More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2900 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2900  major facilitator transporter  100 
 
 		 453 aa  891    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1346  major facilitator superfamily MFS_1  48.51 
 
 		 472 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63119  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  40.33 
 
 		 430 aa  311  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  40.56 
 
 		 439 aa  309  8e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  39.58 
 
 		 457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  39.58 
 
 		 457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  39.58 
 
 		 457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  41.84 
 
 		 443 aa  306  6e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  42.65 
 
 		 482 aa  302  7.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  43.91 
 
 		 433 aa  299  7e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  41.45 
 
 		 450 aa  297  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 441 aa  293  4e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  40.49 
 
 		 439 aa  288  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  42.06 
 
 		 441 aa  287  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  41.25 
 
 		 447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.85 
 
 		 437 aa  283  5.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3820  major facilitator transporter  45.18 
 
 		 405 aa  282  8.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  41.06 
 
 		 446 aa  282  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  40.49 
 
 		 438 aa  281  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  40.49 
 
 		 438 aa  280  4e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  40.49 
 
 		 438 aa  280  4e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  40.49 
 
 		 438 aa  280  4e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  42.44 
 
 		 440 aa  280  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  40.49 
 
 		 438 aa  280  4e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  40.49 
 
 		 438 aa  280  5e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  40.49 
 
 		 438 aa  279  6e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  40.49 
 
 		 438 aa  279  9e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  39.82 
 
 		 439 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 439 aa  278  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  42.11 
 
 		 465 aa  277  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  38.55 
 
 		 439 aa  276  7e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  38.39 
 
 		 439 aa  275  8e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  39.52 
 
 		 437 aa  275  9e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  38.2 
 
 		 468 aa  275  9e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  38.55 
 
 		 439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  39.53 
 
 		 439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  40.6 
 
 		 442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  38.62 
 
 		 439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  38.62 
 
 		 439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  38.39 
 
 		 439 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  40.55 
 
 		 456 aa  272  8.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  39.17 
 
 		 435 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  41.35 
 
 		 465 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  40.75 
 
 		 435 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  39.78 
 
 		 427 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  37.24 
 
 		 433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  42.72 
 
 		 439 aa  267  2.9999999999999995e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  39.29 
 
 		 435 aa  266  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 435 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 435 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  39.24 
 
 		 444 aa  266  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 435 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  38.82 
 
 		 435 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  40.31 
 
 		 451 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  38.82 
 
 		 435 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  38.82 
 
 		 435 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  39.81 
 
 		 435 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  38.82 
 
 		 434 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  39.81 
 
 		 435 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  39.63 
 
 		 438 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 		 442 aa  264  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 445 aa  263  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  39.47 
 
 		 441 aa  263  4.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 461 aa  263  6.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  40.18 
 
 		 439 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 434 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  39.72 
 
 		 439 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 439 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  36.43 
 
 		 436 aa  260  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  39.45 
 
 		 461 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  37.05 
 
 		 446 aa  260  4e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  39.45 
 
 		 461 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  39.45 
 
 		 461 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  43.95 
 
 		 452 aa  259  6e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  41.58 
 
 		 439 aa  259  7e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.23 
 
 		 437 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  38.52 
 
 		 452 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  39.11 
 
 		 441 aa  258  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 432 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  40.15 
 
 		 447 aa  258  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.62 
 
 		 438 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 432 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4875  major facilitator transporter  38.8 
 
 		 439 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  42.42 
 
 		 432 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4964  major facilitator superfamily transporter  38.8 
 
 		 439 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  37.88 
 
 		 437 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3269  major facilitator superfamily MFS_1  41.03 
 
 		 436 aa  256  4e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0117  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 		 444 aa  256  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  39.01 
 
 		 432 aa  256  4e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  38.83 
 
 		 456 aa  256  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  38.35 
 
 		 433 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5243  major facilitator transporter  38.57 
 
 		 439 aa  256  7e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  38.35 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  38.35 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  41.21 
 
 		 442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  38.14 
 
 		 452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1848  major facilitator transporter  38.69 
 
 		 447 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276958 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  38.1 
 
 		 433 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6090  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 450 aa  253  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  37.79 
 
 		 463 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>