More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1154 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A0701  major facilitator family transporter  99.54 
 
 		 437 aa  851    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2216  major facilitator family transporter  99.54 
 
 		 437 aa  851    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1307  major facilitator family transporter  100 
 
 		 437 aa  853    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.702643  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2079  major facilitator family transporter  99.31 
 
 		 437 aa  847    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.068435  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4390  major facilitator transporter  81.06 
 
 		 436 aa  675    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  82.14 
 
 		 436 aa  701    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  80.82 
 
 		 436 aa  674    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1146  major facilitator transporter  99.54 
 
 		 437 aa  850    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  81.06 
 
 		 436 aa  675    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1154  major facilitator transporter  100 
 
 		 437 aa  853    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215313  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  82.38 
 
 		 436 aa  701    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2535  major facilitator family transporter  99.31 
 
 		 437 aa  847    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.805911  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  81.19 
 
 		 436 aa  677    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  81.06 
 
 		 436 aa  675    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1162  major facilitator family transporter  75.18 
 
 		 439 aa  615  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12498  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1770  major facilitator family transporter  75.18 
 
 		 457 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1100  major facilitator family transporter  74.94 
 
 		 444 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341901  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0253  major facilitator family transporter  75.18 
 
 		 444 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  71.5 
 
 		 436 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1681  major facilitator transporter  75.18 
 
 		 439 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0114815  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1267  major facilitator family transporter  74.94 
 
 		 439 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0098  major facilitator family transporter  74.94 
 
 		 457 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.381076  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0326  major facilitator family transporter  74.94 
 
 		 457 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544768  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  70.55 
 
 		 437 aa  593  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  70.07 
 
 		 437 aa  588  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  71.84 
 
 		 434 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3057  major facilitator family transporter  68.61 
 
 		 443 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.758675  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2262  major facilitator family transporter  68.61 
 
 		 443 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445444  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1753  major facilitator family transporter  68.61 
 
 		 443 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1534  major facilitator family transporter  68.61 
 
 		 443 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.348841  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2779  major facilitator family transporter  68.37 
 
 		 443 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2645  major facilitator superfamily permease  68.37 
 
 		 443 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142533  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2701  major facilitator family transporter  68.37 
 
 		 443 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1835  major facilitator family transporter  67.77 
 
 		 443 aa  545  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0241  major facilitator family transporter  62.15 
 
 		 524 aa  530  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  64.48 
 
 		 444 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  63.81 
 
 		 444 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  64.48 
 
 		 444 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  64.48 
 
 		 444 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  64.48 
 
 		 444 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  64.48 
 
 		 444 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2985  major facilitator family transporter  64.48 
 
 		 444 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.464085  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  60.96 
 
 		 433 aa  499  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4983  major facilitator transporter  59.95 
 
 		 441 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5174  major facilitator transporter  58.69 
 
 		 441 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4645  major facilitator transporter  58.92 
 
 		 441 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  61.14 
 
 		 439 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0365  major facilitator transporter  59.24 
 
 		 441 aa  491  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2147  major facilitator superfamily MFS_1  59.73 
 
 		 434 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426847  normal  0.887871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3082  major facilitator transporter  59.24 
 
 		 441 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3435  major facilitator transporter  58.47 
 
 		 446 aa  488  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0701144  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5285  major facilitator transporter  59.24 
 
 		 441 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  52.03 
 
 		 427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  51.23 
 
 		 439 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  48.8 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  48.45 
 
 		 433 aa  359  7e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17780  major facilitator transporter  46.36 
 
 		 469 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5467  major facilitator transporter  46.48 
 
 		 471 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2176  major facilitator transporter  48.46 
 
 		 470 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1540  major facilitator superfamily MFS_1  46.23 
 
 		 468 aa  336  5e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0867894 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2195  major facilitator transporter  47.79 
 
 		 481 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1545  MFS family transporter  46.81 
 
 		 470 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2068  major facilitator transporter  48.07 
 
 		 474 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.680279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5919  major facilitator transporter  48.46 
 
 		 470 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2158  major facilitator transporter  48.46 
 
 		 470 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1113  major facilitator transporter  45.69 
 
 		 468 aa  332  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182405  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  44.47 
 
 		 441 aa  331  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  46.09 
 
 		 437 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  46.13 
 
 		 437 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  41.4 
 
 		 440 aa  322  8e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  47.44 
 
 		 439 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  45.41 
 
 		 439 aa  317  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  46.92 
 
 		 439 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  46.92 
 
 		 439 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  47.44 
 
 		 439 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  46.92 
 
 		 439 aa  316  6e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  43.65 
 
 		 468 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  46.15 
 
 		 439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  42.62 
 
 		 450 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  44.82 
 
 		 442 aa  312  9e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  43.8 
 
 		 442 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  42.57 
 
 		 437 aa  303  6.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  41.94 
 
 		 442 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  44.74 
 
 		 461 aa  297  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  41.44 
 
 		 439 aa  296  7e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  41.9 
 
 		 439 aa  295  8e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  45.99 
 
 		 442 aa  295  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  43.61 
 
 		 433 aa  294  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  42.43 
 
 		 446 aa  293  3e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  41.2 
 
 		 439 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  40.28 
 
 		 430 aa  293  4e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  40.94 
 
 		 439 aa  293  5e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2663  major facilitator superfamily MFS_1  41.45 
 
 		 446 aa  292  9e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.11892 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  37.59 
 
 		 430 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  44.91 
 
 		 432 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  44.91 
 
 		 432 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  43.6 
 
 		 441 aa  290  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  44.91 
 
 		 432 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  41.2 
 
 		 435 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  41.2 
 
 		 435 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>