More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4694 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  95.9 
 
 		 439 aa  833    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  100 
 
 		 439 aa  865    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  96.55 
 
 		 435 aa  830    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  96.55 
 
 		 435 aa  830    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  92.26 
 
 		 439 aa  772    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  99.32 
 
 		 439 aa  860    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  96.55 
 
 		 435 aa  830    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  67.92 
 
 		 441 aa  577  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  68.5 
 
 		 435 aa  567  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  59.41 
 
 		 442 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  52.26 
 
 		 440 aa  422  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2261  major facilitator superfamily MFS_1  51.79 
 
 		 442 aa  410  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  49.3 
 
 		 439 aa  395  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  49.18 
 
 		 437 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  47.83 
 
 		 455 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4210  major facilitator superfamily MFS_1  52.66 
 
 		 448 aa  388  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.199459  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3240  major facilitator superfamily MFS_1  49.89 
 
 		 466 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  48.82 
 
 		 438 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4803  major facilitator superfamily MFS_1  49.53 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.543727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  46.99 
 
 		 468 aa  368  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  45.6 
 
 		 460 aa  363  5.0000000000000005e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3540  major facilitator transporter  52.62 
 
 		 463 aa  361  1e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  43.71 
 
 		 442 aa  353  5e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  47.96 
 
 		 461 aa  352  5e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  44.55 
 
 		 461 aa  351  1e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  43.87 
 
 		 459 aa  351  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  44.55 
 
 		 461 aa  351  1e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  44.55 
 
 		 461 aa  351  1e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  45.26 
 
 		 484 aa  350  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3577  major facilitator transporter  46.99 
 
 		 453 aa  350  3e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0094  major facilitator transporter  47.51 
 
 		 443 aa  349  4e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3519  major facilitator superfamily MFS_1  46.35 
 
 		 444 aa  349  6e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0176  major facilitator superfamily MFS_1  45.81 
 
 		 449 aa  346  4e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  44.31 
 
 		 460 aa  346  6e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  42.18 
 
 		 459 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  43.45 
 
 		 459 aa  344  2e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  42.19 
 
 		 450 aa  342  5.999999999999999e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 459 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  44.15 
 
 		 430 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  43.14 
 
 		 431 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  41.24 
 
 		 458 aa  340  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  43.55 
 
 		 456 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  45.02 
 
 		 442 aa  335  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  44.58 
 
 		 447 aa  333  4e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  41.45 
 
 		 450 aa  332  6e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  44.44 
 
 		 443 aa  330  3e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  42.76 
 
 		 439 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 439 aa  330  4e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  43.74 
 
 		 443 aa  329  5.0000000000000004e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  42.76 
 
 		 439 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  42.76 
 
 		 439 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  42.76 
 
 		 439 aa  329  6e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  41.88 
 
 		 437 aa  329  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  43.1 
 
 		 439 aa  328  9e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.69 
 
 		 437 aa  328  9e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 439 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  43.71 
 
 		 461 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  45.08 
 
 		 430 aa  321  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  43 
 
 		 441 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  42.96 
 
 		 430 aa  319  5e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  40.55 
 
 		 456 aa  318  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3969  major facilitator transporter  41.15 
 
 		 457 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502064  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  40.14 
 
 		 463 aa  316  5e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  42.48 
 
 		 435 aa  315  8e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  43.69 
 
 		 432 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  43.69 
 
 		 432 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  43.69 
 
 		 432 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  40.33 
 
 		 433 aa  313  4.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  42.55 
 
 		 441 aa  312  7.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  40.42 
 
 		 439 aa  311  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  41.63 
 
 		 457 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  41.63 
 
 		 457 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  41.63 
 
 		 457 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4875  major facilitator transporter  44.76 
 
 		 439 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5243  major facilitator transporter  44.76 
 
 		 439 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4964  major facilitator superfamily transporter  44.76 
 
 		 439 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  44.29 
 
 		 442 aa  310  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  45.37 
 
 		 452 aa  310  5e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  40.27 
 
 		 439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  38.95 
 
 		 465 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  39.49 
 
 		 482 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  38.8 
 
 		 437 aa  303  4.0000000000000003e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7098  major facilitator transporter  41.61 
 
 		 456 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  38.3 
 
 		 438 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  42.46 
 
 		 441 aa  303  6.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  39.57 
 
 		 438 aa  302  8.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  39.57 
 
 		 438 aa  301  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  37.91 
 
 		 465 aa  301  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  39.49 
 
 		 446 aa  301  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07050  arabinose efflux permease family protein  41.39 
 
 		 429 aa  301  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267941 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  39.57 
 
 		 438 aa  300  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  39.59 
 
 		 439 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  39.57 
 
 		 438 aa  301  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  39.33 
 
 		 438 aa  300  4e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  39.33 
 
 		 438 aa  300  4e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  39.33 
 
 		 438 aa  300  4e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  40.94 
 
 		 455 aa  300  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  40.64 
 
 		 442 aa  300  4e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6236  major facilitator transporter  41.13 
 
 		 454 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 452 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>