More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3499 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3499  major facilitator transporter  100 
 
 
442 aa  882    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  48.82 
 
 
458 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4082  major facilitator transporter  47.49 
 
 
439 aa  395  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3858  major facilitator superfamily MFS_1  46.78 
 
 
439 aa  397  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  46.44 
 
 
453 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0117  major facilitator superfamily MFS_1  47.36 
 
 
444 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3484  major facilitator transporter  50 
 
 
468 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5092  major facilitator superfamily MFS_1  45.86 
 
 
493 aa  372  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2329  major facilitator superfamily MFS_1  43.43 
 
 
452 aa  361  1e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126091  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5790  major facilitator superfamily MFS_1  42.96 
 
 
477 aa  352  8e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.339463  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4754  major facilitator transporter  44.39 
 
 
467 aa  349  6e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108309  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0190  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  42.53 
 
 
459 aa  339  4e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4303  major facilitator superfamily MFS_1  41.82 
 
 
461 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.625349  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4413  major facilitator superfamily MFS_1  41.82 
 
 
461 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.906196  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3319  major facilitator superfamily MFS_1  42.49 
 
 
469 aa  338  8e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0121  major facilitator superfamily MFS_1  43.32 
 
 
468 aa  336  5e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0299314  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5797  major facilitator transporter  42.17 
 
 
477 aa  336  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4438  major facilitator transporter  42.19 
 
 
464 aa  335  7.999999999999999e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357208  normal  0.925745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3363  major facilitator transporter  42.92 
 
 
457 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124155  normal  0.451531 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2224  major facilitator transporter  43.39 
 
 
457 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0671964  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3162  major facilitator transporter  42.56 
 
 
457 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.688084  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2553  major facilitator family transporter  42.33 
 
 
457 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0427116  decreased coverage  0.00798136 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0634  major facilitator transporter  41.47 
 
 
461 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6411  major facilitator transporter  41.34 
 
 
461 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5800  major facilitator superfamily MFS_1  42.11 
 
 
477 aa  325  9e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000483558  normal  0.391929 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5816  major facilitator superfamily MFS_1  42.02 
 
 
468 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2248  major facilitator superfamily MFS_1  42.36 
 
 
463 aa  310  4e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169754  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  41.27 
 
 
450 aa  295  9e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0102  major facilitator superfamily MFS_1  40.75 
 
 
456 aa  289  7e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  37.97 
 
 
450 aa  286  7e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  39.34 
 
 
446 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  37.76 
 
 
438 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.57 
 
 
437 aa  279  7e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  37.22 
 
 
437 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  37.96 
 
 
447 aa  277  3e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  39.11 
 
 
445 aa  276  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  39.01 
 
 
445 aa  276  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.48 
 
 
438 aa  276  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  35.48 
 
 
437 aa  275  8e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  39.11 
 
 
445 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  35.87 
 
 
438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.87 
 
 
438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  35.87 
 
 
438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  35.87 
 
 
438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  35.87 
 
 
438 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  38.88 
 
 
460 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  35.87 
 
 
438 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  35.87 
 
 
438 aa  273  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  38.57 
 
 
443 aa  273  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  37.26 
 
 
435 aa  273  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  38.88 
 
 
445 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  38.88 
 
 
445 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  35.63 
 
 
438 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  40.28 
 
 
451 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  38.88 
 
 
460 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2371  major facilitator transporter  39.84 
 
 
406 aa  272  7e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.363547  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  35.29 
 
 
435 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  35.29 
 
 
435 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  35.29 
 
 
435 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  35.53 
 
 
435 aa  270  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  38.16 
 
 
461 aa  270  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  35.53 
 
 
435 aa  270  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  36.62 
 
 
439 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  35.76 
 
 
435 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  35.51 
 
 
434 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  36.38 
 
 
439 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  35.21 
 
 
439 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  36.96 
 
 
442 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  40.29 
 
 
435 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  37.44 
 
 
461 aa  264  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  37.44 
 
 
441 aa  264  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  36.22 
 
 
468 aa  264  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  37.7 
 
 
442 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  39.41 
 
 
436 aa  263  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  34.46 
 
 
465 aa  262  8e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  37.33 
 
 
452 aa  261  2e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  35.8 
 
 
439 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  35.8 
 
 
439 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  38.71 
 
 
436 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  35.8 
 
 
439 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4390  major facilitator transporter  38.61 
 
 
436 aa  260  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  34.63 
 
 
465 aa  260  4e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  36.08 
 
 
452 aa  260  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  39.21 
 
 
436 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  39.21 
 
 
436 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  39.53 
 
 
446 aa  259  5.0000000000000005e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  40.05 
 
 
437 aa  259  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  37.1 
 
 
442 aa  259  9e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  34.35 
 
 
461 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  35.56 
 
 
439 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  38.46 
 
 
436 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  34.35 
 
 
461 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  34.35 
 
 
461 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  35.31 
 
 
439 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  38.46 
 
 
436 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  35.85 
 
 
452 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  38.19 
 
 
442 aa  257  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  38.1 
 
 
433 aa  257  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  35.42 
 
 
430 aa  256  4e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  35.4 
 
 
484 aa  256  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>