More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5797 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4413  major facilitator superfamily MFS_1  67.17 
 
 		 461 aa  645    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.906196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0121  major facilitator superfamily MFS_1  69.57 
 
 		 468 aa  657    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0299314  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3319  major facilitator superfamily MFS_1  66.81 
 
 		 469 aa  653    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6411  major facilitator transporter  67.39 
 
 		 461 aa  648    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5790  major facilitator superfamily MFS_1  83.61 
 
 		 477 aa  827    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.339463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5800  major facilitator superfamily MFS_1  80.67 
 
 		 477 aa  783    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000483558  normal  0.391929 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5797  major facilitator transporter  100 
 
 		 477 aa  957    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4754  major facilitator transporter  70.58 
 
 		 467 aa  660    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4303  major facilitator superfamily MFS_1  67.17 
 
 		 461 aa  645    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.625349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0634  major facilitator transporter  67.25 
 
 		 461 aa  633  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4438  major facilitator transporter  66.3 
 
 		 464 aa  633  1e-180  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357208  normal  0.925745 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5816  major facilitator superfamily MFS_1  64.52 
 
 		 468 aa  619  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0190  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  62.91 
 
 		 459 aa  617  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2224  major facilitator transporter  63.76 
 
 		 457 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0671964  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2553  major facilitator family transporter  63.31 
 
 		 457 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0427116  decreased coverage  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3162  major facilitator transporter  63.53 
 
 		 457 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.688084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3363  major facilitator transporter  62.64 
 
 		 457 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124155  normal  0.451531 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2248  major facilitator superfamily MFS_1  62.61 
 
 		 463 aa  559  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169754  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2371  major facilitator transporter  62.16 
 
 		 406 aa  524  1e-147  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.363547  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0102  major facilitator superfamily MFS_1  53.65 
 
 		 456 aa  442  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5092  major facilitator superfamily MFS_1  48.72 
 
 		 493 aa  415  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  45.8 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0117  major facilitator superfamily MFS_1  46.56 
 
 		 444 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 458 aa  350  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2329  major facilitator superfamily MFS_1  41.37 
 
 		 452 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126091  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3484  major facilitator transporter  42.95 
 
 		 468 aa  332  1e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3499  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 442 aa  330  5.0000000000000004e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4082  major facilitator transporter  42.06 
 
 		 439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3858  major facilitator superfamily MFS_1  42.66 
 
 		 439 aa  325  1e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  38.78 
 
 		 450 aa  303  5.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  42.26 
 
 		 446 aa  300  4e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  40.84 
 
 		 447 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  37.15 
 
 		 430 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  39.68 
 
 		 443 aa  277  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  39.04 
 
 		 442 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  38.14 
 
 		 440 aa  274  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  37.41 
 
 		 468 aa  270  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  39.05 
 
 		 441 aa  270  5e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  38.9 
 
 		 482 aa  269  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  38.39 
 
 		 461 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  38.39 
 
 		 461 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  38.39 
 
 		 461 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  38.16 
 
 		 433 aa  262  8e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  38.36 
 
 		 447 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  39.61 
 
 		 450 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  37.86 
 
 		 466 aa  258  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  38.11 
 
 		 447 aa  258  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 439 aa  257  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  40.51 
 
 		 432 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  37.77 
 
 		 461 aa  257  3e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  40.51 
 
 		 432 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.78 
 
 		 437 aa  257  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  40.51 
 
 		 432 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  38.34 
 
 		 438 aa  256  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  36.56 
 
 		 446 aa  256  5e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  39.31 
 
 		 465 aa  256  6e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  35.79 
 
 		 456 aa  256  9e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1848  major facilitator transporter  38.16 
 
 		 447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276958 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  40.13 
 
 		 463 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  40.13 
 
 		 463 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  40.13 
 
 		 463 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  36.14 
 
 		 455 aa  253  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 439 aa  253  7e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.83 
 
 		 438 aa  252  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  36.76 
 
 		 452 aa  252  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  39.37 
 
 		 436 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.31 
 
 		 437 aa  250  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  35.71 
 
 		 484 aa  249  8e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  37.62 
 
 		 461 aa  249  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  39.31 
 
 		 439 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  39.31 
 
 		 439 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  39.31 
 
 		 439 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  36.16 
 
 		 439 aa  247  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  38.79 
 
 		 439 aa  246  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  37.82 
 
 		 444 aa  247  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  39.31 
 
 		 439 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  36.3 
 
 		 460 aa  246  6.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  35.65 
 
 		 433 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  39.55 
 
 		 454 aa  246  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 457 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  35.65 
 
 		 433 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  38.56 
 
 		 452 aa  245  9.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  35.65 
 
 		 433 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 457 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  33.51 
 
 		 465 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  38.99 
 
 		 439 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  35.65 
 
 		 433 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 457 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  36.59 
 
 		 451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1269  general substrate transporter  34.57 
 
 		 470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  35.34 
 
 		 437 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  36.14 
 
 		 452 aa  243  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1314  General substrate transporter  34.33 
 
 		 470 aa  243  6e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012233 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0644  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  36.83 
 
 		 442 aa  243  6e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  37.83 
 
 		 430 aa  243  6e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0236  shikimate transporter  35.41 
 
 		 433 aa  243  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  39.31 
 
 		 438 aa  243  7.999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  35.84 
 
 		 435 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  34.11 
 
 		 435 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  35.84 
 
 		 435 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>