More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1075 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  100 
 
 
439 aa  852    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  61.2 
 
 
436 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  61.2 
 
 
436 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  60.05 
 
 
436 aa  500  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  60.96 
 
 
436 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  60.92 
 
 
436 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  60.92 
 
 
436 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  60.92 
 
 
436 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4390  major facilitator transporter  60.19 
 
 
436 aa  488  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  58.59 
 
 
437 aa  474  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  60.39 
 
 
434 aa  474  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  57.18 
 
 
437 aa  472  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1307  major facilitator family transporter  61.12 
 
 
437 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.702643  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1154  major facilitator transporter  61.12 
 
 
437 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215313  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2216  major facilitator family transporter  61.65 
 
 
437 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0701  major facilitator family transporter  61.65 
 
 
437 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0253  major facilitator family transporter  57.21 
 
 
444 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2535  major facilitator family transporter  61.65 
 
 
437 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.805911  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1770  major facilitator family transporter  57.21 
 
 
457 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1146  major facilitator transporter  61.65 
 
 
437 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2079  major facilitator family transporter  61.65 
 
 
437 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.068435  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0098  major facilitator family transporter  56.98 
 
 
457 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.381076  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1100  major facilitator family transporter  56.98 
 
 
444 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341901  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1162  major facilitator family transporter  57.14 
 
 
439 aa  458  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12498  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0326  major facilitator family transporter  56.98 
 
 
457 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544768  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1267  major facilitator family transporter  57.61 
 
 
439 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1681  major facilitator transporter  57.85 
 
 
439 aa  458  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0114815  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0241  major facilitator family transporter  53.96 
 
 
524 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  54.13 
 
 
444 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  54.13 
 
 
444 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  54.13 
 
 
444 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2985  major facilitator family transporter  54.13 
 
 
444 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.464085  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  54.13 
 
 
444 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  54.9 
 
 
433 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  54.13 
 
 
444 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  54.13 
 
 
444 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1753  major facilitator family transporter  56.8 
 
 
443 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3057  major facilitator family transporter  56.8 
 
 
443 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.758675  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2779  major facilitator family transporter  56.8 
 
 
443 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1534  major facilitator family transporter  56.8 
 
 
443 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.348841  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2262  major facilitator family transporter  56.8 
 
 
443 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445444  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2645  major facilitator superfamily permease  56.55 
 
 
443 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142533  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2701  major facilitator family transporter  56.31 
 
 
443 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0365  major facilitator transporter  53.51 
 
 
441 aa  428  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449418  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4645  major facilitator transporter  53.51 
 
 
441 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372459  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3435  major facilitator transporter  53.55 
 
 
446 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0701144  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5174  major facilitator transporter  52.78 
 
 
441 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1835  major facilitator family transporter  56.55 
 
 
443 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3082  major facilitator transporter  52.78 
 
 
441 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4983  major facilitator transporter  52.78 
 
 
441 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5285  major facilitator transporter  52.78 
 
 
441 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389123  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2147  major facilitator superfamily MFS_1  52.88 
 
 
434 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426847  normal  0.887871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  50.48 
 
 
427 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  49.3 
 
 
432 aa  356  5e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17780  major facilitator transporter  45.73 
 
 
469 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2068  major facilitator transporter  47.56 
 
 
474 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.680279  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2195  major facilitator transporter  47.45 
 
 
481 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2176  major facilitator transporter  47.26 
 
 
470 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5467  major facilitator transporter  47.45 
 
 
471 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491841  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1545  MFS family transporter  46.57 
 
 
470 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5919  major facilitator transporter  47.26 
 
 
470 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2158  major facilitator transporter  47.26 
 
 
470 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1540  major facilitator superfamily MFS_1  46.76 
 
 
468 aa  338  9e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0867894 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  45.86 
 
 
433 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1113  major facilitator transporter  47.51 
 
 
468 aa  331  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182405  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  46.33 
 
 
441 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  46.44 
 
 
439 aa  325  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  45.34 
 
 
450 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.06 
 
 
437 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  40.19 
 
 
430 aa  316  6e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  43.42 
 
 
431 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  42.82 
 
 
437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  43.47 
 
 
439 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  40.84 
 
 
440 aa  306  4.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  43.8 
 
 
442 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  43.72 
 
 
439 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  42.72 
 
 
438 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  43.75 
 
 
442 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  43.86 
 
 
439 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  43.47 
 
 
439 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  43.47 
 
 
439 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  43.86 
 
 
439 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  43.47 
 
 
439 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  43.39 
 
 
446 aa  300  3e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.89 
 
 
438 aa  300  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  45.26 
 
 
430 aa  299  5e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  44.31 
 
 
461 aa  297  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  41.53 
 
 
468 aa  295  8e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  42.67 
 
 
430 aa  295  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  41.08 
 
 
455 aa  295  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  42.53 
 
 
437 aa  292  7e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  41.32 
 
 
433 aa  291  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  42.45 
 
 
445 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  42.45 
 
 
445 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  42.36 
 
 
450 aa  290  4e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  42.21 
 
 
445 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  40.81 
 
 
460 aa  288  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  41.97 
 
 
460 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  42.19 
 
 
457 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  42.19 
 
 
457 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>