More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4531 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  100 
 
 
456 aa  899    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3744  General substrate transporter  48.3 
 
 
465 aa  372  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11224  integral membrane transport protein  44.13 
 
 
425 aa  355  1e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000679327  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  40.55 
 
 
439 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  40.88 
 
 
435 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  40.88 
 
 
435 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  40.88 
 
 
435 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  40.09 
 
 
439 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1278  citrate-proton symport  43.95 
 
 
456 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258621  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0863  general substrate transporter  42.79 
 
 
437 aa  310  5e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139167  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  39.86 
 
 
439 aa  310  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  39.6 
 
 
482 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  41.13 
 
 
439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0851  general substrate transporter  42.79 
 
 
437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.80283  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3101  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  42.96 
 
 
438 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1469  major facilitator family transporter  43.75 
 
 
438 aa  307  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0457955  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2736  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  42.99 
 
 
438 aa  306  7e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1063  major facilitator superfamily MFS_1  42.03 
 
 
435 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0991  general substrate transporter  41.84 
 
 
436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0201608  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  42.69 
 
 
440 aa  304  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2408  general substrate transporter  41.61 
 
 
436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0512  general substrate transporter  41.04 
 
 
483 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.509539  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0951  general substrate transporter  41.84 
 
 
436 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3059  metabolite:proton symporter family protein  42.69 
 
 
489 aa  302  9e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3026  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  42.69 
 
 
437 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1015  general substrate transporter  42.4 
 
 
438 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4094  major facilitator transporter  41.38 
 
 
436 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2961  major facilitator superfamily permease  42.69 
 
 
437 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3419  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.34 
 
 
435 aa  300  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  41.63 
 
 
439 aa  300  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0806  metabolite:proton symporter family protein  42.96 
 
 
523 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.413485  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2106  metabolite:proton symporter family protein  42.45 
 
 
437 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.22377  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1974  metabolite:proton symporter family protein  42.45 
 
 
437 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2638  metabolite:proton symporter family protein  42.45 
 
 
437 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.75 
 
 
437 aa  298  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  39.5 
 
 
457 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2238  major facilitator transporter  42.02 
 
 
442 aa  298  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.451405  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3269  major facilitator superfamily MFS_1  43.88 
 
 
436 aa  297  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  40.33 
 
 
457 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  40.33 
 
 
457 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1576  metabolite:proton symporter family protein  41.71 
 
 
506 aa  296  5e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342246  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  40.24 
 
 
430 aa  296  7e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  41.41 
 
 
433 aa  295  8e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1063  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.61 
 
 
432 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0663  general substrate transporter  42.39 
 
 
435 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0269429  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  39.77 
 
 
439 aa  292  8e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15920  major facilitator transporter  44.47 
 
 
437 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.246808 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1458  metabolite-proton symporter  43.9 
 
 
432 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.202966  normal  0.170493 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2741  general substrate transporter  41.84 
 
 
431 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  39.47 
 
 
463 aa  288  1e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4263  general substrate transporter  42.62 
 
 
433 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  44.33 
 
 
441 aa  288  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  42.45 
 
 
438 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  41.37 
 
 
441 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  40.77 
 
 
437 aa  286  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  39.16 
 
 
442 aa  286  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  40.86 
 
 
437 aa  286  7e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4161  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.86 
 
 
433 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  37.47 
 
 
446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2856  metabolite transport protein  43.07 
 
 
439 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2295  major facilitator superfamily MFS_1  40.33 
 
 
452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  41.36 
 
 
447 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2079  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.78 
 
 
436 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  hitchhiker  0.0017507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1369  MFS family transporter  44.15 
 
 
437 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  38.6 
 
 
452 aa  283  6.000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  37.28 
 
 
450 aa  283  6.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  40.69 
 
 
433 aa  282  9e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  45.67 
 
 
432 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  45.67 
 
 
432 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  45.67 
 
 
432 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  41.77 
 
 
432 aa  281  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2487  major facilitator transporter  44.17 
 
 
420 aa  280  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0644  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  41.16 
 
 
442 aa  280  4e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  38.63 
 
 
436 aa  280  5e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0365  major facilitator transporter  40.57 
 
 
441 aa  279  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449418  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2691  general substrate transporter  40.19 
 
 
445 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0860  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  40.7 
 
 
441 aa  279  7e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3082  major facilitator transporter  40.33 
 
 
441 aa  279  9e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5285  major facilitator transporter  40.33 
 
 
441 aa  279  9e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389123  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  38.03 
 
 
441 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  40.05 
 
 
443 aa  278  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4645  major facilitator transporter  39.81 
 
 
441 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372459  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 
839 aa  278  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.834147 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2710  major facilitator superfamily MFS_1  43.93 
 
 
420 aa  277  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  37.78 
 
 
463 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2147  major facilitator superfamily MFS_1  40.66 
 
 
434 aa  277  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426847  normal  0.887871 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3923  major facilitator superfamily MFS_1  38.94 
 
 
452 aa  277  3e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  37.78 
 
 
463 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  37.78 
 
 
463 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  39.49 
 
 
442 aa  276  4e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4983  major facilitator transporter  39.86 
 
 
441 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4745  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.77 
 
 
440 aa  276  6e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5174  major facilitator transporter  39.86 
 
 
441 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1314  General substrate transporter  36.29 
 
 
470 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012233 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3920  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.68 
 
 
440 aa  275  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.210524  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  40.85 
 
 
439 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3435  major facilitator transporter  40.24 
 
 
446 aa  274  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0701144  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4675  major facilitator transporter  39.64 
 
 
628 aa  273  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85896  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1269  general substrate transporter  37.3 
 
 
470 aa  272  8.000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  38.66 
 
 
435 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>