More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3540 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3240  major facilitator superfamily MFS_1  89.24 
 
 
466 aa  749    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3540  major facilitator transporter  100 
 
 
463 aa  911    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3577  major facilitator transporter  75.98 
 
 
453 aa  621  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4803  major facilitator superfamily MFS_1  68.99 
 
 
444 aa  555  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.543727 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4210  major facilitator superfamily MFS_1  65.7 
 
 
448 aa  533  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.199459  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0094  major facilitator transporter  65.99 
 
 
443 aa  530  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0176  major facilitator superfamily MFS_1  61.97 
 
 
449 aa  521  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3519  major facilitator superfamily MFS_1  62.88 
 
 
444 aa  501  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  52.96 
 
 
441 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  50.85 
 
 
435 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  50.85 
 
 
435 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  50.85 
 
 
435 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  51.35 
 
 
439 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  51.48 
 
 
439 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  51.11 
 
 
439 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  50.48 
 
 
435 aa  404  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  48.69 
 
 
442 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  52.58 
 
 
439 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  47.46 
 
 
440 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  46.59 
 
 
439 aa  361  1e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  46.97 
 
 
437 aa  362  1e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  43.87 
 
 
461 aa  349  7e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  43.87 
 
 
461 aa  349  7e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  43.87 
 
 
461 aa  349  7e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  47.2 
 
 
460 aa  347  3e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  43.09 
 
 
450 aa  343  4e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  41.42 
 
 
455 aa  342  5.999999999999999e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  42 
 
 
456 aa  342  8e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  47.75 
 
 
438 aa  335  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  40.45 
 
 
484 aa  333  4e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  42.76 
 
 
447 aa  333  5e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  41.18 
 
 
458 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  40.27 
 
 
460 aa  321  9.999999999999999e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  42.16 
 
 
443 aa  320  5e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  39.51 
 
 
459 aa  319  7.999999999999999e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2261  major facilitator superfamily MFS_1  43.55 
 
 
442 aa  319  9e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  40.14 
 
 
457 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  40.14 
 
 
457 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  40.04 
 
 
459 aa  317  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  40.14 
 
 
457 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  42.48 
 
 
430 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  43.14 
 
 
455 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  39.18 
 
 
459 aa  310  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7098  major facilitator transporter  44 
 
 
456 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  38.72 
 
 
459 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  44.92 
 
 
461 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07050  arabinose efflux permease family protein  38.59 
 
 
429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.267941 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6236  major facilitator transporter  43.76 
 
 
454 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  42.5 
 
 
468 aa  302  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  42.52 
 
 
465 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  37.98 
 
 
439 aa  298  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  40.66 
 
 
442 aa  298  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 
442 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  38.95 
 
 
442 aa  293  3e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  39.45 
 
 
436 aa  294  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  40 
 
 
441 aa  293  4e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  38.64 
 
 
450 aa  292  7e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3969  major facilitator transporter  40.8 
 
 
457 aa  292  8e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502064  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  39.29 
 
 
447 aa  291  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 
461 aa  292  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  39.12 
 
 
431 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5966  major facilitator transporter  43.43 
 
 
457 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  40.82 
 
 
430 aa  289  7e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3269  major facilitator superfamily MFS_1  40.55 
 
 
436 aa  288  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  39.85 
 
 
446 aa  287  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  39.42 
 
 
482 aa  286  4e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  39.09 
 
 
439 aa  286  5e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0644  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  39.66 
 
 
442 aa  285  9e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4745  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.06 
 
 
440 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6090  major facilitator transporter  43.08 
 
 
450 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  40.05 
 
 
441 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0860  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  38.7 
 
 
441 aa  283  5.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1110  major facilitator superfamily protein  38.84 
 
 
449 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  38.05 
 
 
463 aa  282  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  40.68 
 
 
437 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  40.38 
 
 
433 aa  281  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.61 
 
 
437 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  38.37 
 
 
439 aa  280  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  39.5 
 
 
433 aa  280  5e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  40.98 
 
 
437 aa  279  7e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  38.86 
 
 
439 aa  279  8e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  41.12 
 
 
434 aa  279  8e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  40.09 
 
 
437 aa  279  9e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  38.86 
 
 
439 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  39.63 
 
 
439 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2295  major facilitator superfamily MFS_1  37.36 
 
 
452 aa  278  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  39.63 
 
 
439 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  39.63 
 
 
439 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  39.37 
 
 
439 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  40.96 
 
 
427 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  37.98 
 
 
456 aa  276  6e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  40.54 
 
 
445 aa  276  7e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2850  General substrate transporter  39.59 
 
 
437 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.290987  hitchhiker  0.00573587 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  37.59 
 
 
437 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1044  major facilitator superfamily MFS_1  39.12 
 
 
443 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5243  major facilitator transporter  38.89 
 
 
439 aa  274  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  38.27 
 
 
452 aa  273  3e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4875  major facilitator transporter  38.89 
 
 
439 aa  274  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4964  major facilitator superfamily transporter  38.89 
 
 
439 aa  274  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  39.09 
 
 
443 aa  273  4.0000000000000004e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>