More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5300 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  82 
 
 		 461 aa  729    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  69.82 
 
 		 484 aa  639    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  82 
 
 		 461 aa  729    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  94.1 
 
 		 447 aa  812    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  82 
 
 		 461 aa  729    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 456 aa  909    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  70.21 
 
 		 450 aa  612  9.999999999999999e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  65.17 
 
 		 460 aa  574  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  63.62 
 
 		 443 aa  568  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  63.45 
 
 		 459 aa  558  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  55.61 
 
 		 458 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  55.15 
 
 		 459 aa  499  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  57.18 
 
 		 459 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  57.41 
 
 		 459 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3969  major facilitator transporter  58.62 
 
 		 457 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502064  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  52.45 
 
 		 437 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  49.89 
 
 		 440 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  51.61 
 
 		 439 aa  410  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  51.5 
 
 		 438 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  49 
 
 		 460 aa  381  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  47.1 
 
 		 455 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  46.01 
 
 		 461 aa  352  1e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  43.55 
 
 		 439 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  44.1 
 
 		 435 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  44.1 
 
 		 435 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  44.1 
 
 		 435 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  43.32 
 
 		 439 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  43.32 
 
 		 439 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  42.66 
 
 		 443 aa  328  1.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  43.61 
 
 		 446 aa  324  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  42.18 
 
 		 461 aa  323  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  43.72 
 
 		 446 aa  322  9.999999999999999e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  40.65 
 
 		 439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  40.84 
 
 		 482 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07050  arabinose efflux permease family protein  42.56 
 
 		 429 aa  320  3.9999999999999996e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267941 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  43.37 
 
 		 439 aa  317  4e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  42.28 
 
 		 431 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 455 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  42.06 
 
 		 447 aa  313  4.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 460 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  42.52 
 
 		 442 aa  312  9e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  41.16 
 
 		 438 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  43.06 
 
 		 445 aa  310  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7098  major facilitator transporter  41.85 
 
 		 456 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  41.13 
 
 		 433 aa  311  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  43.02 
 
 		 452 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  42.62 
 
 		 460 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 445 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 445 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 445 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  40.28 
 
 		 430 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  42.92 
 
 		 445 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  41.61 
 
 		 468 aa  309  8e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  41.27 
 
 		 441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  41 
 
 		 452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  40.48 
 
 		 452 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  38.33 
 
 		 450 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0176  major facilitator superfamily MFS_1  41.72 
 
 		 449 aa  306  5.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  39.27 
 
 		 457 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  39.27 
 
 		 457 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  39.27 
 
 		 457 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4803  major facilitator superfamily MFS_1  43.67 
 
 		 444 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.543727 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  40.58 
 
 		 439 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.06 
 
 		 437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  41.06 
 
 		 439 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  41.06 
 
 		 439 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  41.06 
 
 		 439 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  40.82 
 
 		 439 aa  302  9e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1346  major facilitator superfamily MFS_1  41.06 
 
 		 472 aa  302  1e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63119  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  39.02 
 
 		 463 aa  302  1e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.28 
 
 		 438 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  40.82 
 
 		 439 aa  302  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  40.82 
 
 		 439 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6236  major facilitator transporter  42.76 
 
 		 454 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  41.55 
 
 		 433 aa  299  9e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3519  major facilitator superfamily MFS_1  40.13 
 
 		 444 aa  298  1e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1269  general substrate transporter  37.61 
 
 		 470 aa  298  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  38.84 
 
 		 442 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3240  major facilitator superfamily MFS_1  40.27 
 
 		 466 aa  297  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  40.76 
 
 		 444 aa  297  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  43.68 
 
 		 442 aa  298  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  39.27 
 
 		 437 aa  297  3e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  40.45 
 
 		 465 aa  297  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  41.35 
 
 		 435 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0094  major facilitator transporter  42.68 
 
 		 443 aa  296  4e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4108  major facilitator family transporter  40.55 
 
 		 449 aa  296  7e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.073539  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4135  general substrate transporter  40.55 
 
 		 449 aa  295  8e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  40.14 
 
 		 435 aa  295  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  41.97 
 
 		 430 aa  295  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1314  General substrate transporter  37.11 
 
 		 470 aa  294  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012233 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4279  major facilitator transporter  43.24 
 
 		 435 aa  294  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0810486  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1110  major facilitator superfamily protein  40.22 
 
 		 449 aa  294  3e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5966  major facilitator transporter  40.55 
 
 		 457 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  38.93 
 
 		 437 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4210  major facilitator superfamily MFS_1  43.4 
 
 		 448 aa  292  8e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.199459  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  37.61 
 
 		 438 aa  292  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  37.61 
 
 		 438 aa  291  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  37.61 
 
 		 438 aa  291  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  39.27 
 
 		 465 aa  291  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>