More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0098 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1100  major facilitator family transporter  99.77 
 
 
444 aa  877    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341901  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0253  major facilitator family transporter  99.55 
 
 
444 aa  875    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1267  major facilitator family transporter  99.77 
 
 
439 aa  867    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1162  major facilitator family transporter  96.58 
 
 
439 aa  817    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12498  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1770  major facilitator family transporter  99.56 
 
 
457 aa  904    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  76.63 
 
 
436 aa  646    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0326  major facilitator family transporter  100 
 
 
457 aa  907    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544768  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1681  major facilitator transporter  99.32 
 
 
439 aa  863    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0114815  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  76.39 
 
 
436 aa  645    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0098  major facilitator family transporter  100 
 
 
457 aa  907    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.381076  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  76.39 
 
 
436 aa  624  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4390  major facilitator transporter  76.72 
 
 
436 aa  621  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  76.72 
 
 
436 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  76.47 
 
 
436 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  76.47 
 
 
436 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1307  major facilitator family transporter  74.94 
 
 
437 aa  594  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.702643  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1154  major facilitator transporter  74.94 
 
 
437 aa  594  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215313  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2535  major facilitator family transporter  74.64 
 
 
437 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.805911  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2079  major facilitator family transporter  74.64 
 
 
437 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.068435  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2216  major facilitator family transporter  74.64 
 
 
437 aa  581  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0701  major facilitator family transporter  74.64 
 
 
437 aa  581  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1146  major facilitator transporter  74.64 
 
 
437 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  66.9 
 
 
436 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  67.31 
 
 
437 aa  556  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  66.82 
 
 
437 aa  555  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  67.39 
 
 
434 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1753  major facilitator family transporter  64.94 
 
 
443 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2779  major facilitator family transporter  64.94 
 
 
443 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3057  major facilitator family transporter  64.94 
 
 
443 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.758675  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1835  major facilitator family transporter  65.64 
 
 
443 aa  535  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2262  major facilitator family transporter  64.94 
 
 
443 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445444  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1534  major facilitator family transporter  64.94 
 
 
443 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.348841  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2701  major facilitator family transporter  64.71 
 
 
443 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2645  major facilitator superfamily permease  64.71 
 
 
443 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142533  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0241  major facilitator family transporter  61.79 
 
 
524 aa  504  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  62.17 
 
 
444 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2985  major facilitator family transporter  62.17 
 
 
444 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.464085  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  62.17 
 
 
444 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  62.17 
 
 
444 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  62.17 
 
 
444 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  62.17 
 
 
444 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  62.17 
 
 
444 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  58.7 
 
 
433 aa  480  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  56.98 
 
 
439 aa  477  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4983  major facilitator transporter  55.42 
 
 
441 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3082  major facilitator transporter  55.66 
 
 
441 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2147  major facilitator superfamily MFS_1  56.67 
 
 
434 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426847  normal  0.887871 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4645  major facilitator transporter  55.66 
 
 
441 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372459  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5285  major facilitator transporter  55.66 
 
 
441 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389123  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0365  major facilitator transporter  55.42 
 
 
441 aa  461  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449418  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3435  major facilitator transporter  55.9 
 
 
446 aa  464  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0701144  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5174  major facilitator transporter  55.42 
 
 
441 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  51.42 
 
 
427 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  48.6 
 
 
432 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  46.85 
 
 
433 aa  365  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  48.37 
 
 
439 aa  360  3e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17780  major facilitator transporter  43.21 
 
 
469 aa  332  8e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1540  major facilitator superfamily MFS_1  43.71 
 
 
468 aa  332  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0867894 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1545  MFS family transporter  44.79 
 
 
470 aa  329  6e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  42.59 
 
 
441 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2176  major facilitator transporter  43.49 
 
 
470 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5919  major facilitator transporter  43.49 
 
 
470 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2158  major facilitator transporter  43.49 
 
 
470 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2195  major facilitator transporter  43.26 
 
 
481 aa  318  9e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5467  major facilitator transporter  42.99 
 
 
471 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491841  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2068  major facilitator transporter  42.89 
 
 
474 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.680279  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1113  major facilitator transporter  44.03 
 
 
468 aa  316  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182405  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  43.18 
 
 
439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.24 
 
 
437 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  39.86 
 
 
440 aa  302  7.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  42.09 
 
 
437 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  41.3 
 
 
450 aa  300  4e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  40.1 
 
 
468 aa  299  6e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  43.69 
 
 
439 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  43.69 
 
 
439 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  43.18 
 
 
439 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  40.95 
 
 
431 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  43.18 
 
 
439 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  43.18 
 
 
439 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  42.93 
 
 
439 aa  292  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  43.36 
 
 
442 aa  292  9e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  38.53 
 
 
430 aa  292  9e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  44.09 
 
 
461 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  42.64 
 
 
437 aa  290  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  41.46 
 
 
442 aa  290  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  41.32 
 
 
482 aa  289  6e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  39.18 
 
 
442 aa  289  7e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  40.15 
 
 
439 aa  289  9e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4036  major facilitator superfamily MFS_1  41.75 
 
 
437 aa  288  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.16141  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  40.4 
 
 
446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  42.76 
 
 
461 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  39.3 
 
 
457 aa  282  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  39.3 
 
 
457 aa  282  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  39.3 
 
 
457 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  35.59 
 
 
465 aa  281  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  42.64 
 
 
433 aa  281  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  40.99 
 
 
445 aa  279  6e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  42.23 
 
 
441 aa  279  8e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  41.72 
 
 
439 aa  278  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  39.84 
 
 
430 aa  278  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>