More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_07050 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1110  major facilitator superfamily protein  79.67 
 
 		 449 aa  660    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07050  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 429 aa  842    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267941 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  46.62 
 
 		 437 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  46.12 
 
 		 439 aa  340  2.9999999999999998e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  45.88 
 
 		 440 aa  339  5e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  43.59 
 
 		 461 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  43.59 
 
 		 461 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  43.59 
 
 		 461 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  46.48 
 
 		 460 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  42.89 
 
 		 455 aa  328  9e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  42.56 
 
 		 450 aa  321  1.9999999999999998e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  42.56 
 
 		 456 aa  320  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  41.65 
 
 		 431 aa  317  4e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  43.26 
 
 		 447 aa  316  6e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  45.2 
 
 		 438 aa  311  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 458 aa  309  5e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  42.12 
 
 		 435 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  42.12 
 
 		 435 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  42.12 
 
 		 435 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4210  major facilitator superfamily MFS_1  46.58 
 
 		 448 aa  305  1.0000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.199459  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0176  major facilitator superfamily MFS_1  41.09 
 
 		 449 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  38.93 
 
 		 484 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  41.07 
 
 		 439 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  41.39 
 
 		 439 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  41.39 
 
 		 439 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  39.63 
 
 		 460 aa  300  3e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  40.56 
 
 		 459 aa  299  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  41.15 
 
 		 439 aa  299  8e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  39.3 
 
 		 459 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  40.09 
 
 		 459 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4803  major facilitator superfamily MFS_1  43.49 
 
 		 444 aa  295  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.543727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  38.71 
 
 		 459 aa  294  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3577  major facilitator transporter  40.98 
 
 		 453 aa  293  4e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  40.43 
 
 		 441 aa  293  5e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  39.16 
 
 		 443 aa  290  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  42.22 
 
 		 461 aa  290  4e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0094  major facilitator transporter  42.74 
 
 		 443 aa  288  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 439 aa  286  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 		 456 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170297  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  40.97 
 
 		 430 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1044  major facilitator superfamily MFS_1  39.76 
 
 		 443 aa  281  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1913  General substrate transporter  40.89 
 
 		 463 aa  281  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.168957  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  39.26 
 
 		 430 aa  280  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  38.98 
 
 		 457 aa  279  6e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  38.98 
 
 		 457 aa  279  7e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  38.98 
 
 		 457 aa  279  7e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3969  major facilitator transporter  40.87 
 
 		 457 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  40.68 
 
 		 446 aa  277  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3519  major facilitator superfamily MFS_1  41.25 
 
 		 444 aa  273  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  39.2 
 
 		 463 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  39.2 
 
 		 463 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  39.2 
 
 		 463 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2568  general substrate transporter  38.93 
 
 		 444 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 442 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 460 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  40.24 
 
 		 460 aa  269  8e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3240  major facilitator superfamily MFS_1  37.79 
 
 		 466 aa  267  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  40.57 
 
 		 445 aa  266  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  38.28 
 
 		 435 aa  266  5e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  40.09 
 
 		 445 aa  266  7e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2302  General substrate transporter  39.02 
 
 		 444 aa  266  7e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000263865 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  41.22 
 
 		 452 aa  265  8e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3540  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 463 aa  265  8.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 445 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 445 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  41.64 
 
 		 454 aa  262  6.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  40.26 
 
 		 437 aa  262  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  37.24 
 
 		 450 aa  262  8e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  38.39 
 
 		 434 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  37.65 
 
 		 439 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  38.16 
 
 		 435 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  38.97 
 
 		 442 aa  261  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  40.33 
 
 		 445 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  38.16 
 
 		 435 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  40.1 
 
 		 452 aa  260  3e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  37.7 
 
 		 435 aa  259  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  38.93 
 
 		 450 aa  259  7e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  38.19 
 
 		 435 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  37.65 
 
 		 439 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  37.5 
 
 		 456 aa  258  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  37.65 
 
 		 439 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  38.75 
 
 		 439 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  37.93 
 
 		 435 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  37.93 
 
 		 435 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  37.65 
 
 		 439 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  37.41 
 
 		 439 aa  257  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 439 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6090  major facilitator transporter  41.88 
 
 		 450 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  37.66 
 
 		 463 aa  256  5e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  38.02 
 
 		 435 aa  256  7e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18260  arabinose efflux permease family protein  37 
 
 		 438 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.897354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  37.7 
 
 		 461 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  39.49 
 
 		 482 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.02 
 
 		 437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  39.09 
 
 		 439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  40.1 
 
 		 438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 445 aa  252  8.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  38.27 
 
 		 438 aa  250  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  38.6 
 
 		 436 aa  250  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>