More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4210 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4210  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
448 aa  868    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.199459  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3577  major facilitator transporter  68.74 
 
 
453 aa  550  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3240  major facilitator superfamily MFS_1  65.54 
 
 
466 aa  539  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4803  major facilitator superfamily MFS_1  67.27 
 
 
444 aa  538  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.543727 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0176  major facilitator superfamily MFS_1  64.64 
 
 
449 aa  518  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0094  major facilitator transporter  65.09 
 
 
443 aa  510  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3540  major facilitator transporter  66 
 
 
463 aa  508  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3519  major facilitator superfamily MFS_1  61.56 
 
 
444 aa  501  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  52.55 
 
 
435 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  52.55 
 
 
435 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  52.55 
 
 
435 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  52.66 
 
 
439 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  52.53 
 
 
439 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  52.66 
 
 
439 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  53.87 
 
 
441 aa  418  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  54.52 
 
 
439 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  53.48 
 
 
437 aa  404  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  51.03 
 
 
439 aa  402  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  50.73 
 
 
435 aa  401  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  50.36 
 
 
440 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  49.02 
 
 
442 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  47.6 
 
 
460 aa  378  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  51.95 
 
 
438 aa  375  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  45.77 
 
 
461 aa  361  1e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  45.77 
 
 
461 aa  361  1e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  45.77 
 
 
461 aa  361  1e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  45.67 
 
 
455 aa  356  3.9999999999999996e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  46.8 
 
 
468 aa  343  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  47.19 
 
 
443 aa  340  4e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  45.32 
 
 
450 aa  338  9.999999999999999e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  43.4 
 
 
456 aa  335  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  42.89 
 
 
447 aa  333  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  45.5 
 
 
442 aa  333  5e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  46.6 
 
 
461 aa  332  9e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  42.45 
 
 
484 aa  332  1e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07050  arabinose efflux permease family protein  44.16 
 
 
429 aa  330  3e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.267941 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7098  major facilitator transporter  45.58 
 
 
456 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  47.56 
 
 
461 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6236  major facilitator transporter  45.81 
 
 
454 aa  325  7e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  45.17 
 
 
455 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  44.18 
 
 
465 aa  323  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  42.61 
 
 
460 aa  322  7e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  39.91 
 
 
459 aa  319  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  43.77 
 
 
457 aa  319  6e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  40.61 
 
 
458 aa  319  6e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  43.77 
 
 
457 aa  319  7e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  43.77 
 
 
457 aa  319  7e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  43.38 
 
 
430 aa  318  9e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2261  major facilitator superfamily MFS_1  41.82 
 
 
442 aa  317  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  40.94 
 
 
431 aa  316  6e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  44.47 
 
 
430 aa  313  3.9999999999999997e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  41.12 
 
 
459 aa  312  9e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  42.79 
 
 
442 aa  310  4e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  40.89 
 
 
459 aa  309  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  40.65 
 
 
459 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  44.66 
 
 
443 aa  306  4.0000000000000004e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  41.31 
 
 
446 aa  306  6e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  42.29 
 
 
442 aa  306  6e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  42.2 
 
 
439 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  43.13 
 
 
430 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1110  major facilitator superfamily protein  44.63 
 
 
449 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1044  major facilitator superfamily MFS_1  40.57 
 
 
443 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  40.51 
 
 
450 aa  302  8.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5966  major facilitator transporter  43.44 
 
 
457 aa  300  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  40.09 
 
 
463 aa  299  6e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5243  major facilitator transporter  43.2 
 
 
439 aa  299  7e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  41.07 
 
 
441 aa  298  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.78 
 
 
447 aa  298  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4875  major facilitator transporter  42.72 
 
 
439 aa  296  5e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4964  major facilitator superfamily transporter  42.72 
 
 
439 aa  296  5e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  43.57 
 
 
432 aa  295  8e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  41.87 
 
 
433 aa  295  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  43.77 
 
 
427 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  41.48 
 
 
482 aa  293  3e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.55 
 
 
437 aa  294  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6090  major facilitator transporter  43.07 
 
 
450 aa  292  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  40.24 
 
 
437 aa  292  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  42 
 
 
445 aa  290  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  39.05 
 
 
441 aa  290  3e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  43.76 
 
 
439 aa  290  3e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  41.51 
 
 
442 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  39.56 
 
 
437 aa  289  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  38.77 
 
 
439 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  39.41 
 
 
439 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2295  major facilitator superfamily MFS_1  39.82 
 
 
452 aa  288  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  39.41 
 
 
439 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3969  major facilitator transporter  39.82 
 
 
457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502064  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  40.16 
 
 
439 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  40.16 
 
 
439 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  39.16 
 
 
439 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4283  major facilitator transporter  40 
 
 
460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.445263  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  42.21 
 
 
436 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  38.21 
 
 
439 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1346  major facilitator superfamily MFS_1  38.68 
 
 
472 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63119  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  39.95 
 
 
441 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4212  major facilitator superfamily MFS_1  43.7 
 
 
458 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  38.53 
 
 
456 aa  282  7.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170297  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  41.58 
 
 
437 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  39.73 
 
 
433 aa  280  3e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  37.58 
 
 
463 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>