		 457 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.688084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0363  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  38.19 
 
 		 302 aa  233  7.000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 450 aa  232  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4754  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 467 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2224  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 457 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0671964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0216  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 449 aa  230  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  31.32 
 
 		 438 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  31.32 
 
 		 438 aa  229  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3363  major facilitator transporter  33.63 
 
 		 457 aa  230  5e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124155  normal  0.451531 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  31.32 
 
 		 438 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2553  major facilitator family transporter  33.56 
 
 		 457 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0427116  decreased coverage  0.00798136 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 450 aa  229  6e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  31.46 
 
 		 438 aa  229  6e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  34.61 
 
 		 434 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  31.32 
 
 		 438 aa  229  9e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6411  major facilitator transporter  36.75 
 
 		 461 aa  229  9e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  31.46 
 
 		 438 aa  229  9e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  31.46 
 
 		 438 aa  228  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  33.03 
 
 		 439 aa  229  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3319  major facilitator superfamily MFS_1  36.48 
 
 		 469 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 435 aa  228  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  33.71 
 
 		 461 aa  228  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 441 aa  228  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0121  major facilitator superfamily MFS_1  36.22 
 
 		 468 aa  226  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0299314  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  31.54 
 
 		 438 aa  227  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1594  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 442 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000379312 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5092  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 		 493 aa  226  6e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1912  major facilitator superfamily MFS_1  34.89 
 
 		 475 aa  226  7e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.162096 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  32.72 
 
 		 430 aa  226  8e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 439 aa  225  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  33.49 
 
 		 442 aa  225  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  33.26 
 
 		 439 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46710  Major facilitator superfamily transporter  34.84 
 
 		 472 aa  224  4e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.689171  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  33.18 
 
 		 461 aa  224  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  33.18 
 
 		 461 aa  224  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  33.18 
 
 		 461 aa  224  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0634  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 461 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4290  major facilitator superfamily MFS_1  33.92 
 
 		 468 aa  223  7e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.720009 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2458  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 449 aa  223  7e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  34.13 
 
 		 452 aa  223  8e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  33.48 
 
 		 456 aa  223  8e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  35.14 
 
 		 433 aa  222  9e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 439 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 451 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5790  major facilitator superfamily MFS_1  36.65 
 
 		 477 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.339463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  33.18 
 
 		 439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 		 435 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4438  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 464 aa  221  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357208  normal  0.925745 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 458 aa  221  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 461 aa  219  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  32.15 
 
 		 460 aa  219  7e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>