More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1226 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  99.55 
 
 		 444 aa  869    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  99.55 
 
 		 444 aa  869    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  99.55 
 
 		 444 aa  869    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  100 
 
 		 444 aa  872    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0241  major facilitator family transporter  92.76 
 
 		 524 aa  777    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  99.55 
 
 		 444 aa  869    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  99.55 
 
 		 444 aa  869    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2985  major facilitator family transporter  99.77 
 
 		 444 aa  871    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.464085  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  65.55 
 
 		 433 aa  556  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  62.92 
 
 		 436 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  62.92 
 
 		 436 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  64.11 
 
 		 436 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  63.7 
 
 		 437 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  63.46 
 
 		 437 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  63.35 
 
 		 436 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  62.98 
 
 		 436 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  62.98 
 
 		 436 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  59.77 
 
 		 436 aa  514  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4390  major facilitator transporter  62.74 
 
 		 436 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1753  major facilitator family transporter  61.41 
 
 		 443 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1534  major facilitator family transporter  61.41 
 
 		 443 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.348841  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2779  major facilitator family transporter  61.18 
 
 		 443 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3057  major facilitator family transporter  61.41 
 
 		 443 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.758675  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2262  major facilitator family transporter  61.41 
 
 		 443 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445444  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1307  major facilitator family transporter  63.53 
 
 		 437 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.702643  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2701  major facilitator family transporter  61.18 
 
 		 443 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2645  major facilitator superfamily permease  61.18 
 
 		 443 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142533  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1154  major facilitator transporter  63.53 
 
 		 437 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215313  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2216  major facilitator family transporter  63.04 
 
 		 437 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0701  major facilitator family transporter  63.04 
 
 		 437 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1146  major facilitator transporter  63.04 
 
 		 437 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2535  major facilitator family transporter  63.04 
 
 		 437 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.805911  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2079  major facilitator family transporter  63.04 
 
 		 437 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.068435  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1835  major facilitator family transporter  61.57 
 
 		 443 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0253  major facilitator family transporter  61.77 
 
 		 444 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1681  major facilitator transporter  61.77 
 
 		 439 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0114815  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1100  major facilitator family transporter  61.54 
 
 		 444 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341901  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0098  major facilitator family transporter  61.54 
 
 		 457 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.381076  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0326  major facilitator family transporter  61.54 
 
 		 457 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544768  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1267  major facilitator family transporter  61.54 
 
 		 439 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1770  major facilitator family transporter  61.54 
 
 		 457 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1162  major facilitator family transporter  61.12 
 
 		 439 aa  479  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12498  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  60.44 
 
 		 434 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  53.7 
 
 		 439 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2147  major facilitator superfamily MFS_1  52.72 
 
 		 434 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426847  normal  0.887871 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0365  major facilitator transporter  51.3 
 
 		 441 aa  425  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4983  major facilitator transporter  51.66 
 
 		 441 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3082  major facilitator transporter  51.9 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5285  major facilitator transporter  51.9 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5174  major facilitator transporter  52.97 
 
 		 441 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3435  major facilitator transporter  53.6 
 
 		 446 aa  423  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0701144  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4645  major facilitator transporter  51.9 
 
 		 441 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  51.3 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17780  major facilitator transporter  45.67 
 
 		 469 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5467  major facilitator transporter  44.85 
 
 		 471 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2176  major facilitator transporter  44.87 
 
 		 470 aa  339  8e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2195  major facilitator transporter  44.82 
 
 		 481 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5919  major facilitator transporter  44.87 
 
 		 470 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2158  major facilitator transporter  44.87 
 
 		 470 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2068  major facilitator transporter  44.24 
 
 		 474 aa  335  7e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.680279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1545  MFS family transporter  45.67 
 
 		 470 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  43.56 
 
 		 432 aa  332  6e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1540  major facilitator superfamily MFS_1  42.73 
 
 		 468 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0867894 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  44.21 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  41.63 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1113  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 468 aa  327  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182405  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  43.03 
 
 		 441 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  41.65 
 
 		 468 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.08 
 
 		 437 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  43.28 
 
 		 442 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  40.49 
 
 		 430 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  41.86 
 
 		 437 aa  306  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  40.94 
 
 		 450 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  42.56 
 
 		 442 aa  304  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  40.71 
 
 		 440 aa  300  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  42.79 
 
 		 431 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  39.63 
 
 		 446 aa  298  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  41.58 
 
 		 439 aa  298  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  43.97 
 
 		 439 aa  295  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.14 
 
 		 437 aa  295  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  44.12 
 
 		 430 aa  294  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  41.34 
 
 		 439 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  43.78 
 
 		 461 aa  293  3e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  42.41 
 
 		 439 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  43.72 
 
 		 432 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 439 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  41.34 
 
 		 439 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  43.72 
 
 		 432 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 439 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  43.72 
 
 		 432 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  41.34 
 
 		 439 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  42.41 
 
 		 439 aa  292  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  41.98 
 
 		 435 aa  293  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  41.98 
 
 		 435 aa  293  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  41.98 
 
 		 435 aa  293  6e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  41.34 
 
 		 439 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  44.36 
 
 		 430 aa  292  8e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  41.88 
 
 		 441 aa  291  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  41.48 
 
 		 439 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  42.76 
 
 		 442 aa  289  7e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>