More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5092 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5092  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 493 aa  962    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  58.28 
 
 		 453 aa  511  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0117  major facilitator superfamily MFS_1  59.38 
 
 		 444 aa  491  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4082  major facilitator transporter  52.06 
 
 		 439 aa  455  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3858  major facilitator superfamily MFS_1  52.25 
 
 		 439 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2329  major facilitator superfamily MFS_1  54.05 
 
 		 452 aa  442  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126091  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4438  major facilitator transporter  51.74 
 
 		 464 aa  425  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357208  normal  0.925745 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0634  major facilitator transporter  50.58 
 
 		 461 aa  420  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4413  major facilitator superfamily MFS_1  49.08 
 
 		 461 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.906196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4303  major facilitator superfamily MFS_1  49.08 
 
 		 461 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.625349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5790  major facilitator superfamily MFS_1  46.77 
 
 		 477 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.339463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4754  major facilitator transporter  47.31 
 
 		 467 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  48.05 
 
 		 458 aa  413  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6411  major facilitator transporter  47.28 
 
 		 461 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5797  major facilitator transporter  48.72 
 
 		 477 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3319  major facilitator superfamily MFS_1  49.07 
 
 		 469 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3484  major facilitator transporter  52.49 
 
 		 468 aa  409  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0121  major facilitator superfamily MFS_1  48.95 
 
 		 468 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0299314  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0190  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  48.04 
 
 		 459 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2248  major facilitator superfamily MFS_1  50.93 
 
 		 463 aa  402  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169754  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2553  major facilitator family transporter  45.96 
 
 		 457 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0427116  decreased coverage  0.00798136 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2224  major facilitator transporter  46.65 
 
 		 457 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0671964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3363  major facilitator transporter  46.53 
 
 		 457 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124155  normal  0.451531 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3162  major facilitator transporter  45.73 
 
 		 457 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.688084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5800  major facilitator superfamily MFS_1  48.83 
 
 		 477 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000483558  normal  0.391929 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5816  major facilitator superfamily MFS_1  47.56 
 
 		 468 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3499  major facilitator transporter  45.34 
 
 		 442 aa  356  5.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  43.23 
 
 		 450 aa  344  2e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2371  major facilitator transporter  46.46 
 
 		 406 aa  338  1.9999999999999998e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.363547  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0102  major facilitator superfamily MFS_1  44.6 
 
 		 456 aa  334  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 		 446 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  44.94 
 
 		 441 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  40.8 
 
 		 447 aa  305  9.000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  46.6 
 
 		 432 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  46.6 
 
 		 432 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  46.6 
 
 		 432 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  39.39 
 
 		 440 aa  292  8e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  38.2 
 
 		 433 aa  282  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  40.62 
 
 		 443 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0236  shikimate transporter  38.44 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  38.2 
 
 		 433 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  38.2 
 
 		 433 aa  280  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  38.2 
 
 		 433 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  40.48 
 
 		 461 aa  276  6e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  42.42 
 
 		 442 aa  275  9e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  38.93 
 
 		 482 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  39.28 
 
 		 451 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  41.42 
 
 		 437 aa  273  6e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  39.23 
 
 		 468 aa  272  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  37.83 
 
 		 439 aa  271  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  42.63 
 
 		 446 aa  271  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  42.03 
 
 		 433 aa  270  4e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  37.94 
 
 		 441 aa  270  4e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  39.3 
 
 		 438 aa  270  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  40.65 
 
 		 439 aa  269  7e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  37.25 
 
 		 457 aa  269  7e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  37.25 
 
 		 457 aa  269  8e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  37.25 
 
 		 457 aa  269  8e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  35.66 
 
 		 430 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  39 
 
 		 445 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6090  major facilitator transporter  42.09 
 
 		 450 aa  265  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.78 
 
 		 438 aa  264  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  40.61 
 
 		 442 aa  263  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  37.62 
 
 		 430 aa  263  6e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 465 aa  262  8e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  40.97 
 
 		 427 aa  263  8e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  41.51 
 
 		 435 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1346  major facilitator superfamily MFS_1  36.74 
 
 		 472 aa  262  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63119  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  39.42 
 
 		 430 aa  262  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  38.06 
 
 		 461 aa  261  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  40.34 
 
 		 452 aa  260  3e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  35.45 
 
 		 436 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  36.19 
 
 		 433 aa  259  7e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  42.52 
 
 		 438 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  39.76 
 
 		 442 aa  258  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  36.19 
 
 		 461 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  36.19 
 
 		 461 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  36.19 
 
 		 461 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  40.37 
 
 		 442 aa  257  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5919  major facilitator transporter  36.89 
 
 		 470 aa  256  8e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2158  major facilitator transporter  36.89 
 
 		 470 aa  256  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2176  major facilitator transporter  36.67 
 
 		 470 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  36.98 
 
 		 460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  39.47 
 
 		 433 aa  254  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3351  major facilitator superfamily MFS_1  37.38 
 
 		 444 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0813627  normal  0.0585989 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  40.62 
 
 		 437 aa  253  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4283  major facilitator transporter  39.85 
 
 		 460 aa  253  5.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.445263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  40.57 
 
 		 456 aa  253  8.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  34.62 
 
 		 437 aa  252  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  36.52 
 
 		 437 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  39.38 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  39.62 
 
 		 458 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1848  major facilitator transporter  37.73 
 
 		 447 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276958 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2736  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.53 
 
 		 438 aa  250  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  34.75 
 
 		 456 aa  250  5e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  38.55 
 
 		 445 aa  249  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3101  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.32 
 
 		 438 aa  249  6e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  35.45 
 
 		 460 aa  249  8e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  36.43 
 
 		 447 aa  249  9e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>