More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3484 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3484  major facilitator transporter  100 
 
 		 468 aa  933    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  64.17 
 
 		 458 aa  559  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5092  major facilitator superfamily MFS_1  52.49 
 
 		 493 aa  423  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  48.37 
 
 		 453 aa  420  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0117  major facilitator superfamily MFS_1  49.64 
 
 		 444 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4082  major facilitator transporter  47.32 
 
 		 439 aa  396  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3858  major facilitator superfamily MFS_1  46.81 
 
 		 439 aa  392  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2329  major facilitator superfamily MFS_1  46.68 
 
 		 452 aa  383  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126091  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3499  major facilitator transporter  49.51 
 
 		 442 aa  373  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3319  major facilitator superfamily MFS_1  42.53 
 
 		 469 aa  364  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5790  major facilitator superfamily MFS_1  43.48 
 
 		 477 aa  352  7e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.339463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  44.76 
 
 		 450 aa  352  8.999999999999999e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4438  major facilitator transporter  43.22 
 
 		 464 aa  351  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357208  normal  0.925745 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0634  major facilitator transporter  42.5 
 
 		 461 aa  350  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4413  major facilitator superfamily MFS_1  42.49 
 
 		 461 aa  350  4e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.906196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4303  major facilitator superfamily MFS_1  42.49 
 
 		 461 aa  350  4e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.625349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6411  major facilitator transporter  40.53 
 
 		 461 aa  347  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0121  major facilitator superfamily MFS_1  41.31 
 
 		 468 aa  341  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0299314  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2224  major facilitator transporter  40.74 
 
 		 457 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0671964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4754  major facilitator transporter  41.57 
 
 		 467 aa  341  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0190  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  41.4 
 
 		 459 aa  339  5e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5797  major facilitator transporter  43.08 
 
 		 477 aa  340  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3363  major facilitator transporter  40.7 
 
 		 457 aa  339  8e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124155  normal  0.451531 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2553  major facilitator family transporter  40.23 
 
 		 457 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0427116  decreased coverage  0.00798136 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5816  major facilitator superfamily MFS_1  41.72 
 
 		 468 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3162  major facilitator transporter  40 
 
 		 457 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.688084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5800  major facilitator superfamily MFS_1  43.68 
 
 		 477 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000483558  normal  0.391929 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2248  major facilitator superfamily MFS_1  40.76 
 
 		 463 aa  319  5e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169754  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0102  major facilitator superfamily MFS_1  41.26 
 
 		 456 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  40.27 
 
 		 446 aa  295  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2371  major facilitator transporter  40.84 
 
 		 406 aa  293  6e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.363547  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  40.68 
 
 		 447 aa  292  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  39.68 
 
 		 437 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  37.65 
 
 		 430 aa  289  6e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  40.52 
 
 		 439 aa  289  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  39.34 
 
 		 437 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  40.87 
 
 		 438 aa  288  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  38.65 
 
 		 468 aa  283  6.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  41.33 
 
 		 443 aa  283  6.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.59 
 
 		 438 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  41.98 
 
 		 439 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  41.98 
 
 		 439 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  41.98 
 
 		 439 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  41.56 
 
 		 439 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  40.93 
 
 		 439 aa  279  7e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  38.52 
 
 		 438 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  40.93 
 
 		 439 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  38.52 
 
 		 438 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  38.52 
 
 		 438 aa  278  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  38.52 
 
 		 438 aa  277  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  38.28 
 
 		 438 aa  277  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  38.28 
 
 		 438 aa  277  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  36.99 
 
 		 436 aa  277  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  37.72 
 
 		 458 aa  277  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  42.62 
 
 		 440 aa  277  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  38.28 
 
 		 438 aa  277  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  38.28 
 
 		 438 aa  277  4e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  42.39 
 
 		 465 aa  276  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  38.98 
 
 		 482 aa  276  8e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.37 
 
 		 437 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  38.71 
 
 		 439 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  38.62 
 
 		 461 aa  273  5.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  35.16 
 
 		 465 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  38.97 
 
 		 437 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  37.77 
 
 		 450 aa  271  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  37.53 
 
 		 439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  35.57 
 
 		 465 aa  270  4e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  38.6 
 
 		 438 aa  270  5.9999999999999995e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  38.93 
 
 		 437 aa  269  7e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  36.6 
 
 		 435 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  38.05 
 
 		 435 aa  266  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  36.6 
 
 		 435 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  37.53 
 
 		 439 aa  266  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  36.9 
 
 		 459 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  36.07 
 
 		 434 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  41.41 
 
 		 441 aa  263  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  38.05 
 
 		 439 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  37.27 
 
 		 457 aa  262  8e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  37.27 
 
 		 457 aa  262  8e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  37.27 
 
 		 457 aa  262  8e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  37.74 
 
 		 442 aa  262  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  39.08 
 
 		 455 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  35.58 
 
 		 435 aa  262  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  35.92 
 
 		 435 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  35.92 
 
 		 435 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  35.95 
 
 		 433 aa  261  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  37.38 
 
 		 433 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1346  major facilitator superfamily MFS_1  38.5 
 
 		 472 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63119  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  37.14 
 
 		 433 aa  259  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  38.14 
 
 		 461 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  37.14 
 
 		 433 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  38.14 
 
 		 461 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  38.04 
 
 		 434 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  35.68 
 
 		 435 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  38.14 
 
 		 461 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  38.18 
 
 		 445 aa  257  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  35.86 
 
 		 439 aa  257  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  36.9 
 
 		 433 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0236  shikimate transporter  37.14 
 
 		 433 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 436 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>