More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1879 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  100 
 
 
463 aa  905    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  100 
 
 
463 aa  905    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  100 
 
 
463 aa  905    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3923  major facilitator superfamily MFS_1  69.57 
 
 
452 aa  580  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05660  metabolite-proton symporter  62.05 
 
 
482 aa  557  1e-157  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  58.85 
 
 
466 aa  483  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4675  major facilitator transporter  58.53 
 
 
628 aa  482  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85896  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  57.21 
 
 
447 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1269  general substrate transporter  52.77 
 
 
470 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3159  general substrate transporter  56.02 
 
 
428 aa  456  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.761686  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4745  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  56.81 
 
 
440 aa  457  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1314  General substrate transporter  54.35 
 
 
470 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012233 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0644  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  55.89 
 
 
442 aa  448  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0860  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  55.43 
 
 
441 aa  449  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2295  major facilitator superfamily MFS_1  56.52 
 
 
452 aa  451  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3920  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  56.45 
 
 
440 aa  444  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.210524  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3302  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  54.61 
 
 
444 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3427  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  54.84 
 
 
441 aa  438  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  50.35 
 
 
436 aa  428  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2036  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  55.71 
 
 
433 aa  427  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70971  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2079  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  53.63 
 
 
436 aa  422  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  hitchhiker  0.0017507 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3269  major facilitator superfamily MFS_1  55.99 
 
 
436 aa  422  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4094  major facilitator transporter  51.66 
 
 
436 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0951  general substrate transporter  51.43 
 
 
436 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2408  general substrate transporter  51.66 
 
 
436 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1063  major facilitator superfamily MFS_1  52.47 
 
 
435 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0991  general substrate transporter  51.43 
 
 
436 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0201608  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0863  general substrate transporter  50.99 
 
 
437 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139167  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03371  predicted transporter  54.61 
 
 
440 aa  413  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0190  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  54.61 
 
 
440 aa  413  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0194  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  54.61 
 
 
440 aa  413  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03324  hypothetical protein  54.61 
 
 
440 aa  413  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3726  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  54.61 
 
 
440 aa  413  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0512  general substrate transporter  52.64 
 
 
483 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.509539  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3827  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  54.84 
 
 
440 aa  414  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151355 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0851  general substrate transporter  50.99 
 
 
437 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.80283  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3928  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  54.84 
 
 
440 aa  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4011  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  54.38 
 
 
440 aa  411  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2736  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  53.12 
 
 
438 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3881  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  54.19 
 
 
440 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.148005  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3984  MFS transporter metabolite:H+ symporter family protein  54.41 
 
 
440 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.139706 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3925  MFS transporter/metabolite:H+ symporter family protein  54.41 
 
 
440 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3419  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  52.02 
 
 
435 aa  411  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3101  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  52.5 
 
 
438 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3803  MFS transporter metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  54.41 
 
 
440 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3816  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  54.41 
 
 
440 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4886  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  54.38 
 
 
440 aa  412  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0663  general substrate transporter  52.9 
 
 
435 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0269429  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1576  metabolite:proton symporter family protein  52.42 
 
 
506 aa  405  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342246  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2850  General substrate transporter  52.38 
 
 
437 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.290987  hitchhiker  0.00573587 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3059  metabolite:proton symporter family protein  52.19 
 
 
489 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2961  major facilitator superfamily permease  52.19 
 
 
437 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3026  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  52.19 
 
 
437 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0806  metabolite:proton symporter family protein  51.96 
 
 
523 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.413485  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2106  metabolite:proton symporter family protein  51.96 
 
 
437 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.22377  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1974  metabolite:proton symporter family protein  51.96 
 
 
437 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2638  metabolite:proton symporter family protein  51.96 
 
 
437 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2856  metabolite transport protein  51.95 
 
 
439 aa  393  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11030  Sugar (and other) transporter  51.1 
 
 
472 aa  394  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.267916  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0706  major facilitator family transporter  52.74 
 
 
426 aa  391  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1015  general substrate transporter  50.57 
 
 
438 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4973  major facilitator transporter  49.42 
 
 
425 aa  382  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3830  major facilitator transporter  51.55 
 
 
463 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2710  major facilitator superfamily MFS_1  50.35 
 
 
420 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2888  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  49.41 
 
 
434 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1332  major facilitator superfamily MFS_1  51.41 
 
 
433 aa  383  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.423362 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2487  major facilitator transporter  50.35 
 
 
420 aa  383  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15920  major facilitator transporter  51.49 
 
 
437 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.246808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2741  general substrate transporter  48.1 
 
 
431 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00467  metabolite transport protein  51.53 
 
 
412 aa  376  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1458  metabolite-proton symporter  50.58 
 
 
432 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.202966  normal  0.170493 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1278  citrate-proton symport  51.04 
 
 
456 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258621  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1063  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  50.58 
 
 
432 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2415  major facilitator superfamily MFS_1  50.46 
 
 
420 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4263  general substrate transporter  50.58 
 
 
433 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1469  major facilitator family transporter  50.58 
 
 
438 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0457955  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.65 
 
 
839 aa  368  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.834147 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2691  general substrate transporter  47.07 
 
 
445 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2238  major facilitator transporter  50.82 
 
 
442 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.451405  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0161  major facilitator transporter  46.34 
 
 
440 aa  367  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1369  MFS family transporter  51.73 
 
 
437 aa  364  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4161  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  49.42 
 
 
433 aa  360  4e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0662  major facilitator family transporter  47.97 
 
 
393 aa  334  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4279  major facilitator transporter  46.28 
 
 
426 aa  330  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.646646 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3744  General substrate transporter  43.33 
 
 
465 aa  322  6e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1510  major facilitator transporter  47.8 
 
 
425 aa  316  6e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  41.35 
 
 
437 aa  312  6.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1295  general substrate transporter  47.28 
 
 
423 aa  311  2e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659237  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  42.11 
 
 
442 aa  307  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11224  integral membrane transport protein  40.45 
 
 
425 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000679327  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  40.67 
 
 
439 aa  302  9e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  40.59 
 
 
461 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  41.02 
 
 
455 aa  302  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  40.59 
 
 
461 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  40.59 
 
 
461 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  42.3 
 
 
440 aa  298  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  38.92 
 
 
446 aa  297  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  39.43 
 
 
431 aa  296  4e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  41.33 
 
 
460 aa  294  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  43.24 
 
 
439 aa  291  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>