More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_17780 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1540  major facilitator superfamily MFS_1  75.82 
 
 		 468 aa  700    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0867894 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5467  major facilitator transporter  71.85 
 
 		 471 aa  652    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2176  major facilitator transporter  69.96 
 
 		 470 aa  651    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1113  major facilitator transporter  73.67 
 
 		 468 aa  646    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5919  major facilitator transporter  70.61 
 
 		 470 aa  655    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2195  major facilitator transporter  71.4 
 
 		 481 aa  647    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2068  major facilitator transporter  71.56 
 
 		 474 aa  648    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.680279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17780  major facilitator transporter  100 
 
 		 469 aa  930    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2158  major facilitator transporter  70.61 
 
 		 470 aa  655    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1545  MFS family transporter  92.13 
 
 		 470 aa  864    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  50.59 
 
 		 427 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  48.04 
 
 		 436 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  48.04 
 
 		 436 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  48.04 
 
 		 436 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  47.12 
 
 		 436 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  47.12 
 
 		 436 aa  360  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  47.09 
 
 		 436 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4390  major facilitator transporter  46.81 
 
 		 436 aa  351  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  46.1 
 
 		 436 aa  348  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  45.73 
 
 		 439 aa  345  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  46.23 
 
 		 444 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  46.23 
 
 		 444 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  46.23 
 
 		 444 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  46.23 
 
 		 444 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2985  major facilitator family transporter  46.23 
 
 		 444 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.464085  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  46.23 
 
 		 444 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  46.23 
 
 		 444 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  48.17 
 
 		 434 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  44.63 
 
 		 437 aa  331  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  44.37 
 
 		 437 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0241  major facilitator family transporter  45.79 
 
 		 524 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1307  major facilitator family transporter  46.77 
 
 		 437 aa  325  9e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.702643  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1154  major facilitator transporter  46.77 
 
 		 437 aa  325  9e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215313  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  43.35 
 
 		 432 aa  324  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  45.53 
 
 		 433 aa  323  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1146  major facilitator transporter  46.97 
 
 		 437 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2535  major facilitator family transporter  46.97 
 
 		 437 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.805911  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2079  major facilitator family transporter  46.97 
 
 		 437 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.068435  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2216  major facilitator family transporter  46.97 
 
 		 437 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  44.67 
 
 		 433 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0701  major facilitator family transporter  46.97 
 
 		 437 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1770  major facilitator family transporter  43.44 
 
 		 457 aa  319  7e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1162  major facilitator family transporter  43.57 
 
 		 439 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12498  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0253  major facilitator family transporter  43.44 
 
 		 444 aa  318  9e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1681  major facilitator transporter  43.44 
 
 		 439 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0114815  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0098  major facilitator family transporter  43.21 
 
 		 457 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.381076  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1100  major facilitator family transporter  43.21 
 
 		 444 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0326  major facilitator family transporter  43.21 
 
 		 457 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544768  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1267  major facilitator family transporter  43.21 
 
 		 439 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  44.04 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  45.48 
 
 		 439 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3082  major facilitator transporter  45.04 
 
 		 441 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5285  major facilitator transporter  45.04 
 
 		 441 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389123  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1753  major facilitator family transporter  44.23 
 
 		 443 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3057  major facilitator family transporter  44.23 
 
 		 443 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.758675  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2262  major facilitator family transporter  44.23 
 
 		 443 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445444  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1534  major facilitator family transporter  44.23 
 
 		 443 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.348841  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5174  major facilitator transporter  44.53 
 
 		 441 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4983  major facilitator transporter  44.78 
 
 		 441 aa  312  9e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0365  major facilitator transporter  44.53 
 
 		 441 aa  312  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3435  major facilitator transporter  41.59 
 
 		 446 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0701144  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2779  major facilitator family transporter  43.99 
 
 		 443 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2701  major facilitator family transporter  44.23 
 
 		 443 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2147  major facilitator superfamily MFS_1  44.6 
 
 		 434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426847  normal  0.887871 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2645  major facilitator superfamily permease  43.99 
 
 		 443 aa  309  8e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142533  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4645  major facilitator transporter  44.13 
 
 		 441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372459  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  42.6 
 
 		 437 aa  297  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1835  major facilitator family transporter  44.29 
 
 		 443 aa  296  5e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  41.91 
 
 		 446 aa  288  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  41.93 
 
 		 440 aa  287  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  38.39 
 
 		 450 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  41.5 
 
 		 431 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  41.61 
 
 		 437 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 439 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  40.5 
 
 		 455 aa  281  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 439 aa  280  5e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  39.91 
 
 		 439 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  39.91 
 
 		 439 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.5 
 
 		 437 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  39.91 
 
 		 439 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  39.91 
 
 		 439 aa  277  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 446 aa  276  5e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  39.77 
 
 		 439 aa  276  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  37.25 
 
 		 461 aa  276  7e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  37.25 
 
 		 461 aa  276  7e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  37.25 
 
 		 461 aa  276  7e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  41.29 
 
 		 441 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  38.46 
 
 		 436 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  41.77 
 
 		 441 aa  273  5.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  43.58 
 
 		 432 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  43.58 
 
 		 432 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  43.58 
 
 		 432 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  40.24 
 
 		 435 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  38.52 
 
 		 468 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  40.62 
 
 		 442 aa  271  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  39.9 
 
 		 435 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  40.24 
 
 		 435 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  39.76 
 
 		 435 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  39.76 
 
 		 435 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  40.24 
 
 		 435 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>