More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1865 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  100 
 
 		 463 aa  912    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.83 
 
 		 437 aa  331  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  42.73 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  45.09 
 
 		 461 aa  324  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  41.98 
 
 		 442 aa  317  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 439 aa  316  6e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  39.43 
 
 		 435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  39.43 
 
 		 435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  39.43 
 
 		 435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  41.71 
 
 		 440 aa  313  4.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  40.36 
 
 		 431 aa  312  7.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  43.16 
 
 		 461 aa  312  9e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 439 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  39.73 
 
 		 468 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  40.68 
 
 		 460 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  39.19 
 
 		 439 aa  306  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  40.23 
 
 		 439 aa  307  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  40.56 
 
 		 446 aa  306  6e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  40.05 
 
 		 439 aa  302  7.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  39.47 
 
 		 439 aa  302  9e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  39.02 
 
 		 456 aa  302  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  37.84 
 
 		 461 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  37.84 
 
 		 461 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  37.84 
 
 		 461 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  41.31 
 
 		 438 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  39.02 
 
 		 447 aa  298  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  39.96 
 
 		 439 aa  297  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  38.5 
 
 		 450 aa  297  3e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  39.96 
 
 		 441 aa  296  4e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  38.13 
 
 		 457 aa  296  5e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  38.13 
 
 		 457 aa  296  6e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  38.13 
 
 		 457 aa  296  6e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  39.02 
 
 		 443 aa  295  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  39.66 
 
 		 452 aa  294  2e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  39.04 
 
 		 482 aa  295  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  35.91 
 
 		 459 aa  293  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  41.16 
 
 		 442 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  41.79 
 
 		 445 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  41.58 
 
 		 445 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  43.15 
 
 		 450 aa  291  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  41.58 
 
 		 445 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  39.95 
 
 		 430 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  37.33 
 
 		 436 aa  289  8e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2295  major facilitator superfamily MFS_1  37.69 
 
 		 452 aa  289  9e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  39.91 
 
 		 442 aa  288  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  39.39 
 
 		 447 aa  288  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  39.47 
 
 		 456 aa  288  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1314  General substrate transporter  35.05 
 
 		 470 aa  288  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012233 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  40.78 
 
 		 460 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  39.17 
 
 		 446 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  39.81 
 
 		 432 aa  286  4e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  40.44 
 
 		 460 aa  285  8e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  38.95 
 
 		 427 aa  285  9e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  41.14 
 
 		 445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  39.95 
 
 		 433 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  38.91 
 
 		 455 aa  284  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1269  general substrate transporter  34.69 
 
 		 470 aa  283  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  40.61 
 
 		 441 aa  283  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  35.73 
 
 		 484 aa  283  6.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  37.47 
 
 		 463 aa  283  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  37.47 
 
 		 463 aa  283  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  37.47 
 
 		 463 aa  283  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  40.45 
 
 		 445 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  34.51 
 
 		 458 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 456 aa  279  7e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170297  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3923  major facilitator superfamily MFS_1  36.97 
 
 		 452 aa  278  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  41.32 
 
 		 432 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  38.85 
 
 		 439 aa  278  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  41.32 
 
 		 432 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  41.32 
 
 		 432 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  38.01 
 
 		 437 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  41.84 
 
 		 452 aa  276  6e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  38.08 
 
 		 430 aa  276  8e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  38.22 
 
 		 441 aa  276  8e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  38.25 
 
 		 452 aa  275  9e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4745  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.08 
 
 		 440 aa  275  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.17 
 
 		 438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  34.65 
 
 		 459 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  38.39 
 
 		 455 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  37.56 
 
 		 460 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  39.76 
 
 		 441 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  38.66 
 
 		 438 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  39.46 
 
 		 430 aa  274  3e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  35.73 
 
 		 466 aa  274  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  38.25 
 
 		 452 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  38.86 
 
 		 447 aa  273  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  38.14 
 
 		 459 aa  273  5.000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18260  arabinose efflux permease family protein  38.18 
 
 		 438 aa  273  5.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.897354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  39.42 
 
 		 437 aa  272  9e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  36.22 
 
 		 444 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  38.37 
 
 		 437 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0860  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  36.61 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  37.9 
 
 		 435 aa  271  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  38.89 
 
 		 434 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4675  major facilitator transporter  38.08 
 
 		 628 aa  271  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85896  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  33.99 
 
 		 459 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.27 
 
 		 437 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 442 aa  269  7e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  39.53 
 
 		 445 aa  269  8.999999999999999e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  37.85 
 
 		 439 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>