More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5800 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4754  major facilitator transporter  69.8 
 
 		 467 aa  648    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3319  major facilitator superfamily MFS_1  64.92 
 
 		 469 aa  644    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0121  major facilitator superfamily MFS_1  67.54 
 
 		 468 aa  639    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0299314  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5800  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 477 aa  953    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000483558  normal  0.391929 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5797  major facilitator transporter  80.67 
 
 		 477 aa  789    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5790  major facilitator superfamily MFS_1  82.39 
 
 		 477 aa  801    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.339463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4413  major facilitator superfamily MFS_1  65.73 
 
 		 461 aa  633  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.906196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4303  major facilitator superfamily MFS_1  65.73 
 
 		 461 aa  633  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.625349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6411  major facilitator transporter  65.56 
 
 		 461 aa  626  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0634  major facilitator transporter  66.16 
 
 		 461 aa  627  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5816  major facilitator superfamily MFS_1  65.64 
 
 		 468 aa  620  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4438  major facilitator transporter  64.97 
 
 		 464 aa  619  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357208  normal  0.925745 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0190  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  64.43 
 
 		 459 aa  619  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3162  major facilitator transporter  62.22 
 
 		 457 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.688084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2224  major facilitator transporter  62.44 
 
 		 457 aa  589  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0671964  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2553  major facilitator family transporter  61.78 
 
 		 457 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0427116  decreased coverage  0.00798136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3363  major facilitator transporter  61.56 
 
 		 457 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124155  normal  0.451531 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2248  major facilitator superfamily MFS_1  59.78 
 
 		 463 aa  535  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169754  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2371  major facilitator transporter  62.91 
 
 		 406 aa  523  1e-147  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.363547  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0102  major facilitator superfamily MFS_1  51.36 
 
 		 456 aa  425  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5092  major facilitator superfamily MFS_1  48.83 
 
 		 493 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  45.82 
 
 		 453 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0117  major facilitator superfamily MFS_1  46.56 
 
 		 444 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  42.12 
 
 		 458 aa  335  9e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3484  major facilitator transporter  43.68 
 
 		 468 aa  333  4e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3858  major facilitator superfamily MFS_1  43.22 
 
 		 439 aa  332  1e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4082  major facilitator transporter  41.82 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2329  major facilitator superfamily MFS_1  41.5 
 
 		 452 aa  327  3e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126091  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3499  major facilitator transporter  42.23 
 
 		 442 aa  321  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  43.85 
 
 		 446 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  38.75 
 
 		 450 aa  298  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  43.09 
 
 		 447 aa  295  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  38.65 
 
 		 482 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  41.01 
 
 		 447 aa  274  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  38.37 
 
 		 443 aa  273  6e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  39.55 
 
 		 441 aa  270  4e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  39.4 
 
 		 442 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  36.38 
 
 		 430 aa  266  8e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  37.41 
 
 		 433 aa  263  6e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1848  major facilitator transporter  38.32 
 
 		 447 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276958 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  37.75 
 
 		 466 aa  260  4e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  37.25 
 
 		 440 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  40.18 
 
 		 463 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  40.18 
 
 		 463 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  40.18 
 
 		 463 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 439 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  36.69 
 
 		 468 aa  252  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  41.11 
 
 		 432 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  41.11 
 
 		 432 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  41.11 
 
 		 432 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  39.74 
 
 		 465 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  36.03 
 
 		 446 aa  251  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  38.01 
 
 		 437 aa  250  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  38.63 
 
 		 450 aa  249  7e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05660  metabolite-proton symporter  37.65 
 
 		 482 aa  249  9e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  36.64 
 
 		 433 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  37.08 
 
 		 433 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  36.64 
 
 		 433 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  37.08 
 
 		 433 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4675  major facilitator transporter  40.98 
 
 		 628 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85896  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3920  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.71 
 
 		 440 aa  246  6.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.210524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0236  shikimate transporter  36.6 
 
 		 433 aa  246  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4745  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.23 
 
 		 440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  35.6 
 
 		 437 aa  245  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  36.36 
 
 		 435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3159  general substrate transporter  37.47 
 
 		 428 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.761686  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1314  General substrate transporter  33.9 
 
 		 470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  49.81 
 
 		 437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.27 
 
 		 437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  37.33 
 
 		 439 aa  244  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  36.58 
 
 		 435 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  36.58 
 
 		 435 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  36.58 
 
 		 434 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  45.4 
 
 		 436 aa  243  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2900  major facilitator transporter  40.69 
 
 		 453 aa  242  7.999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  37.34 
 
 		 430 aa  243  7.999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  36.09 
 
 		 447 aa  242  9e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0644  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.97 
 
 		 442 aa  242  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  33.57 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  36.97 
 
 		 461 aa  241  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  37.16 
 
 		 461 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  40.31 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  37.44 
 
 		 439 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  33.95 
 
 		 438 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  33.95 
 
 		 438 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  34.46 
 
 		 465 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  33.95 
 
 		 438 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  33.95 
 
 		 438 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  48.66 
 
 		 437 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  36.92 
 
 		 438 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  33.95 
 
 		 438 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  35.87 
 
 		 452 aa  240  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  33.95 
 
 		 438 aa  240  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02410  Major Facilitator Superfamily transporter  37.19 
 
 		 467 aa  240  4e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.277787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  35.94 
 
 		 461 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  35.94 
 
 		 461 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  35.94 
 
 		 461 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0860  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.33 
 
 		 441 aa  240  5e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  34.27 
 
 		 457 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  34.27 
 
 		 457 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>