More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3901 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  100 
 
 		 433 aa  863    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0241  major facilitator family transporter  65.95 
 
 		 524 aa  567  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  65.62 
 
 		 444 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  65.62 
 
 		 444 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  65.62 
 
 		 444 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  65.62 
 
 		 444 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  65.62 
 
 		 444 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2985  major facilitator family transporter  65.62 
 
 		 444 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.464085  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  65.62 
 
 		 444 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  60.09 
 
 		 436 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  61.71 
 
 		 436 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  62.44 
 
 		 436 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  61.46 
 
 		 436 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  62.16 
 
 		 436 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  62.16 
 
 		 436 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  62.16 
 
 		 436 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  59.66 
 
 		 437 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4390  major facilitator transporter  61.18 
 
 		 436 aa  504  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  59.18 
 
 		 437 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2262  major facilitator family transporter  60.44 
 
 		 443 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445444  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1753  major facilitator family transporter  60.44 
 
 		 443 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2779  major facilitator family transporter  60.44 
 
 		 443 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3057  major facilitator family transporter  60.44 
 
 		 443 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.758675  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1534  major facilitator family transporter  60.44 
 
 		 443 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.348841  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2645  major facilitator superfamily permease  60.19 
 
 		 443 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142533  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2701  major facilitator family transporter  59.95 
 
 		 443 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1307  major facilitator family transporter  60.34 
 
 		 437 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.702643  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1154  major facilitator transporter  60.34 
 
 		 437 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215313  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2216  major facilitator family transporter  60.8 
 
 		 437 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1146  major facilitator transporter  60.55 
 
 		 437 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0253  major facilitator family transporter  58.94 
 
 		 444 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2079  major facilitator family transporter  60.8 
 
 		 437 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.068435  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1681  major facilitator transporter  58.94 
 
 		 439 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0114815  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1162  major facilitator family transporter  58.94 
 
 		 439 aa  479  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12498  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1835  major facilitator family transporter  59.9 
 
 		 443 aa  480  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2535  major facilitator family transporter  60.8 
 
 		 437 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.805911  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1770  major facilitator family transporter  58.94 
 
 		 457 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0701  major facilitator family transporter  60.8 
 
 		 437 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0326  major facilitator family transporter  58.7 
 
 		 457 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544768  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1100  major facilitator family transporter  58.7 
 
 		 444 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341901  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0098  major facilitator family transporter  58.7 
 
 		 457 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.381076  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1267  major facilitator family transporter  58.7 
 
 		 439 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  57.69 
 
 		 434 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  55.16 
 
 		 439 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2147  major facilitator superfamily MFS_1  51.2 
 
 		 434 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426847  normal  0.887871 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3435  major facilitator transporter  48.19 
 
 		 446 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0701144  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5174  major facilitator transporter  47.95 
 
 		 441 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4645  major facilitator transporter  48.19 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0365  major facilitator transporter  47.47 
 
 		 441 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4983  major facilitator transporter  47.23 
 
 		 441 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3082  major facilitator transporter  46.99 
 
 		 441 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5285  major facilitator transporter  46.99 
 
 		 441 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  49.61 
 
 		 427 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2195  major facilitator transporter  47.09 
 
 		 481 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  43.33 
 
 		 439 aa  345  7e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2068  major facilitator transporter  46.56 
 
 		 474 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.680279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5467  major facilitator transporter  45 
 
 		 471 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  45.08 
 
 		 432 aa  344  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2176  major facilitator transporter  46.72 
 
 		 470 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5919  major facilitator transporter  46.72 
 
 		 470 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2158  major facilitator transporter  46.72 
 
 		 470 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1540  major facilitator superfamily MFS_1  44.2 
 
 		 468 aa  339  7e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0867894 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1113  major facilitator transporter  46.17 
 
 		 468 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182405  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  44.12 
 
 		 441 aa  334  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17780  major facilitator transporter  45.43 
 
 		 469 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1545  MFS family transporter  43.33 
 
 		 470 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  41.23 
 
 		 433 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  43.77 
 
 		 440 aa  326  5e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  44.94 
 
 		 439 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  44.94 
 
 		 439 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  45.19 
 
 		 439 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  45.19 
 
 		 439 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  44.22 
 
 		 439 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  44.22 
 
 		 439 aa  319  7e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  44.22 
 
 		 439 aa  319  7e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.29 
 
 		 437 aa  315  7e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  42.82 
 
 		 437 aa  315  7e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  44.63 
 
 		 442 aa  315  9e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  43.78 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  43.59 
 
 		 446 aa  312  7.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  40.44 
 
 		 450 aa  311  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  40.25 
 
 		 437 aa  310  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  42.23 
 
 		 441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  38.67 
 
 		 430 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  40.89 
 
 		 468 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  42.32 
 
 		 439 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  40.48 
 
 		 465 aa  301  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 442 aa  300  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  40.48 
 
 		 465 aa  301  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  42.51 
 
 		 431 aa  300  5e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  40.62 
 
 		 452 aa  299  8e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  40.1 
 
 		 452 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  42.42 
 
 		 430 aa  296  4e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  39.71 
 
 		 446 aa  295  8e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  42.35 
 
 		 465 aa  295  8e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  38.23 
 
 		 439 aa  294  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.44 
 
 		 438 aa  295  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  43.6 
 
 		 435 aa  293  4e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  39.9 
 
 		 438 aa  292  6e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  39.95 
 
 		 430 aa  291  2e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>