More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38440 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  100 
 
 		 442 aa  863    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  48.41 
 
 		 446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  45.28 
 
 		 457 aa  355  5.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  45.28 
 
 		 457 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  45.28 
 
 		 457 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  44.86 
 
 		 437 aa  353  4e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  48.38 
 
 		 461 aa  352  7e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  43.34 
 
 		 440 aa  348  1e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  44.88 
 
 		 433 aa  347  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  42.37 
 
 		 430 aa  344  1e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  44.21 
 
 		 442 aa  344  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  45.96 
 
 		 441 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  40.65 
 
 		 439 aa  342  9e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  45.07 
 
 		 432 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  45.07 
 
 		 432 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  45.07 
 
 		 432 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  45.15 
 
 		 461 aa  336  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  42.44 
 
 		 468 aa  336  5e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  45.39 
 
 		 427 aa  334  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  43.16 
 
 		 432 aa  335  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  42.39 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  43.33 
 
 		 437 aa  333  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  44.75 
 
 		 450 aa  333  3e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  42.72 
 
 		 437 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  44.53 
 
 		 444 aa  332  9e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  44.53 
 
 		 444 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  44.53 
 
 		 444 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  44.53 
 
 		 444 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  44.53 
 
 		 444 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2985  major facilitator family transporter  44.53 
 
 		 444 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.464085  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  44.53 
 
 		 444 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  43.91 
 
 		 442 aa  330  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  41.12 
 
 		 443 aa  329  7e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  43.37 
 
 		 431 aa  328  9e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  45.48 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  42.16 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  45.22 
 
 		 438 aa  326  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0241  major facilitator family transporter  42.52 
 
 		 524 aa  326  6e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  40.87 
 
 		 439 aa  326  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1753  major facilitator family transporter  40.77 
 
 		 443 aa  325  9e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2262  major facilitator family transporter  40.77 
 
 		 443 aa  325  9e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445444  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1534  major facilitator family transporter  40.77 
 
 		 443 aa  325  9e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.348841  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3057  major facilitator family transporter  40.77 
 
 		 443 aa  325  9e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.758675  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  42.43 
 
 		 433 aa  325  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2779  major facilitator family transporter  40.54 
 
 		 443 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  40.64 
 
 		 439 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  40.87 
 
 		 439 aa  323  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  41.94 
 
 		 433 aa  323  5e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  42.12 
 
 		 437 aa  322  6e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2645  major facilitator superfamily permease  40.54 
 
 		 443 aa  322  8e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142533  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  43.3 
 
 		 434 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  42.43 
 
 		 441 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 436 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 436 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4210  major facilitator superfamily MFS_1  45.02 
 
 		 448 aa  320  1.9999999999999998e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.199459  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  40.69 
 
 		 435 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2701  major facilitator family transporter  40.54 
 
 		 443 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  40.69 
 
 		 435 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  40.69 
 
 		 435 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  41.94 
 
 		 441 aa  319  6e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1307  major facilitator family transporter  43.63 
 
 		 437 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.702643  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.47 
 
 		 437 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  41.91 
 
 		 439 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1154  major facilitator transporter  43.63 
 
 		 437 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215313  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  39.37 
 
 		 456 aa  318  9e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170297  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 439 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 439 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  41.91 
 
 		 439 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 439 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  43.7 
 
 		 436 aa  318  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 439 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_003296  RS02317  transporter transmembrane protein  43.81 
 
 		 409 aa  316  4e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.14358 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  42.42 
 
 		 441 aa  317  4e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 436 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  46 
 
 		 430 aa  316  6e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 436 aa  315  8e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 436 aa  315  8e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  39.91 
 
 		 463 aa  314  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  38.5 
 
 		 456 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  39.9 
 
 		 484 aa  313  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2216  major facilitator family transporter  44 
 
 		 437 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4390  major facilitator transporter  42.64 
 
 		 436 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18260  arabinose efflux permease family protein  38.58 
 
 		 438 aa  313  3.9999999999999997e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.897354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  41.63 
 
 		 482 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0701  major facilitator family transporter  44 
 
 		 437 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 439 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1146  major facilitator transporter  43.75 
 
 		 437 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2535  major facilitator family transporter  44 
 
 		 437 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.805911  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  39.34 
 
 		 452 aa  311  1e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  41.8 
 
 		 439 aa  312  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  44.15 
 
 		 442 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2079  major facilitator family transporter  44 
 
 		 437 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.068435  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2147  major facilitator superfamily MFS_1  42.32 
 
 		 434 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426847  normal  0.887871 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0365  major facilitator transporter  43.98 
 
 		 441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1835  major facilitator family transporter  41.01 
 
 		 443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  37.71 
 
 		 461 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  37.71 
 
 		 461 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  37.71 
 
 		 461 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  40.38 
 
 		 430 aa  308  9e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>